Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G011800.1
Synonym YSL7
Functional annotation -
UniProt A0A194YM55
Pfam PF03169
Panther DB PTHR31645 PTHR31645:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G65730 : YELLOW STRIPE like 7
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g02450.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035063
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G011800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G006700 expressed protein -
2 Sobic.002G210700 pectinesterase, putative, expressed -
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16 Sobic.002G236800 - -
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18 Sobic.004G359900 expressed protein -
19 Sobic.002G007900 - -
20 Sobic.010G140700 peroxidase precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G011800 Sobic004G011800 Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic004G011800--Sobic002G006700 Sobic002G210700 Sobic002G210700 Sobic004G011800--Sobic002G210700 Sobic005G213000 Sobic005G213000 Sobic004G011800--Sobic005G213000 Sobic008G190300 Sobic008G190300 Sobic004G011800--Sobic008G190300 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic004G011800--Sobic009G089800 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic004G011800--Sobic001G249100 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic004G011800--Sobic003G379100 Sobic005G212900 Sobic005G212900 Sobic004G011800--Sobic005G212900 Sobic002G121800 Sobic002G121800 Sobic004G011800--Sobic002G121800 Sobic002G006700--Sobic002G210700 Sobic002G006700--Sobic004G011800 Sobic002G006700--Sobic001G249100 Sobic002G006700--Sobic008G190300 Sobic002G006700--Sobic009G089800 Sobic002G006700--Sobic005G213000 Sobic002G006700--Sobic005G212900 Sobic002G006700--Sobic003G379100 Sobic009G133000 Sobic009G133000 Sobic002G006700--Sobic009G133000 Sobic002G210700--Sobic002G006700 Sobic002G210700--Sobic004G011800 Sobic002G210700--Sobic005G213000 Sobic002G210700--Sobic008G190300 Sobic002G210700--Sobic009G089800 Sobic002G210700--Sobic001G249100 Sobic002G210700--Sobic005G212900 Sobic002G210700--Sobic003G379100 Sobic002G210700--Sobic002G121800 Sobic005G213000--Sobic002G210700 Sobic005G213000--Sobic004G011800 Sobic005G213000--Sobic002G006700 Sobic005G213000--Sobic002G121800 Sobic005G213000--Sobic009G089800 Sobic005G213000--Sobic008G190300 Sobic005G213000--Sobic001G249100 Sobic005G213000--Sobic003G379100 Sobic010G257700 Sobic010G257700 Sobic005G213000--Sobic010G257700 Sobic008G190300--Sobic009G089800 Sobic008G190300--Sobic003G379100 Sobic008G190300--Sobic004G011800 Sobic008G190300--Sobic001G249100 Sobic008G190300--Sobic002G210700 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic008G190300--Sobic002G100766 Sobic008G190300--Sobic002G006700 Sobic004G078750 Sobic004G078750 Sobic008G190300--Sobic004G078750 Sobic008G190300--Sobic005G213000 Sobic009G089800--Sobic008G190300 Sobic009G089800--Sobic003G379100 Sobic009G089800--Sobic004G011800 Sobic009G089800--Sobic002G210700 Sobic009G089800--Sobic002G006700 Sobic009G089800--Sobic001G249100 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic009G089800--Sobic002G165900 Sobic009G089800--Sobic005G213000 Sobic009G089800--Sobic002G100766 Sobic001G249100--Sobic002G006700 Sobic001G249100--Sobic008G190300 Sobic001G249100--Sobic004G011800 Sobic001G249100--Sobic009G089800 Sobic001G249100--Sobic002G210700 Sobic001G249100--Sobic003G379100 Sobic001G249100--Sobic002G100766 Sobic001G249100--Sobic004G078750 Sobic001G249100--Sobic005G213000 Sobic003G379100--Sobic009G089800 Sobic003G379100--Sobic008G190300 Sobic003G379100--Sobic002G100766 Sobic003G379100--Sobic004G078750 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic003G379100--Sobic003G226400 Sobic003G379100--Sobic002G165900 Sobic003G379100--Sobic001G249100 Sobic003G379100--Sobic002G006700 Sobic003G379100--Sobic004G011800 Sobic005G212900--Sobic002G006700 Sobic005G212900--Sobic002G210700 Sobic002G237100 Sobic002G237100 Sobic005G212900--Sobic002G237100 Sobic005G212900--Sobic004G011800 Sobic010G140700 Sobic010G140700 Sobic005G212900--Sobic010G140700 Sobic005G212900--Sobic005G213000 Sobic005G212900--Sobic002G121800 Sobic005G212900--Sobic001G249100 Sobic004G359900 Sobic004G359900 Sobic005G212900--Sobic004G359900 Sobic002G121800--Sobic005G213000 Sobic004G197200 Sobic004G197200 Sobic002G121800--Sobic004G197200 Sobic002G007900 Sobic002G007900 Sobic002G121800--Sobic002G007900 Sobic002G224000 Sobic002G224000 Sobic002G121800--Sobic002G224000 Sobic002G121800--Sobic004G359900 Sobic002G121800--Sobic002G210700 Sobic002G121800--Sobic004G011800 Sobic010G151575 Sobic010G151575 Sobic002G121800--Sobic010G151575 Sobic001G539940 Sobic001G539940 Sobic002G121800--Sobic001G539940
Octagon: transcription factors


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