Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G051200.1
Synonym CCT2, ATCCT2, Sb07g004150
Functional annotation cytidylyltransferase domain containing protein, expressed
UniProt C5YHE2
Pfam PF01467
Panther DB PTHR10739 PTHR10739:SF28
NCBI CDD KOG2804; Phosphorylcholine transferase/cholinephosphate cytidylyltransferase
KEGG Orthology K00968; choline-phosphate cytidylyltransferase
Gene Ontology GO:0009058; biosynthetic process GO:0003824catalytic activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G15130 : phosphorylcholine cytidylyltransferase2
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g06450.1 : cytidylyltransferase domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055106 , Zm00025a030050
Brachypodium KQJ95287
Barley HORVU7Hr1G070180.2 , HORVU7Hr1G070180.1
Wheat TraesCS7A02G298100 , TraesCS7A02G298100
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic007G051200 Sobic007G051200 Sobic006G251100 Sobic006G251100 Sobic007G051200--Sobic006G251100 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic007G051200--Sobic002G305800 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic007G051200--Sobic008G080700 Sobic002G236800 Sobic002G236800 Sobic007G051200--Sobic002G236800 Sobic004G080600 Sobic004G080600 Sobic007G051200--Sobic004G080600 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic007G051200--Sobic003G226400 Sobic004G078750 Sobic004G078750 Sobic007G051200--Sobic004G078750 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic007G051200--Sobic002G100766 Sobic002G122500 Sobic002G122500 Sobic007G051200--Sobic002G122500 Sobic006G251100--Sobic007G051200 Sobic006G251100--Sobic002G305800 Sobic006G251100--Sobic002G236800 Sobic006G251100--Sobic003G226400 Sobic006G251100--Sobic004G078750 Sobic006G251100--Sobic004G080600 Sobic006G251100--Sobic002G100766 Sobic006G251100--Sobic008G080700 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic006G251100--Sobic003G379100 Sobic002G305800--Sobic008G080700 Sobic002G305800--Sobic002G122500 Sobic002G305800--Sobic004G080600 Sobic002G305800--Sobic006G251100 Sobic004G163900 Sobic004G163900 Sobic002G305800--Sobic004G163900 Sobic002G305800--Sobic007G051200 Sobic002G305800--Sobic002G236800 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic002G305800--Sobic008G131300 Sobic003G166001 Sobic003G166001 Sobic002G305800--Sobic003G166001 Sobic008G080700--Sobic002G305800 Sobic008G080700--Sobic003G166001 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic008G080700--Sobic006G037100 Sobic008G080700--Sobic002G122500 Sobic008G080700--Sobic004G080600 Sobic008G080700--Sobic008G131300 Sobic008G080700--Sobic004G163900 Sobic006G098900 Sobic006G098900 Sobic008G080700--Sobic006G098900 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic008G080700--Sobic003G400700 Sobic002G236800--Sobic004G078750 Sobic002G236800--Sobic002G100766 Sobic002G236800--Sobic003G226400 Sobic002G236800--Sobic003G379100 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic002G236800--Sobic001G249100 Sobic008G190300 Sobic008G190300 Sobic002G236800--Sobic008G190300 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic002G236800--Sobic009G089800 Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic002G236800--Sobic002G006700 Sobic002G236800--Sobic006G251100 Sobic004G080600--Sobic002G305800 Sobic004G080600--Sobic008G080700 Sobic004G080600--Sobic006G251100 Sobic004G080600--Sobic002G236800 Sobic004G080600--Sobic003G226400 Sobic004G080600--Sobic004G078750 Sobic004G080600--Sobic007G051200 Sobic004G080600--Sobic002G100766 Sobic004G080600--Sobic002G122500 Sobic003G226400--Sobic004G078750 Sobic003G226400--Sobic002G100766 Sobic003G226400--Sobic002G236800 Sobic003G226400--Sobic003G379100 Sobic003G226400--Sobic008G190300 Sobic003G226400--Sobic009G089800 Sobic003G226400--Sobic001G249100 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic003G226400--Sobic002G165900 Sobic003G226400--Sobic002G006700 Sobic004G078750--Sobic002G100766 Sobic004G078750--Sobic003G226400 Sobic004G078750--Sobic002G236800 Sobic004G078750--Sobic008G190300 Sobic004G078750--Sobic003G379100 Sobic004G078750--Sobic009G089800 Sobic004G078750--Sobic001G249100 Sobic004G078750--Sobic002G165900 Sobic004G078750--Sobic002G006700 Sobic002G100766--Sobic004G078750 Sobic002G100766--Sobic003G226400 Sobic002G100766--Sobic008G190300 Sobic002G100766--Sobic002G236800 Sobic002G100766--Sobic003G379100 Sobic002G100766--Sobic009G089800 Sobic002G100766--Sobic001G249100 Sobic002G100766--Sobic002G165900 Sobic002G100766--Sobic002G006700 Sobic002G122500--Sobic004G163900 Sobic003G322000 Sobic003G322000 Sobic002G122500--Sobic003G322000 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic002G122500--Sobic008G129800 Sobic002G122500--Sobic002G305800 Sobic002G122500--Sobic008G080700 Sobic002G122500--Sobic008G131300 Sobic002G122500--Sobic006G037100 Sobic002G122500--Sobic004G080600 Sobic002G122500--Sobic007G051200
Octagon: transcription factors


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