Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G006700.1
Synonym Sb02g000790
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X777
Pfam PF00168
Panther DB PTHR23180 PTHR23180:SF285
NCBI CDD KOG1030; Predicted Ca2+-dependent phospholipid-binding protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G23140 : Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g01780.1 : GTPase activating protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044871
Brachypodium KQK21187
Barley -
Wheat TraesCS2A02G261500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G006700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic002G210700 Sobic002G210700 Sobic002G006700--Sobic002G210700 Sobic004G011800 Sobic004G011800 Sobic002G006700--Sobic004G011800 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic002G006700--Sobic001G249100 Sobic008G190300 Sobic008G190300 Sobic002G006700--Sobic008G190300 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic002G006700--Sobic009G089800 Sobic005G213000 Sobic005G213000 Sobic002G006700--Sobic005G213000 Sobic005G212900 Sobic005G212900 Sobic002G006700--Sobic005G212900 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic002G006700--Sobic003G379100 Sobic009G133000 Sobic009G133000 Sobic002G006700--Sobic009G133000 Sobic002G210700--Sobic002G006700 Sobic002G210700--Sobic004G011800 Sobic002G210700--Sobic005G213000 Sobic002G210700--Sobic008G190300 Sobic002G210700--Sobic009G089800 Sobic002G210700--Sobic001G249100 Sobic002G210700--Sobic005G212900 Sobic002G210700--Sobic003G379100 Sobic002G121800 Sobic002G121800 Sobic002G210700--Sobic002G121800 Sobic004G011800--Sobic002G006700 Sobic004G011800--Sobic002G210700 Sobic004G011800--Sobic005G213000 Sobic004G011800--Sobic008G190300 Sobic004G011800--Sobic009G089800 Sobic004G011800--Sobic001G249100 Sobic004G011800--Sobic003G379100 Sobic004G011800--Sobic005G212900 Sobic004G011800--Sobic002G121800 Sobic001G249100--Sobic002G006700 Sobic001G249100--Sobic008G190300 Sobic001G249100--Sobic004G011800 Sobic001G249100--Sobic009G089800 Sobic001G249100--Sobic002G210700 Sobic001G249100--Sobic003G379100 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic001G249100--Sobic002G100766 Sobic004G078750 Sobic004G078750 Sobic001G249100--Sobic004G078750 Sobic001G249100--Sobic005G213000 Sobic008G190300--Sobic009G089800 Sobic008G190300--Sobic003G379100 Sobic008G190300--Sobic004G011800 Sobic008G190300--Sobic001G249100 Sobic008G190300--Sobic002G210700 Sobic008G190300--Sobic002G100766 Sobic008G190300--Sobic002G006700 Sobic008G190300--Sobic004G078750 Sobic008G190300--Sobic005G213000 Sobic009G089800--Sobic008G190300 Sobic009G089800--Sobic003G379100 Sobic009G089800--Sobic004G011800 Sobic009G089800--Sobic002G210700 Sobic009G089800--Sobic002G006700 Sobic009G089800--Sobic001G249100 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic009G089800--Sobic002G165900 Sobic009G089800--Sobic005G213000 Sobic009G089800--Sobic002G100766 Sobic005G213000--Sobic002G210700 Sobic005G213000--Sobic004G011800 Sobic005G213000--Sobic002G006700 Sobic005G213000--Sobic002G121800 Sobic005G213000--Sobic009G089800 Sobic005G213000--Sobic008G190300 Sobic005G213000--Sobic001G249100 Sobic005G213000--Sobic003G379100 Sobic010G257700 Sobic010G257700 Sobic005G213000--Sobic010G257700 Sobic005G212900--Sobic002G006700 Sobic005G212900--Sobic002G210700 Sobic002G237100 Sobic002G237100 Sobic005G212900--Sobic002G237100 Sobic005G212900--Sobic004G011800 Sobic010G140700 Sobic010G140700 Sobic005G212900--Sobic010G140700 Sobic005G212900--Sobic005G213000 Sobic005G212900--Sobic002G121800 Sobic005G212900--Sobic001G249100 Sobic004G359900 Sobic004G359900 Sobic005G212900--Sobic004G359900 Sobic003G379100--Sobic009G089800 Sobic003G379100--Sobic008G190300 Sobic003G379100--Sobic002G100766 Sobic003G379100--Sobic004G078750 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic003G379100--Sobic003G226400 Sobic003G379100--Sobic002G165900 Sobic003G379100--Sobic001G249100 Sobic003G379100--Sobic002G006700 Sobic003G379100--Sobic004G011800 Sobic009G133000--Sobic002G006700 Sobic009G133000--Sobic002G210700 Sobic009G133000--Sobic004G011800 Sobic009G133000--Sobic001G249100 Sobic009G133000--Sobic008G190300 Sobic009G133000--Sobic009G089800 Sobic009G133000--Sobic005G212900 Sobic009G133000--Sobic002G100766 Sobic009G133000--Sobic005G213000
Octagon: transcription factors


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