Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G162800.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PSZ3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g51100.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G168200 expressed protein -
2 Sobic.009G163400 growth regulator related protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G376501 - -
4 Sobic.003G275400 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
5 Sobic.008G141900 ZOS12-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.001G010500 frigida, putative, expressed -
7 Sobic.002G064800 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
8 Sobic.010G062900 expressed protein -
9 Sobic.002G286632 - -
10 Sobic.006G081700 - -
11 Sobic.008G121501 - -
12 Sobic.009G012300 phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative, expressed K01933: phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase
13 Sobic.004G276000 - -
14 Sobic.002G383700 4-alpha-glucanotransferase, chloroplast precursor, putative, expressed K00705: 4-alpha-glucanotransferase
15 Sobic.005G212201 - -
16 Sobic.009G178500 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@LTPL67 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
17 Sobic.008G191700 - -
18 Sobic.002G309100 phosphate-induced protein 1 conserved region domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G215200 expressed protein -
20 Sobic.005G206100 cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G162800 Sobic005G162800 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic005G162800--Sobic009G168200 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic005G162800--Sobic009G163400 Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic005G162800--Sobic001G376501 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic005G162800--Sobic003G275400 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic005G162800--Sobic008G141900 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic005G162800--Sobic001G010500 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic005G162800--Sobic002G064800 Sobic010G062900 Sobic010G062900 Sobic005G162800--Sobic010G062900 Sobic002G286632 Sobic002G286632 Sobic005G162800--Sobic002G286632 Sobic009G168200--Sobic003G275400 Sobic009G168200--Sobic008G141900 Sobic009G168200--Sobic009G163400 Sobic009G168200--Sobic001G376501 Sobic009G168200--Sobic002G286632 Sobic009G168200--Sobic001G010500 Sobic006G081700 Sobic006G081700 Sobic009G168200--Sobic006G081700 Sobic009G168200--Sobic002G064800 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic009G168200--Sobic005G212201 Sobic009G163400--Sobic001G376501 Sobic009G163400--Sobic008G141900 Sobic009G163400--Sobic001G010500 Sobic008G121501 Sobic008G121501 Sobic009G163400--Sobic008G121501 Sobic002G309100 Sobic002G309100 Sobic009G163400--Sobic002G309100 Sobic009G163400--Sobic002G064800 Sobic001G257650 Sobic001G257650 Sobic009G163400--Sobic001G257650 Sobic009G163400--Sobic003G275400 Sobic009G163400--Sobic009G168200 Sobic001G376501--Sobic002G064800 Sobic001G376501--Sobic009G163400 Sobic001G376501--Sobic008G141900 Sobic001G376501--Sobic001G257650 Sobic001G376501--Sobic008G121501 Sobic001G376501--Sobic005G212201 Sobic001G376501--Sobic001G010500 Sobic004G276000 Sobic004G276000 Sobic001G376501--Sobic004G276000 Sobic001G376501--Sobic003G275400 Sobic003G275400--Sobic009G168200 Sobic003G275400--Sobic009G163400 Sobic003G275400--Sobic001G376501 Sobic003G275400--Sobic002G064800 Sobic003G275400--Sobic008G141900 Sobic008G191700 Sobic008G191700 Sobic003G275400--Sobic008G191700 Sobic003G275400--Sobic008G121501 Sobic001G485500 Sobic001G485500 Sobic003G275400--Sobic001G485500 Sobic005G206100 Sobic005G206100 Sobic003G275400--Sobic005G206100 Sobic008G141900--Sobic009G163400 Sobic008G141900--Sobic001G376501 Sobic008G141900--Sobic002G064800 Sobic008G141900--Sobic005G212201 Sobic008G141900--Sobic009G168200 Sobic008G141900--Sobic004G276000 Sobic008G141900--Sobic001G010500 Sobic008G141900--Sobic003G275400 Sobic008G141900--Sobic001G257650 Sobic001G010500--Sobic009G163400 Sobic001G010500--Sobic002G309100 Sobic001G010500--Sobic001G376501 Sobic001G010500--Sobic008G141900 Sobic001G010500--Sobic001G257650 Sobic003G009000 Sobic003G009000 Sobic001G010500--Sobic003G009000 Sobic001G130600 Sobic001G130600 Sobic001G010500--Sobic001G130600 Sobic001G010500--Sobic008G121501 Sobic003G005500 Sobic003G005500 Sobic001G010500--Sobic003G005500 Sobic002G064800--Sobic005G212201 Sobic002G064800--Sobic001G376501 Sobic002G064800--Sobic008G191700 Sobic002G064800--Sobic005G206100 Sobic002G064800--Sobic004G276000 Sobic002G064800--Sobic008G141900 Sobic002G064800--Sobic009G163400 Sobic010G211200 Sobic010G211200 Sobic002G064800--Sobic010G211200 Sobic002G064800--Sobic003G275400 Sobic010G062900--Sobic002G309100 Sobic010G062900--Sobic003G009000 Sobic009G098700 Sobic009G098700 Sobic010G062900--Sobic009G098700 Sobic010G073900 Sobic010G073900 Sobic010G062900--Sobic010G073900 Sobic001G485700 Sobic001G485700 Sobic010G062900--Sobic001G485700 Sobic001G183666 Sobic001G183666 Sobic010G062900--Sobic001G183666 Sobic006G239500 Sobic006G239500 Sobic010G062900--Sobic006G239500 Sobic010G062900--Sobic001G130600 Sobic010G005100 Sobic010G005100 Sobic010G062900--Sobic010G005100 Sobic002G286632--Sobic009G168200 Sobic002G286632--Sobic006G081700 Sobic002G286632--Sobic009G163400 Sobic005G034200 Sobic005G034200 Sobic002G286632--Sobic005G034200 Sobic002G286632--Sobic008G141900 Sobic002G286632--Sobic003G005500 Sobic002G286632--Sobic001G010500 Sobic002G173400 Sobic002G173400 Sobic002G286632--Sobic002G173400 Sobic008G180200 Sobic008G180200 Sobic002G286632--Sobic008G180200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.