Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G376501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S9M3
Pfam PF01370
Panther DB PTHR10366 PTHR10366:SF465
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003824; catalytic activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G47650 : UDP-xylose synthase 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g21320.1 : NAD dependent epimerase/dehydratase family domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK14679
Barley HORVU2Hr1G019180.3 , HORVU2Hr1G019180.1 , HORVU2Hr1G019180.2
Wheat TraesCS2B02G129600 , TraesCS2B02G129600 , TraesCS2D02G111400 , TraesCS2D02G111400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G064800 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
2 Sobic.009G163400 growth regulator related protein, putative, expressed -
3 Sobic.008G141900 ZOS12-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
4 Sobic.001G257650 - -
5 Sobic.008G121501 - -
6 Sobic.005G212201 - -
7 Sobic.001G010500 frigida, putative, expressed -
8 Sobic.004G276000 - -
9 Sobic.003G275400 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
10 Sobic.003G009000 harpin-induced protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G206100 cytochrome P450, putative, expressed -
12 Sobic.002G309100 phosphate-induced protein 1 conserved region domain containing protein, expressed -
13 Sobic.009G168200 expressed protein -
14 Sobic.008G191700 - -
15 Sobic.009G081900 expressed protein -
16 Sobic.001G130600 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.006G109650 - -
18 Sobic.003G045450 - -
19 Sobic.010G062900 expressed protein -
20 Sobic.010G211200 ZOS6-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic001G376501--Sobic002G064800 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic001G376501--Sobic009G163400 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic001G376501--Sobic008G141900 Sobic001G257650 Sobic001G257650 Sobic001G376501--Sobic001G257650 Sobic008G121501 Sobic008G121501 Sobic001G376501--Sobic008G121501 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic001G376501--Sobic005G212201 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic001G376501--Sobic001G010500 Sobic004G276000 Sobic004G276000 Sobic001G376501--Sobic004G276000 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic001G376501--Sobic003G275400 Sobic002G064800--Sobic005G212201 Sobic002G064800--Sobic001G376501 Sobic008G191700 Sobic008G191700 Sobic002G064800--Sobic008G191700 Sobic005G206100 Sobic005G206100 Sobic002G064800--Sobic005G206100 Sobic002G064800--Sobic004G276000 Sobic002G064800--Sobic008G141900 Sobic002G064800--Sobic009G163400 Sobic010G211200 Sobic010G211200 Sobic002G064800--Sobic010G211200 Sobic002G064800--Sobic003G275400 Sobic009G163400--Sobic001G376501 Sobic009G163400--Sobic008G141900 Sobic009G163400--Sobic001G010500 Sobic009G163400--Sobic008G121501 Sobic002G309100 Sobic002G309100 Sobic009G163400--Sobic002G309100 Sobic009G163400--Sobic002G064800 Sobic009G163400--Sobic001G257650 Sobic009G163400--Sobic003G275400 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic009G163400--Sobic009G168200 Sobic008G141900--Sobic009G163400 Sobic008G141900--Sobic001G376501 Sobic008G141900--Sobic002G064800 Sobic008G141900--Sobic005G212201 Sobic008G141900--Sobic009G168200 Sobic008G141900--Sobic004G276000 Sobic008G141900--Sobic001G010500 Sobic008G141900--Sobic003G275400 Sobic008G141900--Sobic001G257650 Sobic003G009000 Sobic003G009000 Sobic001G257650--Sobic003G009000 Sobic001G257650--Sobic001G376501 Sobic001G257650--Sobic002G309100 Sobic001G257650--Sobic009G163400 Sobic001G257650--Sobic008G121501 Sobic001G257650--Sobic001G010500 Sobic001G257650--Sobic002G064800 Sobic002G339666 Sobic002G339666 Sobic001G257650--Sobic002G339666 Sobic009G098700 Sobic009G098700 Sobic001G257650--Sobic009G098700 Sobic008G121501--Sobic001G376501 Sobic008G121501--Sobic009G163400 Sobic008G121501--Sobic003G009000 Sobic008G121501--Sobic001G257650 Sobic008G121501--Sobic002G309100 Sobic008G121501--Sobic001G010500 Sobic001G130600 Sobic001G130600 Sobic008G121501--Sobic001G130600 Sobic008G121501--Sobic009G098700 Sobic001G485700 Sobic001G485700 Sobic008G121501--Sobic001G485700 Sobic005G212201--Sobic002G064800 Sobic005G212201--Sobic008G191700 Sobic005G212201--Sobic001G376501 Sobic005G212201--Sobic005G206100 Sobic005G212201--Sobic010G211200 Sobic005G212201--Sobic008G141900 Sobic005G212201--Sobic004G276000 Sobic009G241900 Sobic009G241900 Sobic005G212201--Sobic009G241900 Sobic004G222150 Sobic004G222150 Sobic005G212201--Sobic004G222150 Sobic001G010500--Sobic009G163400 Sobic001G010500--Sobic002G309100 Sobic001G010500--Sobic001G376501 Sobic001G010500--Sobic008G141900 Sobic001G010500--Sobic001G257650 Sobic001G010500--Sobic003G009000 Sobic001G010500--Sobic001G130600 Sobic001G010500--Sobic008G121501 Sobic003G005500 Sobic003G005500 Sobic001G010500--Sobic003G005500 Sobic004G276000--Sobic002G064800 Sobic004G276000--Sobic005G212201 Sobic004G276000--Sobic001G376501 Sobic004G276000--Sobic008G141900 Sobic004G276000--Sobic009G163400 Sobic004G276000--Sobic008G191700 Sobic004G276000--Sobic005G206100 Sobic004G276000--Sobic004G222150 Sobic004G276000--Sobic010G211200 Sobic003G275400--Sobic009G168200 Sobic003G275400--Sobic009G163400 Sobic003G275400--Sobic001G376501 Sobic003G275400--Sobic002G064800 Sobic003G275400--Sobic008G141900 Sobic003G275400--Sobic008G191700 Sobic003G275400--Sobic008G121501 Sobic001G485500 Sobic001G485500 Sobic003G275400--Sobic001G485500 Sobic003G275400--Sobic005G206100
Octagon: transcription factors


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