Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G257700.1
Synonym Sb10g029450, ROC7
Functional annotation peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed
UniProt C5Z9C3
Pfam PF00160
Panther DB PTHR11071 PTHR11071:SF280
NCBI CDD KOG0880; Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006457; protein folding GO:0003755peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity GO:0000413protein peptidyl-prolyl isomerization


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G29960 : cyclophilin 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g49470.1 : peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G257700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.010G151575 - -
20 Sobic.009G133000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G257700 Sobic010G257700 Sobic005G213000 Sobic005G213000 Sobic010G257700--Sobic005G213000 Sobic002G121800 Sobic002G121800 Sobic010G257700--Sobic002G121800 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic010G257700--Sobic009G089800 Sobic004G011800 Sobic004G011800 Sobic010G257700--Sobic004G011800 Sobic002G210700 Sobic002G210700 Sobic010G257700--Sobic002G210700 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic010G257700--Sobic002G165900 Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic010G257700--Sobic002G006700 Sobic008G190300 Sobic008G190300 Sobic010G257700--Sobic008G190300 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic010G257700--Sobic003G379100 Sobic005G213000--Sobic002G210700 Sobic005G213000--Sobic004G011800 Sobic005G213000--Sobic002G006700 Sobic005G213000--Sobic002G121800 Sobic005G213000--Sobic009G089800 Sobic005G213000--Sobic008G190300 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic005G213000--Sobic001G249100 Sobic005G213000--Sobic003G379100 Sobic005G213000--Sobic010G257700 Sobic002G121800--Sobic005G213000 Sobic004G197200 Sobic004G197200 Sobic002G121800--Sobic004G197200 Sobic002G007900 Sobic002G007900 Sobic002G121800--Sobic002G007900 Sobic002G224000 Sobic002G224000 Sobic002G121800--Sobic002G224000 Sobic004G359900 Sobic004G359900 Sobic002G121800--Sobic004G359900 Sobic002G121800--Sobic002G210700 Sobic002G121800--Sobic004G011800 Sobic010G151575 Sobic010G151575 Sobic002G121800--Sobic010G151575 Sobic001G539940 Sobic001G539940 Sobic002G121800--Sobic001G539940 Sobic009G089800--Sobic008G190300 Sobic009G089800--Sobic003G379100 Sobic009G089800--Sobic004G011800 Sobic009G089800--Sobic002G210700 Sobic009G089800--Sobic002G006700 Sobic009G089800--Sobic001G249100 Sobic009G089800--Sobic002G165900 Sobic009G089800--Sobic005G213000 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic009G089800--Sobic002G100766 Sobic004G011800--Sobic002G006700 Sobic004G011800--Sobic002G210700 Sobic004G011800--Sobic005G213000 Sobic004G011800--Sobic008G190300 Sobic004G011800--Sobic009G089800 Sobic004G011800--Sobic001G249100 Sobic004G011800--Sobic003G379100 Sobic005G212900 Sobic005G212900 Sobic004G011800--Sobic005G212900 Sobic004G011800--Sobic002G121800 Sobic002G210700--Sobic002G006700 Sobic002G210700--Sobic004G011800 Sobic002G210700--Sobic005G213000 Sobic002G210700--Sobic008G190300 Sobic002G210700--Sobic009G089800 Sobic002G210700--Sobic001G249100 Sobic002G210700--Sobic005G212900 Sobic002G210700--Sobic003G379100 Sobic002G210700--Sobic002G121800 Sobic002G165900--Sobic009G089800 Sobic002G165900--Sobic003G379100 Sobic002G165900--Sobic008G190300 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic002G165900--Sobic003G226400 Sobic002G165900--Sobic002G100766 Sobic004G078750 Sobic004G078750 Sobic002G165900--Sobic004G078750 Sobic002G165900--Sobic002G210700 Sobic002G165900--Sobic002G006700 Sobic002G165900--Sobic001G249100 Sobic002G006700--Sobic002G210700 Sobic002G006700--Sobic004G011800 Sobic002G006700--Sobic001G249100 Sobic002G006700--Sobic008G190300 Sobic002G006700--Sobic009G089800 Sobic002G006700--Sobic005G213000 Sobic002G006700--Sobic005G212900 Sobic002G006700--Sobic003G379100 Sobic009G133000 Sobic009G133000 Sobic002G006700--Sobic009G133000 Sobic008G190300--Sobic009G089800 Sobic008G190300--Sobic003G379100 Sobic008G190300--Sobic004G011800 Sobic008G190300--Sobic001G249100 Sobic008G190300--Sobic002G210700 Sobic008G190300--Sobic002G100766 Sobic008G190300--Sobic002G006700 Sobic008G190300--Sobic004G078750 Sobic008G190300--Sobic005G213000 Sobic003G379100--Sobic009G089800 Sobic003G379100--Sobic008G190300 Sobic003G379100--Sobic002G100766 Sobic003G379100--Sobic004G078750 Sobic003G379100--Sobic003G226400 Sobic003G379100--Sobic002G165900 Sobic003G379100--Sobic001G249100 Sobic003G379100--Sobic002G006700 Sobic003G379100--Sobic004G011800
Octagon: transcription factors


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