Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G322500.1
Synonym Sb02g035010
Functional annotation similar to Putative uncharacterized protein (PubMedID : 29862293)
harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
UniProt C5XA44
Pfam PF03168
Panther DB PTHR31852 PTHR31852:SF41
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G46150 : Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g34050.1 : harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014816
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.002G322500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G287800 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
2 Sobic.006G037100 expressed protein -
3 Sobic.003G400700 CAMK_CAMK_like.39 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
4 Sobic.001G433500 expressed protein -
5 Sobic.008G129800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G080700 CAMK_CAMK_like.46 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
7 Sobic.003G166001 - -
8 Sobic.008G131300 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
9 Sobic.010G126300 - -
10 Sobic.002G122500 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G001200 - -
12 Sobic.005G098100 - -
13 Sobic.004G163900 SNARE domain containing protein, putative, expressed K18211: synaptosomal-associated protein 25
14 Sobic.002G305800 expansin precursor, putative, expressed -
15 Sobic.002G102600 - -
16 Sobic.006G098900 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
17 Sobic.004G080600 protein with a conserved N-terminal region, putative, expressed -
18 Sobic.003G322000 tyrosine protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G079600 - -
20 Sobic.002G160200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G322500 Sobic002G322500 Sobic003G287800 Sobic003G287800 Sobic002G322500--Sobic003G287800 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic002G322500--Sobic006G037100 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic002G322500--Sobic003G400700 Sobic001G433500 Sobic001G433500 Sobic002G322500--Sobic001G433500 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic002G322500--Sobic008G129800 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic002G322500--Sobic008G080700 Sobic003G166001 Sobic003G166001 Sobic002G322500--Sobic003G166001 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic002G322500--Sobic008G131300 Sobic010G126300 Sobic010G126300 Sobic002G322500--Sobic010G126300 Sobic003G287800--Sobic010G126300 Sobic005G001200 Sobic005G001200 Sobic003G287800--Sobic005G001200 Sobic003G287800--Sobic002G322500 Sobic003G287800--Sobic003G400700 Sobic003G287800--Sobic006G037100 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic003G287800--Sobic005G098100 Sobic003G287800--Sobic001G433500 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic003G287800--Sobic002G102600 Sobic003G287800--Sobic003G166001 Sobic006G037100--Sobic003G400700 Sobic006G037100--Sobic001G433500 Sobic006G037100--Sobic003G166001 Sobic006G037100--Sobic008G080700 Sobic006G037100--Sobic005G098100 Sobic006G098900 Sobic006G098900 Sobic006G037100--Sobic006G098900 Sobic006G037100--Sobic008G131300 Sobic002G122500 Sobic002G122500 Sobic006G037100--Sobic002G122500 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic006G037100--Sobic002G305800 Sobic003G400700--Sobic001G433500 Sobic003G400700--Sobic006G037100 Sobic003G400700--Sobic005G098100 Sobic003G400700--Sobic003G166001 Sobic003G400700--Sobic008G080700 Sobic003G400700--Sobic006G098900 Sobic003G400700--Sobic002G102600 Sobic003G400700--Sobic008G131300 Sobic003G400700--Sobic002G122500 Sobic001G433500--Sobic003G400700 Sobic001G433500--Sobic006G037100 Sobic001G433500--Sobic003G166001 Sobic001G433500--Sobic005G098100 Sobic001G433500--Sobic006G098900 Sobic001G433500--Sobic008G080700 Sobic001G433500--Sobic002G102600 Sobic001G433500--Sobic008G131300 Sobic001G433500--Sobic003G287800 Sobic008G129800--Sobic002G122500 Sobic004G163900 Sobic004G163900 Sobic008G129800--Sobic004G163900 Sobic003G322000 Sobic003G322000 Sobic008G129800--Sobic003G322000 Sobic008G129800--Sobic008G131300 Sobic008G129800--Sobic002G305800 Sobic008G129800--Sobic008G080700 Sobic008G129800--Sobic006G037100 Sobic003G193600 Sobic003G193600 Sobic008G129800--Sobic003G193600 Sobic007G051200 Sobic007G051200 Sobic008G129800--Sobic007G051200 Sobic008G080700--Sobic002G305800 Sobic008G080700--Sobic003G166001 Sobic008G080700--Sobic006G037100 Sobic008G080700--Sobic002G122500 Sobic004G080600 Sobic004G080600 Sobic008G080700--Sobic004G080600 Sobic008G080700--Sobic008G131300 Sobic008G080700--Sobic004G163900 Sobic008G080700--Sobic006G098900 Sobic008G080700--Sobic003G400700 Sobic003G166001--Sobic006G037100 Sobic003G166001--Sobic008G080700 Sobic003G166001--Sobic001G433500 Sobic003G166001--Sobic003G400700 Sobic003G166001--Sobic006G098900 Sobic003G166001--Sobic002G305800 Sobic003G166001--Sobic008G131300 Sobic003G166001--Sobic005G098100 Sobic003G166001--Sobic007G051200 Sobic008G131300--Sobic002G122500 Sobic008G131300--Sobic008G080700 Sobic008G131300--Sobic006G037100 Sobic008G131300--Sobic008G129800 Sobic008G131300--Sobic002G305800 Sobic008G131300--Sobic004G163900 Sobic008G131300--Sobic003G166001 Sobic008G131300--Sobic003G400700 Sobic008G131300--Sobic003G322000 Sobic010G126300--Sobic003G287800 Sobic010G126300--Sobic005G001200 Sobic010G126300--Sobic002G322500 Sobic010G126300--Sobic003G400700 Sobic010G126300--Sobic005G098100 Sobic010G126300--Sobic002G102600 Sobic010G126300--Sobic006G037100 Sobic010G126300--Sobic001G433500 Sobic010G126300--Sobic003G166001
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.