Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G012300.2,Sobic.009G012300.1
Synonym Sb09g001230, ATPURM, PUR5
Functional annotation phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative, expressed
UniProt C5YYH7 , A0A1Z5R0B6
Pfam PF00586 PF02769
Panther DB PTHR10520
NCBI CDD -
KEGG Orthology K01933; phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G55010 : phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase, chloroplast / phosphoribosyl-aminoimidazole synthetase / AIR synthase (PUR5)
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g61600.1 : phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033858 , Zm00025a015910 , Zm00025a043180
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G022400.1 , HORVU2Hr1G022400.2 , HORVU2Hr1G022400.3 , HORVU5Hr1G014280.1 , HORVU5Hr1G014280.2 , HORVU5Hr1G014280.3
Wheat TraesCS5A02G057700 , TraesCS5D02G068900 , TraesCS5D02G068900 , TraesCS5B02G059100
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G012300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic009G012300 Sobic009G012300 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic009G012300--Sobic009G168200 Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic009G012300--Sobic001G376501 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic009G012300--Sobic002G064800 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic009G012300--Sobic008G141900 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic009G012300--Sobic005G212201 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic009G012300--Sobic001G010500 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic009G012300--Sobic009G163400 Sobic008G191700 Sobic008G191700 Sobic009G012300--Sobic008G191700 Sobic010G211200 Sobic010G211200 Sobic009G012300--Sobic010G211200 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic009G168200--Sobic003G275400 Sobic009G168200--Sobic008G141900 Sobic009G168200--Sobic009G163400 Sobic009G168200--Sobic001G376501 Sobic002G286632 Sobic002G286632 Sobic009G168200--Sobic002G286632 Sobic009G168200--Sobic001G010500 Sobic006G081700 Sobic006G081700 Sobic009G168200--Sobic006G081700 Sobic009G168200--Sobic002G064800 Sobic009G168200--Sobic005G212201 Sobic001G376501--Sobic002G064800 Sobic001G376501--Sobic009G163400 Sobic001G376501--Sobic008G141900 Sobic001G257650 Sobic001G257650 Sobic001G376501--Sobic001G257650 Sobic008G121501 Sobic008G121501 Sobic001G376501--Sobic008G121501 Sobic001G376501--Sobic005G212201 Sobic001G376501--Sobic001G010500 Sobic004G276000 Sobic004G276000 Sobic001G376501--Sobic004G276000 Sobic001G376501--Sobic003G275400 Sobic002G064800--Sobic005G212201 Sobic002G064800--Sobic001G376501 Sobic002G064800--Sobic008G191700 Sobic005G206100 Sobic005G206100 Sobic002G064800--Sobic005G206100 Sobic002G064800--Sobic004G276000 Sobic002G064800--Sobic008G141900 Sobic002G064800--Sobic009G163400 Sobic002G064800--Sobic010G211200 Sobic002G064800--Sobic003G275400 Sobic008G141900--Sobic009G163400 Sobic008G141900--Sobic001G376501 Sobic008G141900--Sobic002G064800 Sobic008G141900--Sobic005G212201 Sobic008G141900--Sobic009G168200 Sobic008G141900--Sobic004G276000 Sobic008G141900--Sobic001G010500 Sobic008G141900--Sobic003G275400 Sobic008G141900--Sobic001G257650 Sobic005G212201--Sobic002G064800 Sobic005G212201--Sobic008G191700 Sobic005G212201--Sobic001G376501 Sobic005G212201--Sobic005G206100 Sobic005G212201--Sobic010G211200 Sobic005G212201--Sobic008G141900 Sobic005G212201--Sobic004G276000 Sobic009G241900 Sobic009G241900 Sobic005G212201--Sobic009G241900 Sobic004G222150 Sobic004G222150 Sobic005G212201--Sobic004G222150 Sobic001G010500--Sobic009G163400 Sobic002G309100 Sobic002G309100 Sobic001G010500--Sobic002G309100 Sobic001G010500--Sobic001G376501 Sobic001G010500--Sobic008G141900 Sobic001G010500--Sobic001G257650 Sobic003G009000 Sobic003G009000 Sobic001G010500--Sobic003G009000 Sobic001G130600 Sobic001G130600 Sobic001G010500--Sobic001G130600 Sobic001G010500--Sobic008G121501 Sobic003G005500 Sobic003G005500 Sobic001G010500--Sobic003G005500 Sobic009G163400--Sobic001G376501 Sobic009G163400--Sobic008G141900 Sobic009G163400--Sobic001G010500 Sobic009G163400--Sobic008G121501 Sobic009G163400--Sobic002G309100 Sobic009G163400--Sobic002G064800 Sobic009G163400--Sobic001G257650 Sobic009G163400--Sobic003G275400 Sobic009G163400--Sobic009G168200 Sobic008G191700--Sobic009G241900 Sobic008G191700--Sobic002G064800 Sobic008G191700--Sobic010G211200 Sobic003G427000 Sobic003G427000 Sobic008G191700--Sobic003G427000 Sobic008G191700--Sobic005G206100 Sobic008G191700--Sobic005G212201 Sobic008G191700--Sobic004G222150 Sobic008G191700--Sobic004G276000 Sobic008G191700--Sobic003G275400 Sobic010G211200--Sobic004G222150 Sobic010G211200--Sobic009G241900 Sobic010G211200--Sobic008G191700 Sobic010G211200--Sobic003G427000 Sobic010G211200--Sobic005G212201 Sobic010G211200--Sobic002G064800 Sobic010G211200--Sobic005G206100 Sobic003G285900 Sobic003G285900 Sobic010G211200--Sobic003G285900 Sobic001G393101 Sobic001G393101 Sobic010G211200--Sobic001G393101
Octagon: transcription factors


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