Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G001200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PPD9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G126300 - -
2 Sobic.003G287800 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.002G102600 - -
4 Sobic.005G098100 - -
5 Sobic.003G400700 CAMK_CAMK_like.39 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
6 Sobic.002G322500 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G433500 expressed protein -
8 Sobic.006G037100 expressed protein -
9 Sobic.002G160200 expressed protein -
10 Sobic.008G131300 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
11 Sobic.003G166001 - -
12 Sobic.003G131900 expressed protein -
13 Sobic.008G129800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G338900 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G098900 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
16 Sobic.008G080700 CAMK_CAMK_like.46 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
17 Sobic.007G204800 receptor-like protein kinase 1, putative, expressed -
18 Sobic.004G264100 ATCHX15, putative, expressed -
19 Sobic.002G122500 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G444700 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G001200 Sobic005G001200 Sobic010G126300 Sobic010G126300 Sobic005G001200--Sobic010G126300 Sobic003G287800 Sobic003G287800 Sobic005G001200--Sobic003G287800 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic005G001200--Sobic002G102600 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic005G001200--Sobic005G098100 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic005G001200--Sobic003G400700 Sobic002G322500 Sobic002G322500 Sobic005G001200--Sobic002G322500 Sobic001G433500 Sobic001G433500 Sobic005G001200--Sobic001G433500 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic005G001200--Sobic006G037100 Sobic002G160200 Sobic002G160200 Sobic005G001200--Sobic002G160200 Sobic010G126300--Sobic003G287800 Sobic010G126300--Sobic005G001200 Sobic010G126300--Sobic002G322500 Sobic010G126300--Sobic003G400700 Sobic010G126300--Sobic005G098100 Sobic010G126300--Sobic002G102600 Sobic010G126300--Sobic006G037100 Sobic010G126300--Sobic001G433500 Sobic003G166001 Sobic003G166001 Sobic010G126300--Sobic003G166001 Sobic003G287800--Sobic010G126300 Sobic003G287800--Sobic005G001200 Sobic003G287800--Sobic002G322500 Sobic003G287800--Sobic003G400700 Sobic003G287800--Sobic006G037100 Sobic003G287800--Sobic005G098100 Sobic003G287800--Sobic001G433500 Sobic003G287800--Sobic002G102600 Sobic003G287800--Sobic003G166001 Sobic002G102600--Sobic005G098100 Sobic002G102600--Sobic002G160200 Sobic002G102600--Sobic003G400700 Sobic002G102600--Sobic001G433500 Sobic002G102600--Sobic006G037100 Sobic002G102600--Sobic005G001200 Sobic002G102600--Sobic003G287800 Sobic003G131900 Sobic003G131900 Sobic002G102600--Sobic003G131900 Sobic007G204800 Sobic007G204800 Sobic002G102600--Sobic007G204800 Sobic005G098100--Sobic003G400700 Sobic005G098100--Sobic001G433500 Sobic005G098100--Sobic002G102600 Sobic005G098100--Sobic006G037100 Sobic005G098100--Sobic003G166001 Sobic006G098900 Sobic006G098900 Sobic005G098100--Sobic006G098900 Sobic005G098100--Sobic003G287800 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic005G098100--Sobic008G080700 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic005G098100--Sobic008G131300 Sobic003G400700--Sobic001G433500 Sobic003G400700--Sobic006G037100 Sobic003G400700--Sobic005G098100 Sobic003G400700--Sobic003G166001 Sobic003G400700--Sobic008G080700 Sobic003G400700--Sobic006G098900 Sobic003G400700--Sobic002G102600 Sobic003G400700--Sobic008G131300 Sobic002G122500 Sobic002G122500 Sobic003G400700--Sobic002G122500 Sobic002G322500--Sobic003G287800 Sobic002G322500--Sobic006G037100 Sobic002G322500--Sobic003G400700 Sobic002G322500--Sobic001G433500 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic002G322500--Sobic008G129800 Sobic002G322500--Sobic008G080700 Sobic002G322500--Sobic003G166001 Sobic002G322500--Sobic008G131300 Sobic002G322500--Sobic010G126300 Sobic001G433500--Sobic003G400700 Sobic001G433500--Sobic006G037100 Sobic001G433500--Sobic003G166001 Sobic001G433500--Sobic005G098100 Sobic001G433500--Sobic006G098900 Sobic001G433500--Sobic008G080700 Sobic001G433500--Sobic002G102600 Sobic001G433500--Sobic008G131300 Sobic001G433500--Sobic003G287800 Sobic006G037100--Sobic003G400700 Sobic006G037100--Sobic001G433500 Sobic006G037100--Sobic003G166001 Sobic006G037100--Sobic008G080700 Sobic006G037100--Sobic005G098100 Sobic006G037100--Sobic006G098900 Sobic006G037100--Sobic008G131300 Sobic006G037100--Sobic002G122500 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic006G037100--Sobic002G305800 Sobic002G160200--Sobic002G102600 Sobic002G160200--Sobic007G204800 Sobic004G338900 Sobic004G338900 Sobic002G160200--Sobic004G338900 Sobic002G160200--Sobic005G098100 Sobic002G160200--Sobic003G400700 Sobic001G160900 Sobic001G160900 Sobic002G160200--Sobic001G160900 Sobic002G160200--Sobic005G001200 Sobic002G160200--Sobic006G037100 Sobic002G160200--Sobic008G129800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.