Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G193600.1
Synonym Sb03g025710
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q4B2
Pfam -
Panther DB PTHR36801 PTHR36801:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g38960.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038376
Brachypodium KQK08361
Barley HORVU3Hr1G049520.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G051200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K00968: choline-phosphate cytidylyltransferase
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10 Sobic.005G054501 - -
11 Sobic.003G322000 tyrosine protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G166001 - -
13 Sobic.006G037100 expressed protein -
14 Sobic.004G080600 protein with a conserved N-terminal region, putative, expressed -
15 Sobic.002G236800 - -
16 Sobic.003G400700 CAMK_CAMK_like.39 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
17 Sobic.003G226400 similar to Late embryogenesis-abundant protein Lea14-A-like(PubMedID : 29862293)@late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
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19 Sobic.004G078750 - -
20 Sobic.001G433500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G193600 Sobic003G193600 Sobic007G051200 Sobic007G051200 Sobic003G193600--Sobic007G051200 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic003G193600--Sobic008G129800 Sobic004G079600 Sobic004G079600 Sobic003G193600--Sobic004G079600 Sobic002G122500 Sobic002G122500 Sobic003G193600--Sobic002G122500 Sobic006G251100 Sobic006G251100 Sobic003G193600--Sobic006G251100 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic003G193600--Sobic002G305800 Sobic004G163900 Sobic004G163900 Sobic003G193600--Sobic004G163900 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic003G193600--Sobic008G080700 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic003G193600--Sobic008G131300 Sobic007G051200--Sobic006G251100 Sobic007G051200--Sobic002G305800 Sobic007G051200--Sobic008G080700 Sobic002G236800 Sobic002G236800 Sobic007G051200--Sobic002G236800 Sobic004G080600 Sobic004G080600 Sobic007G051200--Sobic004G080600 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic007G051200--Sobic003G226400 Sobic004G078750 Sobic004G078750 Sobic007G051200--Sobic004G078750 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic007G051200--Sobic002G100766 Sobic007G051200--Sobic002G122500 Sobic008G129800--Sobic002G122500 Sobic008G129800--Sobic004G163900 Sobic003G322000 Sobic003G322000 Sobic008G129800--Sobic003G322000 Sobic008G129800--Sobic008G131300 Sobic008G129800--Sobic002G305800 Sobic008G129800--Sobic008G080700 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic008G129800--Sobic006G037100 Sobic008G129800--Sobic003G193600 Sobic008G129800--Sobic007G051200 Sobic003G166001 Sobic003G166001 Sobic004G079600--Sobic003G166001 Sobic004G079600--Sobic007G051200 Sobic004G079600--Sobic003G193600 Sobic004G079600--Sobic008G080700 Sobic006G098900 Sobic006G098900 Sobic004G079600--Sobic006G098900 Sobic004G079600--Sobic006G251100 Sobic004G079600--Sobic002G305800 Sobic004G079600--Sobic006G037100 Sobic004G079600--Sobic004G080600 Sobic002G122500--Sobic004G163900 Sobic002G122500--Sobic003G322000 Sobic002G122500--Sobic008G129800 Sobic002G122500--Sobic002G305800 Sobic002G122500--Sobic008G080700 Sobic002G122500--Sobic008G131300 Sobic002G122500--Sobic006G037100 Sobic002G122500--Sobic004G080600 Sobic002G122500--Sobic007G051200 Sobic006G251100--Sobic007G051200 Sobic006G251100--Sobic002G305800 Sobic006G251100--Sobic002G236800 Sobic006G251100--Sobic003G226400 Sobic006G251100--Sobic004G078750 Sobic006G251100--Sobic004G080600 Sobic006G251100--Sobic002G100766 Sobic006G251100--Sobic008G080700 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic006G251100--Sobic003G379100 Sobic002G305800--Sobic008G080700 Sobic002G305800--Sobic002G122500 Sobic002G305800--Sobic004G080600 Sobic002G305800--Sobic006G251100 Sobic002G305800--Sobic004G163900 Sobic002G305800--Sobic007G051200 Sobic002G305800--Sobic002G236800 Sobic002G305800--Sobic008G131300 Sobic002G305800--Sobic003G166001 Sobic004G163900--Sobic002G122500 Sobic004G163900--Sobic003G322000 Sobic004G163900--Sobic008G129800 Sobic004G163900--Sobic002G305800 Sobic004G163900--Sobic008G080700 Sobic004G163900--Sobic008G131300 Sobic004G163900--Sobic006G037100 Sobic004G163900--Sobic007G051200 Sobic004G163900--Sobic004G080600 Sobic008G080700--Sobic002G305800 Sobic008G080700--Sobic003G166001 Sobic008G080700--Sobic006G037100 Sobic008G080700--Sobic002G122500 Sobic008G080700--Sobic004G080600 Sobic008G080700--Sobic008G131300 Sobic008G080700--Sobic004G163900 Sobic008G080700--Sobic006G098900 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic008G080700--Sobic003G400700 Sobic008G131300--Sobic002G122500 Sobic008G131300--Sobic008G080700 Sobic008G131300--Sobic006G037100 Sobic008G131300--Sobic008G129800 Sobic008G131300--Sobic002G305800 Sobic008G131300--Sobic004G163900 Sobic008G131300--Sobic003G166001 Sobic008G131300--Sobic003G400700 Sobic008G131300--Sobic003G322000
Octagon: transcription factors


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