Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G210700.1
Synonym Sb02g025460
Functional annotation pectinesterase, putative, expressed
UniProt C5XDK5
Pfam PF04043 PF01095
Panther DB PTHR31707 PTHR31707:SF37
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004857; enzyme inhibitor activity GO:0005618cell wall


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G26450 : Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g26360.1 : pectinesterase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005792 , Zm00025a013953 , Zm00025a047112
Brachypodium KQJ90350
Barley HORVU5Hr1G063260.2 , HORVU5Hr1G063260.3 , HORVU2Hr1G080170.1 , HORVU5Hr1G059120.2 , HORVU5Hr1G059120.1 , HORVU6Hr1G082990.3 , HORVU6Hr1G082990.4
Wheat TraesCS6A02G343700 , TraesCS5A02G216500 , TraesCS5D02G224600 , TraesCS2B02G341700 , TraesCS6B02G375900 , TraesCS6B02G375900 , TraesCS6D02G324900 , TraesCS6D02G324900 , TraesCS2A02G344200 , TraesCS6D02G324600 , TraesCS2D02G322500 , TraesCS5B02G215400 , TraesCS6A02G343800 , TraesCS6B02G376000
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic002G210700 Sobic002G210700 Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic002G210700--Sobic002G006700 Sobic004G011800 Sobic004G011800 Sobic002G210700--Sobic004G011800 Sobic005G213000 Sobic005G213000 Sobic002G210700--Sobic005G213000 Sobic008G190300 Sobic008G190300 Sobic002G210700--Sobic008G190300 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic002G210700--Sobic009G089800 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic002G210700--Sobic001G249100 Sobic005G212900 Sobic005G212900 Sobic002G210700--Sobic005G212900 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic002G210700--Sobic003G379100 Sobic002G121800 Sobic002G121800 Sobic002G210700--Sobic002G121800 Sobic002G006700--Sobic002G210700 Sobic002G006700--Sobic004G011800 Sobic002G006700--Sobic001G249100 Sobic002G006700--Sobic008G190300 Sobic002G006700--Sobic009G089800 Sobic002G006700--Sobic005G213000 Sobic002G006700--Sobic005G212900 Sobic002G006700--Sobic003G379100 Sobic009G133000 Sobic009G133000 Sobic002G006700--Sobic009G133000 Sobic004G011800--Sobic002G006700 Sobic004G011800--Sobic002G210700 Sobic004G011800--Sobic005G213000 Sobic004G011800--Sobic008G190300 Sobic004G011800--Sobic009G089800 Sobic004G011800--Sobic001G249100 Sobic004G011800--Sobic003G379100 Sobic004G011800--Sobic005G212900 Sobic004G011800--Sobic002G121800 Sobic005G213000--Sobic002G210700 Sobic005G213000--Sobic004G011800 Sobic005G213000--Sobic002G006700 Sobic005G213000--Sobic002G121800 Sobic005G213000--Sobic009G089800 Sobic005G213000--Sobic008G190300 Sobic005G213000--Sobic001G249100 Sobic005G213000--Sobic003G379100 Sobic010G257700 Sobic010G257700 Sobic005G213000--Sobic010G257700 Sobic008G190300--Sobic009G089800 Sobic008G190300--Sobic003G379100 Sobic008G190300--Sobic004G011800 Sobic008G190300--Sobic001G249100 Sobic008G190300--Sobic002G210700 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic008G190300--Sobic002G100766 Sobic008G190300--Sobic002G006700 Sobic004G078750 Sobic004G078750 Sobic008G190300--Sobic004G078750 Sobic008G190300--Sobic005G213000 Sobic009G089800--Sobic008G190300 Sobic009G089800--Sobic003G379100 Sobic009G089800--Sobic004G011800 Sobic009G089800--Sobic002G210700 Sobic009G089800--Sobic002G006700 Sobic009G089800--Sobic001G249100 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic009G089800--Sobic002G165900 Sobic009G089800--Sobic005G213000 Sobic009G089800--Sobic002G100766 Sobic001G249100--Sobic002G006700 Sobic001G249100--Sobic008G190300 Sobic001G249100--Sobic004G011800 Sobic001G249100--Sobic009G089800 Sobic001G249100--Sobic002G210700 Sobic001G249100--Sobic003G379100 Sobic001G249100--Sobic002G100766 Sobic001G249100--Sobic004G078750 Sobic001G249100--Sobic005G213000 Sobic005G212900--Sobic002G006700 Sobic005G212900--Sobic002G210700 Sobic002G237100 Sobic002G237100 Sobic005G212900--Sobic002G237100 Sobic005G212900--Sobic004G011800 Sobic010G140700 Sobic010G140700 Sobic005G212900--Sobic010G140700 Sobic005G212900--Sobic005G213000 Sobic005G212900--Sobic002G121800 Sobic005G212900--Sobic001G249100 Sobic004G359900 Sobic004G359900 Sobic005G212900--Sobic004G359900 Sobic003G379100--Sobic009G089800 Sobic003G379100--Sobic008G190300 Sobic003G379100--Sobic002G100766 Sobic003G379100--Sobic004G078750 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic003G379100--Sobic003G226400 Sobic003G379100--Sobic002G165900 Sobic003G379100--Sobic001G249100 Sobic003G379100--Sobic002G006700 Sobic003G379100--Sobic004G011800 Sobic002G121800--Sobic005G213000 Sobic004G197200 Sobic004G197200 Sobic002G121800--Sobic004G197200 Sobic002G007900 Sobic002G007900 Sobic002G121800--Sobic002G007900 Sobic002G224000 Sobic002G224000 Sobic002G121800--Sobic002G224000 Sobic002G121800--Sobic004G359900 Sobic002G121800--Sobic002G210700 Sobic002G121800--Sobic004G011800 Sobic010G151575 Sobic010G151575 Sobic002G121800--Sobic010G151575 Sobic001G539940 Sobic001G539940 Sobic002G121800--Sobic001G539940
Octagon: transcription factors


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