Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G215400.1,Sobic.010G215400.2,Sobic.010G215400.3
Synonym Sb10g026170
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VU76 , A0A194YKP2 , A0A1W0VU69
Pfam -
Panther DB PTHR33416 PTHR33416:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g44810.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051689
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G071700 expressed protein -
2 Sobic.001G174400 - -
3 Sobic.003G256300 transcription factor Dp, putative, expressed -
4 Sobic.010G142600 - -
5 Sobic.001G153500 glutaredoxin, putative, expressed -
6 Sobic.004G264100 ATCHX15, putative, expressed -
7 Sobic.004G079600 - -
8 Sobic.001G207900 - -
9 Sobic.009G167400 KIP1, putative, expressed -
10 Sobic.006G098900 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
11 Sobic.001G442400 - -
12 Sobic.002G165900 csAtPR5, putative, expressed -
13 Sobic.006G251100 powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed -
14 Sobic.005G020600 Mad3/BUB1 homology region 1 domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G226400 similar to Late embryogenesis-abundant protein Lea14-A-like(PubMedID : 29862293)@late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G305800 expansin precursor, putative, expressed -
17 Sobic.002G084700 glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.008G131300 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
19 Sobic.007G051200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K00968: choline-phosphate cytidylyltransferase
20 Sobic.008G141300 IBS1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G215400 Sobic010G215400 Sobic004G071700 Sobic004G071700 Sobic010G215400--Sobic004G071700 Sobic001G174400 Sobic001G174400 Sobic010G215400--Sobic001G174400 Sobic003G256300 Sobic003G256300 Sobic010G215400--Sobic003G256300 Sobic010G142600 Sobic010G142600 Sobic010G215400--Sobic010G142600 Sobic001G153500 Sobic001G153500 Sobic010G215400--Sobic001G153500 Sobic004G264100 Sobic004G264100 Sobic010G215400--Sobic004G264100 Sobic004G079600 Sobic004G079600 Sobic010G215400--Sobic004G079600 Sobic001G207900 Sobic001G207900 Sobic010G215400--Sobic001G207900 Sobic009G167400 Sobic009G167400 Sobic010G215400--Sobic009G167400 Sobic004G071700--Sobic010G215400 Sobic001G408001 Sobic001G408001 Sobic004G071700--Sobic001G408001 Sobic004G071700--Sobic003G256300 Sobic004G071700--Sobic001G174400 Sobic009G064200 Sobic009G064200 Sobic004G071700--Sobic009G064200 Sobic004G071700--Sobic001G207900 Sobic005G054501 Sobic005G054501 Sobic004G071700--Sobic005G054501 Sobic004G071700--Sobic009G167400 Sobic004G071700--Sobic004G079600 Sobic001G174400--Sobic001G207900 Sobic001G442400 Sobic001G442400 Sobic001G174400--Sobic001G442400 Sobic003G191350 Sobic003G191350 Sobic001G174400--Sobic003G191350 Sobic008G172000 Sobic008G172000 Sobic001G174400--Sobic008G172000 Sobic005G068500 Sobic005G068500 Sobic001G174400--Sobic005G068500 Sobic001G174400--Sobic004G071700 Sobic002G007900 Sobic002G007900 Sobic001G174400--Sobic002G007900 Sobic001G539940 Sobic001G539940 Sobic001G174400--Sobic001G539940 Sobic002G237100 Sobic002G237100 Sobic001G174400--Sobic002G237100 Sobic003G256300--Sobic004G071700 Sobic003G256300--Sobic001G153500 Sobic003G256300--Sobic010G215400 Sobic003G256300--Sobic004G264100 Sobic003G216400 Sobic003G216400 Sobic003G256300--Sobic003G216400 Sobic003G256300--Sobic004G079600 Sobic003G256300--Sobic001G207900 Sobic003G256300--Sobic001G174400 Sobic001G135900 Sobic001G135900 Sobic003G256300--Sobic001G135900 Sobic008G012500 Sobic008G012500 Sobic010G142600--Sobic008G012500 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic010G142600--Sobic003G400700 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic010G142600--Sobic006G037100 Sobic008G023801 Sobic008G023801 Sobic010G142600--Sobic008G023801 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic010G142600--Sobic008G131300 Sobic003G166001 Sobic003G166001 Sobic010G142600--Sobic003G166001 Sobic001G433500 Sobic001G433500 Sobic010G142600--Sobic001G433500 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic010G142600--Sobic002G102600 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic010G142600--Sobic005G098100 Sobic001G153500--Sobic003G256300 Sobic001G153500--Sobic001G207900 Sobic002G061500 Sobic002G061500 Sobic001G153500--Sobic002G061500 Sobic009G180600 Sobic009G180600 Sobic001G153500--Sobic009G180600 Sobic001G153500--Sobic010G215400 Sobic001G153500--Sobic004G071700 Sobic004G008500 Sobic004G008500 Sobic001G153500--Sobic004G008500 Sobic004G336800 Sobic004G336800 Sobic001G153500--Sobic004G336800 Sobic001G153500--Sobic004G264100 Sobic006G098900 Sobic006G098900 Sobic004G264100--Sobic006G098900 Sobic004G264100--Sobic005G098100 Sobic004G264100--Sobic003G400700 Sobic004G264100--Sobic008G131300 Sobic004G264100--Sobic006G037100 Sobic004G264100--Sobic001G433500 Sobic004G264100--Sobic002G102600 Sobic002G160200 Sobic002G160200 Sobic004G264100--Sobic002G160200 Sobic004G264100--Sobic003G166001 Sobic004G079600--Sobic003G166001 Sobic007G051200 Sobic007G051200 Sobic004G079600--Sobic007G051200 Sobic003G193600 Sobic003G193600 Sobic004G079600--Sobic003G193600 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic004G079600--Sobic008G080700 Sobic004G079600--Sobic006G098900 Sobic006G251100 Sobic006G251100 Sobic004G079600--Sobic006G251100 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic004G079600--Sobic002G305800 Sobic004G079600--Sobic006G037100 Sobic004G080600 Sobic004G080600 Sobic004G079600--Sobic004G080600 Sobic001G207900--Sobic001G442400 Sobic006G096700 Sobic006G096700 Sobic001G207900--Sobic006G096700 Sobic001G207900--Sobic002G007900 Sobic001G207900--Sobic004G008500 Sobic010G246132 Sobic010G246132 Sobic001G207900--Sobic010G246132 Sobic001G207900--Sobic005G068500 Sobic010G257700 Sobic010G257700 Sobic001G207900--Sobic010G257700 Sobic002G121800 Sobic002G121800 Sobic001G207900--Sobic002G121800 Sobic001G207900--Sobic001G539940 Sobic009G133000 Sobic009G133000 Sobic009G167400--Sobic009G133000 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic009G167400--Sobic001G249100 Sobic002G236800 Sobic002G236800 Sobic009G167400--Sobic002G236800 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic009G167400--Sobic002G165900 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic009G167400--Sobic003G226400 Sobic009G167400--Sobic002G237100 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic009G167400--Sobic009G089800 Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic009G167400--Sobic002G006700 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic009G167400--Sobic002G100766
Octagon: transcription factors


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