Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G344400.1
Synonym Sb03g038810
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt C5XNZ7
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF100
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18930 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g61470.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK01486 , KQK01487 , KQK01488
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G474001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G344400 Sobic003G344400 Sobic009G167400 Sobic009G167400 Sobic003G344400--Sobic009G167400 Sobic002G140200 Sobic002G140200 Sobic003G344400--Sobic002G140200 Sobic002G083100 Sobic002G083100 Sobic003G344400--Sobic002G083100 Sobic001G160900 Sobic001G160900 Sobic003G344400--Sobic001G160900 Sobic005G125200 Sobic005G125200 Sobic003G344400--Sobic005G125200 Sobic004G071700 Sobic004G071700 Sobic003G344400--Sobic004G071700 Sobic007G204800 Sobic007G204800 Sobic003G344400--Sobic007G204800 Sobic002G160200 Sobic002G160200 Sobic003G344400--Sobic002G160200 Sobic009G118100 Sobic009G118100 Sobic003G344400--Sobic009G118100 Sobic009G133000 Sobic009G133000 Sobic009G167400--Sobic009G133000 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic009G167400--Sobic001G249100 Sobic002G236800 Sobic002G236800 Sobic009G167400--Sobic002G236800 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic009G167400--Sobic002G165900 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic009G167400--Sobic003G226400 Sobic002G237100 Sobic002G237100 Sobic009G167400--Sobic002G237100 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic009G167400--Sobic009G089800 Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic009G167400--Sobic002G006700 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic009G167400--Sobic002G100766 Sobic002G140200--Sobic003G344400 Sobic004G255100 Sobic004G255100 Sobic002G140200--Sobic004G255100 Sobic010G261900 Sobic010G261900 Sobic002G140200--Sobic010G261900 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic002G140200--Sobic003G254200 Sobic005G042900 Sobic005G042900 Sobic002G140200--Sobic005G042900 Sobic006G168200 Sobic006G168200 Sobic002G140200--Sobic006G168200 Sobic010G279600 Sobic010G279600 Sobic002G140200--Sobic010G279600 Sobic002G140200--Sobic009G167400 Sobic004G136400 Sobic004G136400 Sobic002G140200--Sobic004G136400 Sobic004G338900 Sobic004G338900 Sobic002G083100--Sobic004G338900 Sobic002G083100--Sobic002G160200 Sobic002G083100--Sobic007G204800 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic002G083100--Sobic002G102600 Sobic005G001200 Sobic005G001200 Sobic002G083100--Sobic005G001200 Sobic006G099200 Sobic006G099200 Sobic002G083100--Sobic006G099200 Sobic002G083100--Sobic001G160900 Sobic005G027250 Sobic005G027250 Sobic002G083100--Sobic005G027250 Sobic003G287800 Sobic003G287800 Sobic002G083100--Sobic003G287800 Sobic001G160900--Sobic007G204800 Sobic001G160900--Sobic002G160200 Sobic001G160900--Sobic004G338900 Sobic001G160900--Sobic002G102600 Sobic001G160900--Sobic005G125200 Sobic001G160900--Sobic006G099200 Sobic003G192200 Sobic003G192200 Sobic001G160900--Sobic003G192200 Sobic001G120800 Sobic001G120800 Sobic001G160900--Sobic001G120800 Sobic010G257900 Sobic010G257900 Sobic001G160900--Sobic010G257900 Sobic005G125200--Sobic001G160900 Sobic005G125200--Sobic004G338900 Sobic005G125200--Sobic002G160200 Sobic009G044200 Sobic009G044200 Sobic005G125200--Sobic009G044200 Sobic005G125200--Sobic006G099200 Sobic003G193600 Sobic003G193600 Sobic005G125200--Sobic003G193600 Sobic005G125200--Sobic005G027250 Sobic005G125200--Sobic007G204800 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic005G125200--Sobic008G129800 Sobic010G215400 Sobic010G215400 Sobic004G071700--Sobic010G215400 Sobic001G408001 Sobic001G408001 Sobic004G071700--Sobic001G408001 Sobic003G256300 Sobic003G256300 Sobic004G071700--Sobic003G256300 Sobic001G174400 Sobic001G174400 Sobic004G071700--Sobic001G174400 Sobic009G064200 Sobic009G064200 Sobic004G071700--Sobic009G064200 Sobic001G207900 Sobic001G207900 Sobic004G071700--Sobic001G207900 Sobic005G054501 Sobic005G054501 Sobic004G071700--Sobic005G054501 Sobic004G071700--Sobic009G167400 Sobic004G079600 Sobic004G079600 Sobic004G071700--Sobic004G079600 Sobic007G204800--Sobic002G160200 Sobic007G204800--Sobic004G338900 Sobic007G204800--Sobic006G099200 Sobic007G204800--Sobic001G160900 Sobic007G204800--Sobic001G120800 Sobic007G204800--Sobic002G102600 Sobic007G204800--Sobic010G257900 Sobic007G204800--Sobic005G027250 Sobic007G204800--Sobic002G083100 Sobic002G160200--Sobic002G102600 Sobic002G160200--Sobic007G204800 Sobic002G160200--Sobic004G338900 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic002G160200--Sobic005G098100 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic002G160200--Sobic003G400700 Sobic002G160200--Sobic001G160900 Sobic002G160200--Sobic005G001200 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic002G160200--Sobic006G037100 Sobic002G160200--Sobic008G129800 Sobic003G315600 Sobic003G315600 Sobic009G118100--Sobic003G315600 Sobic001G474001 Sobic001G474001 Sobic009G118100--Sobic001G474001 Sobic009G118100--Sobic001G120800 Sobic009G118100--Sobic010G257900 Sobic003G444700 Sobic003G444700 Sobic009G118100--Sobic003G444700 Sobic009G118100--Sobic007G204800 Sobic003G131900 Sobic003G131900 Sobic009G118100--Sobic003G131900 Sobic006G130900 Sobic006G130900 Sobic009G118100--Sobic006G130900 Sobic009G118100--Sobic002G102600
Octagon: transcription factors


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