Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G236800.1
Synonym Sb02g027500
Functional annotation -
UniProt C5X348
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047372
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G078750 - -
2 Sobic.002G100766 - -
3 Sobic.003G226400 similar to Late embryogenesis-abundant protein Lea14-A-like(PubMedID : 29862293)@late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G379100 expressed protein -
5 Sobic.001G249100 expressed protein -
6 Sobic.008G190300 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
7 Sobic.009G089800 reticulon domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G006700 expressed protein -
9 Sobic.006G251100 powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed -
10 Sobic.002G165900 csAtPR5, putative, expressed -
11 Sobic.002G210700 pectinesterase, putative, expressed -
12 Sobic.002G305800 expansin precursor, putative, expressed -
13 Sobic.009G133000 expressed protein -
14 Sobic.004G011800 - -
15 Sobic.004G080600 protein with a conserved N-terminal region, putative, expressed -
16 Sobic.007G051200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K00968: choline-phosphate cytidylyltransferase
17 Sobic.010G140700 peroxidase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.005G213000 - -
19 Sobic.005G212900 IWS1 homolog A, putative, expressed -
20 Sobic.002G122500 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G236800 Sobic002G236800 Sobic004G078750 Sobic004G078750 Sobic002G236800--Sobic004G078750 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic002G236800--Sobic002G100766 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic002G236800--Sobic003G226400 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic002G236800--Sobic003G379100 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic002G236800--Sobic001G249100 Sobic008G190300 Sobic008G190300 Sobic002G236800--Sobic008G190300 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic002G236800--Sobic009G089800 Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic002G236800--Sobic002G006700 Sobic006G251100 Sobic006G251100 Sobic002G236800--Sobic006G251100 Sobic004G078750--Sobic002G100766 Sobic004G078750--Sobic003G226400 Sobic004G078750--Sobic002G236800 Sobic004G078750--Sobic008G190300 Sobic004G078750--Sobic003G379100 Sobic004G078750--Sobic009G089800 Sobic004G078750--Sobic001G249100 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic004G078750--Sobic002G165900 Sobic004G078750--Sobic002G006700 Sobic002G100766--Sobic004G078750 Sobic002G100766--Sobic003G226400 Sobic002G100766--Sobic008G190300 Sobic002G100766--Sobic002G236800 Sobic002G100766--Sobic003G379100 Sobic002G100766--Sobic009G089800 Sobic002G100766--Sobic001G249100 Sobic002G100766--Sobic002G165900 Sobic002G100766--Sobic002G006700 Sobic003G226400--Sobic004G078750 Sobic003G226400--Sobic002G100766 Sobic003G226400--Sobic002G236800 Sobic003G226400--Sobic003G379100 Sobic003G226400--Sobic008G190300 Sobic003G226400--Sobic009G089800 Sobic003G226400--Sobic001G249100 Sobic003G226400--Sobic002G165900 Sobic003G226400--Sobic002G006700 Sobic003G379100--Sobic009G089800 Sobic003G379100--Sobic008G190300 Sobic003G379100--Sobic002G100766 Sobic003G379100--Sobic004G078750 Sobic003G379100--Sobic003G226400 Sobic003G379100--Sobic002G165900 Sobic003G379100--Sobic001G249100 Sobic003G379100--Sobic002G006700 Sobic004G011800 Sobic004G011800 Sobic003G379100--Sobic004G011800 Sobic001G249100--Sobic002G006700 Sobic001G249100--Sobic008G190300 Sobic001G249100--Sobic004G011800 Sobic001G249100--Sobic009G089800 Sobic002G210700 Sobic002G210700 Sobic001G249100--Sobic002G210700 Sobic001G249100--Sobic003G379100 Sobic001G249100--Sobic002G100766 Sobic001G249100--Sobic004G078750 Sobic005G213000 Sobic005G213000 Sobic001G249100--Sobic005G213000 Sobic008G190300--Sobic009G089800 Sobic008G190300--Sobic003G379100 Sobic008G190300--Sobic004G011800 Sobic008G190300--Sobic001G249100 Sobic008G190300--Sobic002G210700 Sobic008G190300--Sobic002G100766 Sobic008G190300--Sobic002G006700 Sobic008G190300--Sobic004G078750 Sobic008G190300--Sobic005G213000 Sobic009G089800--Sobic008G190300 Sobic009G089800--Sobic003G379100 Sobic009G089800--Sobic004G011800 Sobic009G089800--Sobic002G210700 Sobic009G089800--Sobic002G006700 Sobic009G089800--Sobic001G249100 Sobic009G089800--Sobic002G165900 Sobic009G089800--Sobic005G213000 Sobic009G089800--Sobic002G100766 Sobic002G006700--Sobic002G210700 Sobic002G006700--Sobic004G011800 Sobic002G006700--Sobic001G249100 Sobic002G006700--Sobic008G190300 Sobic002G006700--Sobic009G089800 Sobic002G006700--Sobic005G213000 Sobic005G212900 Sobic005G212900 Sobic002G006700--Sobic005G212900 Sobic002G006700--Sobic003G379100 Sobic009G133000 Sobic009G133000 Sobic002G006700--Sobic009G133000 Sobic007G051200 Sobic007G051200 Sobic006G251100--Sobic007G051200 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic006G251100--Sobic002G305800 Sobic006G251100--Sobic002G236800 Sobic006G251100--Sobic003G226400 Sobic006G251100--Sobic004G078750 Sobic004G080600 Sobic004G080600 Sobic006G251100--Sobic004G080600 Sobic006G251100--Sobic002G100766 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic006G251100--Sobic008G080700 Sobic006G251100--Sobic003G379100
Octagon: transcription factors


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