Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G125200.1
Synonym Sb05g018570
Functional annotation OsFBX313 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RIC6
Pfam -
Panther DB PTHR33207 PTHR33207:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g15550.1 : OsFBX313 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G160900 signal recognition particle 54 kDa protein, putative, expressed K03106: SRP54, signal recognition particle subunit SRP54
2 Sobic.004G338900 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G160200 expressed protein -
4 Sobic.009G044200 C2 domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.006G099200 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
6 Sobic.003G193600 expressed protein -
7 Sobic.005G027250 - -
8 Sobic.007G204800 receptor-like protein kinase 1, putative, expressed -
9 Sobic.008G129800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G102600 - -
11 Sobic.003G192200 transporter family protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G083100 cadmium/zinc-transporting ATPase, putative, expressed K01534: Zn2+/Cd2+-exporting ATPase
13 Sobic.005G098100 - -
14 Sobic.002G213100 zinc finger, C3HC4 type family protein, expressed -
15 Sobic.003G322000 tyrosine protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G131300 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
17 Sobic.005G001200 - -
18 Sobic.003G131900 expressed protein -
19 Sobic.002G122500 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G400700 CAMK_CAMK_like.39 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase


Gene co-expression network
sample Sobic005G125200 Sobic005G125200 Sobic001G160900 Sobic001G160900 Sobic005G125200--Sobic001G160900 Sobic004G338900 Sobic004G338900 Sobic005G125200--Sobic004G338900 Sobic002G160200 Sobic002G160200 Sobic005G125200--Sobic002G160200 Sobic009G044200 Sobic009G044200 Sobic005G125200--Sobic009G044200 Sobic006G099200 Sobic006G099200 Sobic005G125200--Sobic006G099200 Sobic003G193600 Sobic003G193600 Sobic005G125200--Sobic003G193600 Sobic005G027250 Sobic005G027250 Sobic005G125200--Sobic005G027250 Sobic007G204800 Sobic007G204800 Sobic005G125200--Sobic007G204800 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic005G125200--Sobic008G129800 Sobic001G160900--Sobic007G204800 Sobic001G160900--Sobic002G160200 Sobic001G160900--Sobic004G338900 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic001G160900--Sobic002G102600 Sobic001G160900--Sobic005G125200 Sobic001G160900--Sobic006G099200 Sobic003G192200 Sobic003G192200 Sobic001G160900--Sobic003G192200 Sobic001G120800 Sobic001G120800 Sobic001G160900--Sobic001G120800 Sobic010G257900 Sobic010G257900 Sobic001G160900--Sobic010G257900 Sobic004G338900--Sobic002G160200 Sobic004G338900--Sobic007G204800 Sobic004G338900--Sobic001G160900 Sobic004G338900--Sobic006G099200 Sobic002G083100 Sobic002G083100 Sobic004G338900--Sobic002G083100 Sobic004G338900--Sobic002G102600 Sobic004G338900--Sobic005G027250 Sobic005G001200 Sobic005G001200 Sobic004G338900--Sobic005G001200 Sobic003G287800 Sobic003G287800 Sobic004G338900--Sobic003G287800 Sobic002G160200--Sobic002G102600 Sobic002G160200--Sobic007G204800 Sobic002G160200--Sobic004G338900 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic002G160200--Sobic005G098100 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic002G160200--Sobic003G400700 Sobic002G160200--Sobic001G160900 Sobic002G160200--Sobic005G001200 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic002G160200--Sobic006G037100 Sobic002G160200--Sobic008G129800 Sobic009G044200--Sobic005G027250 Sobic009G044200--Sobic006G099200 Sobic009G044200--Sobic004G338900 Sobic009G044200--Sobic005G125200 Sobic009G044200--Sobic002G160200 Sobic009G044200--Sobic007G204800 Sobic009G044200--Sobic001G160900 Sobic009G044200--Sobic002G083100 Sobic010G032200 Sobic010G032200 Sobic009G044200--Sobic010G032200 Sobic006G099200--Sobic005G027250 Sobic006G099200--Sobic007G204800 Sobic006G099200--Sobic004G338900 Sobic006G099200--Sobic009G044200 Sobic006G099200--Sobic001G160900 Sobic006G099200--Sobic010G032200 Sobic006G099200--Sobic002G160200 Sobic006G099200--Sobic002G083100 Sobic006G099200--Sobic001G120800 Sobic007G051200 Sobic007G051200 Sobic003G193600--Sobic007G051200 Sobic003G193600--Sobic008G129800 Sobic004G079600 Sobic004G079600 Sobic003G193600--Sobic004G079600 Sobic002G122500 Sobic002G122500 Sobic003G193600--Sobic002G122500 Sobic006G251100 Sobic006G251100 Sobic003G193600--Sobic006G251100 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic003G193600--Sobic002G305800 Sobic004G163900 Sobic004G163900 Sobic003G193600--Sobic004G163900 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic003G193600--Sobic008G080700 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic003G193600--Sobic008G131300 Sobic005G027250--Sobic006G099200 Sobic005G027250--Sobic009G044200 Sobic005G027250--Sobic004G338900 Sobic005G027250--Sobic007G204800 Sobic005G027250--Sobic002G160200 Sobic005G027250--Sobic001G160900 Sobic005G027250--Sobic002G083100 Sobic005G027250--Sobic010G032200 Sobic005G027250--Sobic005G125200 Sobic007G204800--Sobic002G160200 Sobic007G204800--Sobic004G338900 Sobic007G204800--Sobic006G099200 Sobic007G204800--Sobic001G160900 Sobic007G204800--Sobic001G120800 Sobic007G204800--Sobic002G102600 Sobic007G204800--Sobic010G257900 Sobic007G204800--Sobic005G027250 Sobic007G204800--Sobic002G083100 Sobic008G129800--Sobic002G122500 Sobic008G129800--Sobic004G163900 Sobic003G322000 Sobic003G322000 Sobic008G129800--Sobic003G322000 Sobic008G129800--Sobic008G131300 Sobic008G129800--Sobic002G305800 Sobic008G129800--Sobic008G080700 Sobic008G129800--Sobic006G037100 Sobic008G129800--Sobic003G193600 Sobic008G129800--Sobic007G051200
Octagon: transcription factors


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