Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G237100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QD46
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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cDNA sequences
Sobic.002G237100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G212900 IWS1 homolog A, putative, expressed -
2 Sobic.010G140700 peroxidase precursor, putative, expressed -
3 Sobic.008G138100 exostosin family domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G006700 expressed protein -
5 Sobic.002G210700 pectinesterase, putative, expressed -
6 Sobic.006G193700 DUF581 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G133000 expressed protein -
8 Sobic.004G359900 expressed protein -
9 Sobic.010G016100 TKL_IRAK_CrRLK1L-1.13 - The CrRLK1L-1 subfamily has homology to the CrRLK1L homolog, expressed -
10 Sobic.001G249100 expressed protein -
11 Sobic.004G011800 - -
12 Sobic.010G063700 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
13 Sobic.010G246132 - -
14 Sobic.005G213000 - -
15 Sobic.002G121800 transporter family protein, putative, expressed K08150: SLC2A13, MFS transporter, SP family, solute carrier family 2 (myo-inositol transporter), member 13
16 Sobic.005G023600 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
17 Sobic.001G445400 expressed protein -
18 Sobic.010G151575 - -
19 Sobic.009G089800 reticulon domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G105500 pectinesterase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G237100 Sobic002G237100 Sobic005G212900 Sobic005G212900 Sobic002G237100--Sobic005G212900 Sobic010G140700 Sobic010G140700 Sobic002G237100--Sobic010G140700 Sobic008G138100 Sobic008G138100 Sobic002G237100--Sobic008G138100 Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic002G237100--Sobic002G006700 Sobic002G210700 Sobic002G210700 Sobic002G237100--Sobic002G210700 Sobic006G193700 Sobic006G193700 Sobic002G237100--Sobic006G193700 Sobic009G133000 Sobic009G133000 Sobic002G237100--Sobic009G133000 Sobic004G359900 Sobic004G359900 Sobic002G237100--Sobic004G359900 Sobic010G016100 Sobic010G016100 Sobic002G237100--Sobic010G016100 Sobic005G212900--Sobic002G006700 Sobic005G212900--Sobic002G210700 Sobic005G212900--Sobic002G237100 Sobic004G011800 Sobic004G011800 Sobic005G212900--Sobic004G011800 Sobic005G212900--Sobic010G140700 Sobic005G213000 Sobic005G213000 Sobic005G212900--Sobic005G213000 Sobic002G121800 Sobic002G121800 Sobic005G212900--Sobic002G121800 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic005G212900--Sobic001G249100 Sobic005G212900--Sobic004G359900 Sobic010G140700--Sobic002G237100 Sobic010G140700--Sobic005G212900 Sobic010G140700--Sobic008G138100 Sobic010G140700--Sobic002G006700 Sobic010G140700--Sobic009G133000 Sobic010G140700--Sobic010G016100 Sobic010G140700--Sobic001G249100 Sobic010G140700--Sobic002G210700 Sobic002G236800 Sobic002G236800 Sobic010G140700--Sobic002G236800 Sobic008G138100--Sobic010G016100 Sobic008G138100--Sobic010G140700 Sobic008G138100--Sobic002G237100 Sobic010G063700 Sobic010G063700 Sobic008G138100--Sobic010G063700 Sobic001G445400 Sobic001G445400 Sobic008G138100--Sobic001G445400 Sobic003G322000 Sobic003G322000 Sobic008G138100--Sobic003G322000 Sobic008G138100--Sobic005G212900 Sobic004G180200 Sobic004G180200 Sobic008G138100--Sobic004G180200 Sobic008G138100--Sobic009G133000 Sobic002G006700--Sobic002G210700 Sobic002G006700--Sobic004G011800 Sobic002G006700--Sobic001G249100 Sobic008G190300 Sobic008G190300 Sobic002G006700--Sobic008G190300 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic002G006700--Sobic009G089800 Sobic002G006700--Sobic005G213000 Sobic002G006700--Sobic005G212900 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic002G006700--Sobic003G379100 Sobic002G006700--Sobic009G133000 Sobic002G210700--Sobic002G006700 Sobic002G210700--Sobic004G011800 Sobic002G210700--Sobic005G213000 Sobic002G210700--Sobic008G190300 Sobic002G210700--Sobic009G089800 Sobic002G210700--Sobic001G249100 Sobic002G210700--Sobic005G212900 Sobic002G210700--Sobic003G379100 Sobic002G210700--Sobic002G121800 Sobic006G193700--Sobic004G359900 Sobic006G105500 Sobic006G105500 Sobic006G193700--Sobic006G105500 Sobic010G151575 Sobic010G151575 Sobic006G193700--Sobic010G151575 Sobic005G023600 Sobic005G023600 Sobic006G193700--Sobic005G023600 Sobic002G224000 Sobic002G224000 Sobic006G193700--Sobic002G224000 Sobic006G193700--Sobic005G212900 Sobic004G197200 Sobic004G197200 Sobic006G193700--Sobic004G197200 Sobic006G193700--Sobic002G121800 Sobic002G007900 Sobic002G007900 Sobic006G193700--Sobic002G007900 Sobic009G133000--Sobic002G006700 Sobic009G133000--Sobic002G210700 Sobic009G133000--Sobic004G011800 Sobic009G133000--Sobic001G249100 Sobic009G133000--Sobic008G190300 Sobic009G133000--Sobic009G089800 Sobic009G133000--Sobic005G212900 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic009G133000--Sobic002G100766 Sobic009G133000--Sobic005G213000 Sobic004G359900--Sobic010G151575 Sobic004G359900--Sobic006G105500 Sobic004G359900--Sobic002G224000 Sobic004G359900--Sobic004G197200 Sobic004G359900--Sobic006G193700 Sobic004G359900--Sobic002G007900 Sobic004G359900--Sobic002G121800 Sobic001G539940 Sobic001G539940 Sobic004G359900--Sobic001G539940 Sobic010G089900 Sobic010G089900 Sobic004G359900--Sobic010G089900 Sobic010G016100--Sobic008G138100 Sobic010G016100--Sobic010G063700 Sobic010G016100--Sobic001G445400 Sobic010G016100--Sobic010G140700 Sobic010G016100--Sobic002G237100 Sobic001G152800 Sobic001G152800 Sobic010G016100--Sobic001G152800 Sobic010G016100--Sobic005G212900 Sobic010G016100--Sobic004G180200 Sobic010G016100--Sobic003G322000
Octagon: transcription factors


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