Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G160200.1
Synonym Sb02g020390
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X8A9
Pfam -
Panther DB PTHR36487 PTHR36487:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g12630.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013685
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.002G160200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G102600 - -
2 Sobic.007G204800 receptor-like protein kinase 1, putative, expressed -
3 Sobic.004G338900 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G098100 - -
5 Sobic.003G400700 CAMK_CAMK_like.39 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
6 Sobic.001G160900 signal recognition particle 54 kDa protein, putative, expressed K03106: SRP54, signal recognition particle subunit SRP54
7 Sobic.005G001200 - -
8 Sobic.006G037100 expressed protein -
9 Sobic.008G129800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G264100 ATCHX15, putative, expressed -
11 Sobic.001G433500 expressed protein -
12 Sobic.003G287800 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
13 Sobic.008G131300 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
14 Sobic.002G083100 cadmium/zinc-transporting ATPase, putative, expressed K01534: Zn2+/Cd2+-exporting ATPase
15 Sobic.002G122500 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G322500 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G163900 SNARE domain containing protein, putative, expressed K18211: synaptosomal-associated protein 25
18 Sobic.010G126300 - -
19 Sobic.010G070100 serine threonine kinase, putative, expressed -
20 Sobic.003G322000 tyrosine protein kinase domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G160200 Sobic002G160200 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic002G160200--Sobic002G102600 Sobic007G204800 Sobic007G204800 Sobic002G160200--Sobic007G204800 Sobic004G338900 Sobic004G338900 Sobic002G160200--Sobic004G338900 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic002G160200--Sobic005G098100 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic002G160200--Sobic003G400700 Sobic001G160900 Sobic001G160900 Sobic002G160200--Sobic001G160900 Sobic005G001200 Sobic005G001200 Sobic002G160200--Sobic005G001200 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic002G160200--Sobic006G037100 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic002G160200--Sobic008G129800 Sobic002G102600--Sobic005G098100 Sobic002G102600--Sobic002G160200 Sobic002G102600--Sobic003G400700 Sobic001G433500 Sobic001G433500 Sobic002G102600--Sobic001G433500 Sobic002G102600--Sobic006G037100 Sobic002G102600--Sobic005G001200 Sobic003G287800 Sobic003G287800 Sobic002G102600--Sobic003G287800 Sobic003G131900 Sobic003G131900 Sobic002G102600--Sobic003G131900 Sobic002G102600--Sobic007G204800 Sobic007G204800--Sobic002G160200 Sobic007G204800--Sobic004G338900 Sobic006G099200 Sobic006G099200 Sobic007G204800--Sobic006G099200 Sobic007G204800--Sobic001G160900 Sobic001G120800 Sobic001G120800 Sobic007G204800--Sobic001G120800 Sobic007G204800--Sobic002G102600 Sobic010G257900 Sobic010G257900 Sobic007G204800--Sobic010G257900 Sobic005G027250 Sobic005G027250 Sobic007G204800--Sobic005G027250 Sobic002G083100 Sobic002G083100 Sobic007G204800--Sobic002G083100 Sobic004G338900--Sobic002G160200 Sobic004G338900--Sobic007G204800 Sobic004G338900--Sobic001G160900 Sobic004G338900--Sobic006G099200 Sobic004G338900--Sobic002G083100 Sobic004G338900--Sobic002G102600 Sobic004G338900--Sobic005G027250 Sobic004G338900--Sobic005G001200 Sobic004G338900--Sobic003G287800 Sobic005G098100--Sobic003G400700 Sobic005G098100--Sobic001G433500 Sobic005G098100--Sobic002G102600 Sobic005G098100--Sobic006G037100 Sobic003G166001 Sobic003G166001 Sobic005G098100--Sobic003G166001 Sobic006G098900 Sobic006G098900 Sobic005G098100--Sobic006G098900 Sobic005G098100--Sobic003G287800 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic005G098100--Sobic008G080700 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic005G098100--Sobic008G131300 Sobic003G400700--Sobic001G433500 Sobic003G400700--Sobic006G037100 Sobic003G400700--Sobic005G098100 Sobic003G400700--Sobic003G166001 Sobic003G400700--Sobic008G080700 Sobic003G400700--Sobic006G098900 Sobic003G400700--Sobic002G102600 Sobic003G400700--Sobic008G131300 Sobic002G122500 Sobic002G122500 Sobic003G400700--Sobic002G122500 Sobic001G160900--Sobic007G204800 Sobic001G160900--Sobic002G160200 Sobic001G160900--Sobic004G338900 Sobic001G160900--Sobic002G102600 Sobic005G125200 Sobic005G125200 Sobic001G160900--Sobic005G125200 Sobic001G160900--Sobic006G099200 Sobic003G192200 Sobic003G192200 Sobic001G160900--Sobic003G192200 Sobic001G160900--Sobic001G120800 Sobic001G160900--Sobic010G257900 Sobic010G126300 Sobic010G126300 Sobic005G001200--Sobic010G126300 Sobic005G001200--Sobic003G287800 Sobic005G001200--Sobic002G102600 Sobic005G001200--Sobic005G098100 Sobic005G001200--Sobic003G400700 Sobic002G322500 Sobic002G322500 Sobic005G001200--Sobic002G322500 Sobic005G001200--Sobic001G433500 Sobic005G001200--Sobic006G037100 Sobic005G001200--Sobic002G160200 Sobic006G037100--Sobic003G400700 Sobic006G037100--Sobic001G433500 Sobic006G037100--Sobic003G166001 Sobic006G037100--Sobic008G080700 Sobic006G037100--Sobic005G098100 Sobic006G037100--Sobic006G098900 Sobic006G037100--Sobic008G131300 Sobic006G037100--Sobic002G122500 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic006G037100--Sobic002G305800 Sobic008G129800--Sobic002G122500 Sobic004G163900 Sobic004G163900 Sobic008G129800--Sobic004G163900 Sobic003G322000 Sobic003G322000 Sobic008G129800--Sobic003G322000 Sobic008G129800--Sobic008G131300 Sobic008G129800--Sobic002G305800 Sobic008G129800--Sobic008G080700 Sobic008G129800--Sobic006G037100 Sobic003G193600 Sobic003G193600 Sobic008G129800--Sobic003G193600 Sobic007G051200 Sobic007G051200 Sobic008G129800--Sobic007G051200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.