Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G081900.1
Synonym Sb09g007187
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P7A2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g19820.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037568
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G121501 - -
2 Sobic.001G257650 - -
3 Sobic.001G376501 - -
4 Sobic.002G330100 formin-like protein 3 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.005G206100 cytochrome P450, putative, expressed -
6 Sobic.002G064800 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
7 Sobic.009G163400 growth regulator related protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G165401 - -
9 Sobic.003G009000 harpin-induced protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G010500 frigida, putative, expressed -
11 Sobic.005G212201 - -
12 Sobic.002G199850 - -
13 Sobic.008G141900 ZOS12-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
14 Sobic.002G309100 phosphate-induced protein 1 conserved region domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G275400 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G276000 - -
17 Sobic.009G168200 expressed protein -
18 Sobic.001G130600 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G098700 basic helix-loop-helix domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G339666 - K04718: sphingosine kinase


Gene co-expression network
sample Sobic009G081900 Sobic009G081900 Sobic008G121501 Sobic008G121501 Sobic009G081900--Sobic008G121501 Sobic001G257650 Sobic001G257650 Sobic009G081900--Sobic001G257650 Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic009G081900--Sobic001G376501 Sobic002G330100 Sobic002G330100 Sobic009G081900--Sobic002G330100 Sobic005G206100 Sobic005G206100 Sobic009G081900--Sobic005G206100 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic009G081900--Sobic002G064800 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic009G081900--Sobic009G163400 Sobic001G165401 Sobic001G165401 Sobic009G081900--Sobic001G165401 Sobic003G009000 Sobic003G009000 Sobic009G081900--Sobic003G009000 Sobic008G121501--Sobic001G376501 Sobic008G121501--Sobic009G163400 Sobic008G121501--Sobic003G009000 Sobic008G121501--Sobic001G257650 Sobic002G309100 Sobic002G309100 Sobic008G121501--Sobic002G309100 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic008G121501--Sobic001G010500 Sobic001G130600 Sobic001G130600 Sobic008G121501--Sobic001G130600 Sobic009G098700 Sobic009G098700 Sobic008G121501--Sobic009G098700 Sobic001G485700 Sobic001G485700 Sobic008G121501--Sobic001G485700 Sobic001G257650--Sobic003G009000 Sobic001G257650--Sobic001G376501 Sobic001G257650--Sobic002G309100 Sobic001G257650--Sobic009G163400 Sobic001G257650--Sobic008G121501 Sobic001G257650--Sobic001G010500 Sobic001G257650--Sobic002G064800 Sobic002G339666 Sobic002G339666 Sobic001G257650--Sobic002G339666 Sobic001G257650--Sobic009G098700 Sobic001G376501--Sobic002G064800 Sobic001G376501--Sobic009G163400 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic001G376501--Sobic008G141900 Sobic001G376501--Sobic001G257650 Sobic001G376501--Sobic008G121501 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic001G376501--Sobic005G212201 Sobic001G376501--Sobic001G010500 Sobic004G276000 Sobic004G276000 Sobic001G376501--Sobic004G276000 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic001G376501--Sobic003G275400 Sobic002G330100--Sobic001G257650 Sobic002G330100--Sobic009G081900 Sobic002G330100--Sobic003G009000 Sobic002G330100--Sobic001G010500 Sobic002G199800 Sobic002G199800 Sobic002G330100--Sobic002G199800 Sobic002G330100--Sobic002G339666 Sobic003G407700 Sobic003G407700 Sobic002G330100--Sobic003G407700 Sobic002G330100--Sobic008G121501 Sobic004G349600 Sobic004G349600 Sobic002G330100--Sobic004G349600 Sobic008G191700 Sobic008G191700 Sobic005G206100--Sobic008G191700 Sobic005G206100--Sobic002G064800 Sobic009G241900 Sobic009G241900 Sobic005G206100--Sobic009G241900 Sobic005G206100--Sobic005G212201 Sobic005G206100--Sobic001G376501 Sobic010G211200 Sobic010G211200 Sobic005G206100--Sobic010G211200 Sobic003G427000 Sobic003G427000 Sobic005G206100--Sobic003G427000 Sobic005G206100--Sobic004G276000 Sobic005G206100--Sobic003G275400 Sobic002G064800--Sobic005G212201 Sobic002G064800--Sobic001G376501 Sobic002G064800--Sobic008G191700 Sobic002G064800--Sobic005G206100 Sobic002G064800--Sobic004G276000 Sobic002G064800--Sobic008G141900 Sobic002G064800--Sobic009G163400 Sobic002G064800--Sobic010G211200 Sobic002G064800--Sobic003G275400 Sobic009G163400--Sobic001G376501 Sobic009G163400--Sobic008G141900 Sobic009G163400--Sobic001G010500 Sobic009G163400--Sobic008G121501 Sobic009G163400--Sobic002G309100 Sobic009G163400--Sobic002G064800 Sobic009G163400--Sobic001G257650 Sobic009G163400--Sobic003G275400 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic009G163400--Sobic009G168200 Sobic002G017100 Sobic002G017100 Sobic001G165401--Sobic002G017100 Sobic002G199850 Sobic002G199850 Sobic001G165401--Sobic002G199850 Sobic001G165401--Sobic009G081900 Sobic003G344400 Sobic003G344400 Sobic001G165401--Sobic003G344400 Sobic005G125200 Sobic005G125200 Sobic001G165401--Sobic005G125200 Sobic004G071700 Sobic004G071700 Sobic001G165401--Sobic004G071700 Sobic003G256300 Sobic003G256300 Sobic001G165401--Sobic003G256300 Sobic006G099200 Sobic006G099200 Sobic001G165401--Sobic006G099200 Sobic010G032200 Sobic010G032200 Sobic001G165401--Sobic010G032200 Sobic003G009000--Sobic009G098700 Sobic006G239500 Sobic006G239500 Sobic003G009000--Sobic006G239500 Sobic003G009000--Sobic002G199800 Sobic001G183666 Sobic001G183666 Sobic003G009000--Sobic001G183666 Sobic003G009000--Sobic004G349600 Sobic003G009000--Sobic003G407700 Sobic010G073900 Sobic010G073900 Sobic003G009000--Sobic010G073900 Sobic003G009000--Sobic001G257650 Sobic003G009000--Sobic001G485700
Octagon: transcription factors


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