Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G089800.3,Sobic.009G089800.2,Sobic.009G089800.1
Synonym Sb09g008640, RTNLB1, BTI1
Functional annotation reticulon domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6P7I8
Pfam PF02453
Panther DB PTHR10994 PTHR10994:SF82
NCBI CDD KOG1792; Reticulon
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G23630 : VIRB2-interacting protein 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g24770.1 : reticulon domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043282 , Zm00025a037600
Brachypodium KQK06901
Barley -
Wheat TraesCS1A02G081500 , TraesCS1B02G099200 , TraesCS1D02G083100 , TraesCS1D02G083100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic008G190300 Sobic008G190300 Sobic009G089800--Sobic008G190300 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic009G089800--Sobic003G379100 Sobic004G011800 Sobic004G011800 Sobic009G089800--Sobic004G011800 Sobic002G210700 Sobic002G210700 Sobic009G089800--Sobic002G210700 Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic009G089800--Sobic002G006700 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic009G089800--Sobic001G249100 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic009G089800--Sobic002G165900 Sobic005G213000 Sobic005G213000 Sobic009G089800--Sobic005G213000 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic009G089800--Sobic002G100766 Sobic008G190300--Sobic009G089800 Sobic008G190300--Sobic003G379100 Sobic008G190300--Sobic004G011800 Sobic008G190300--Sobic001G249100 Sobic008G190300--Sobic002G210700 Sobic008G190300--Sobic002G100766 Sobic008G190300--Sobic002G006700 Sobic004G078750 Sobic004G078750 Sobic008G190300--Sobic004G078750 Sobic008G190300--Sobic005G213000 Sobic003G379100--Sobic009G089800 Sobic003G379100--Sobic008G190300 Sobic003G379100--Sobic002G100766 Sobic003G379100--Sobic004G078750 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic003G379100--Sobic003G226400 Sobic003G379100--Sobic002G165900 Sobic003G379100--Sobic001G249100 Sobic003G379100--Sobic002G006700 Sobic003G379100--Sobic004G011800 Sobic004G011800--Sobic002G006700 Sobic004G011800--Sobic002G210700 Sobic004G011800--Sobic005G213000 Sobic004G011800--Sobic008G190300 Sobic004G011800--Sobic009G089800 Sobic004G011800--Sobic001G249100 Sobic004G011800--Sobic003G379100 Sobic005G212900 Sobic005G212900 Sobic004G011800--Sobic005G212900 Sobic002G121800 Sobic002G121800 Sobic004G011800--Sobic002G121800 Sobic002G210700--Sobic002G006700 Sobic002G210700--Sobic004G011800 Sobic002G210700--Sobic005G213000 Sobic002G210700--Sobic008G190300 Sobic002G210700--Sobic009G089800 Sobic002G210700--Sobic001G249100 Sobic002G210700--Sobic005G212900 Sobic002G210700--Sobic003G379100 Sobic002G210700--Sobic002G121800 Sobic002G006700--Sobic002G210700 Sobic002G006700--Sobic004G011800 Sobic002G006700--Sobic001G249100 Sobic002G006700--Sobic008G190300 Sobic002G006700--Sobic009G089800 Sobic002G006700--Sobic005G213000 Sobic002G006700--Sobic005G212900 Sobic002G006700--Sobic003G379100 Sobic009G133000 Sobic009G133000 Sobic002G006700--Sobic009G133000 Sobic001G249100--Sobic002G006700 Sobic001G249100--Sobic008G190300 Sobic001G249100--Sobic004G011800 Sobic001G249100--Sobic009G089800 Sobic001G249100--Sobic002G210700 Sobic001G249100--Sobic003G379100 Sobic001G249100--Sobic002G100766 Sobic001G249100--Sobic004G078750 Sobic001G249100--Sobic005G213000 Sobic002G165900--Sobic009G089800 Sobic002G165900--Sobic003G379100 Sobic002G165900--Sobic008G190300 Sobic002G165900--Sobic003G226400 Sobic002G165900--Sobic002G100766 Sobic002G165900--Sobic004G078750 Sobic002G165900--Sobic002G210700 Sobic002G165900--Sobic002G006700 Sobic002G165900--Sobic001G249100 Sobic005G213000--Sobic002G210700 Sobic005G213000--Sobic004G011800 Sobic005G213000--Sobic002G006700 Sobic005G213000--Sobic002G121800 Sobic005G213000--Sobic009G089800 Sobic005G213000--Sobic008G190300 Sobic005G213000--Sobic001G249100 Sobic005G213000--Sobic003G379100 Sobic010G257700 Sobic010G257700 Sobic005G213000--Sobic010G257700 Sobic002G100766--Sobic004G078750 Sobic002G100766--Sobic003G226400 Sobic002G100766--Sobic008G190300 Sobic002G236800 Sobic002G236800 Sobic002G100766--Sobic002G236800 Sobic002G100766--Sobic003G379100 Sobic002G100766--Sobic009G089800 Sobic002G100766--Sobic001G249100 Sobic002G100766--Sobic002G165900 Sobic002G100766--Sobic002G006700
Octagon: transcription factors


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