Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G165401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S6A2
Pfam PF02362
Panther DB PTHR31391 PTHR31391:SF23
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G33280 : AP2/B3-like transcriptional factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g42410.1 : B3 DNA binding domain containing protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007394 , Zm00025a007395 , Zm00025a017297
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G017100 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
2 Sobic.002G199850 - -
3 Sobic.009G081900 expressed protein -
4 Sobic.003G344400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G125200 OsFBX313 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G071700 expressed protein -
7 Sobic.003G256300 transcription factor Dp, putative, expressed -
8 Sobic.006G099200 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
9 Sobic.010G032200 expressed protein -
10 Sobic.009G044200 C2 domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G027250 - -
12 Sobic.001G160900 signal recognition particle 54 kDa protein, putative, expressed K03106: SRP54, signal recognition particle subunit SRP54
13 Sobic.003G411500 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@transcription factor, putative, expressed -
14 Sobic.008G121501 - -
15 Sobic.002G330100 formin-like protein 3 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.010G215400 expressed protein -
17 Sobic.004G338900 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.007G204800 receptor-like protein kinase 1, putative, expressed -
19 Sobic.010G015100 expressed protein -
20 Sobic.005G072850 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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