Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G081700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PKY1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G286632 - -
2 Sobic.009G168200 expressed protein -
3 Sobic.005G034200 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G210500 - K10901: BLM, RECQL3, bloom syndrome protein
5 Sobic.003G379900 plus-3 domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G141900 ZOS12-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
7 Sobic.010G087100 MCM9 - Putative minichromosome maintenance MCM family subunit 9, expressed K10738: DNA helicase MCM9
8 Sobic.003G005500 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G336400 OsFBLD4 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
10 Sobic.008G180200 expressed protein -
11 Sobic.005G162800 expressed protein -
12 Sobic.001G506300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@xyloglucan galactosyltransferase KATAMARI1, putative, expressed -
13 Sobic.004G215200 expressed protein -
14 Sobic.009G163400 growth regulator related protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G030000 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G252200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G238800 mago nashi, putative, expressed K12877: protein mago nashi
18 Sobic.001G010500 frigida, putative, expressed -
19 Sobic.003G045450 - -
20 Sobic.010G257500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G081700 Sobic006G081700 Sobic002G286632 Sobic002G286632 Sobic006G081700--Sobic002G286632 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic006G081700--Sobic009G168200 Sobic005G034200 Sobic005G034200 Sobic006G081700--Sobic005G034200 Sobic005G210500 Sobic005G210500 Sobic006G081700--Sobic005G210500 Sobic003G379900 Sobic003G379900 Sobic006G081700--Sobic003G379900 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic006G081700--Sobic008G141900 Sobic010G087100 Sobic010G087100 Sobic006G081700--Sobic010G087100 Sobic003G005500 Sobic003G005500 Sobic006G081700--Sobic003G005500 Sobic002G336400 Sobic002G336400 Sobic006G081700--Sobic002G336400 Sobic002G286632--Sobic009G168200 Sobic002G286632--Sobic006G081700 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic002G286632--Sobic009G163400 Sobic002G286632--Sobic005G034200 Sobic002G286632--Sobic008G141900 Sobic002G286632--Sobic003G005500 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic002G286632--Sobic001G010500 Sobic002G173400 Sobic002G173400 Sobic002G286632--Sobic002G173400 Sobic008G180200 Sobic008G180200 Sobic002G286632--Sobic008G180200 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic009G168200--Sobic003G275400 Sobic009G168200--Sobic008G141900 Sobic009G168200--Sobic009G163400 Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic009G168200--Sobic001G376501 Sobic009G168200--Sobic002G286632 Sobic009G168200--Sobic001G010500 Sobic009G168200--Sobic006G081700 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic009G168200--Sobic002G064800 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic009G168200--Sobic005G212201 Sobic005G034200--Sobic002G286632 Sobic005G034200--Sobic003G379900 Sobic005G034200--Sobic006G081700 Sobic005G034200--Sobic009G168200 Sobic009G178500 Sobic009G178500 Sobic005G034200--Sobic009G178500 Sobic005G034200--Sobic010G087100 Sobic002G238800 Sobic002G238800 Sobic005G034200--Sobic002G238800 Sobic003G326500 Sobic003G326500 Sobic005G034200--Sobic003G326500 Sobic003G423800 Sobic003G423800 Sobic005G034200--Sobic003G423800 Sobic003G418400 Sobic003G418400 Sobic005G210500--Sobic003G418400 Sobic001G486600 Sobic001G486600 Sobic005G210500--Sobic001G486600 Sobic009G214500 Sobic009G214500 Sobic005G210500--Sobic009G214500 Sobic010G038200 Sobic010G038200 Sobic005G210500--Sobic010G038200 Sobic001G117900 Sobic001G117900 Sobic005G210500--Sobic001G117900 Sobic005G210500--Sobic003G005500 Sobic010G252200 Sobic010G252200 Sobic005G210500--Sobic010G252200 Sobic007G102300 Sobic007G102300 Sobic005G210500--Sobic007G102300 Sobic010G030000 Sobic010G030000 Sobic005G210500--Sobic010G030000 Sobic003G379900--Sobic002G238800 Sobic002G420400 Sobic002G420400 Sobic003G379900--Sobic002G420400 Sobic003G379900--Sobic005G034200 Sobic003G379900--Sobic010G087100 Sobic003G042200 Sobic003G042200 Sobic003G379900--Sobic003G042200 Sobic004G339900 Sobic004G339900 Sobic003G379900--Sobic004G339900 Sobic001G081800 Sobic001G081800 Sobic003G379900--Sobic001G081800 Sobic006G184200 Sobic006G184200 Sobic003G379900--Sobic006G184200 Sobic005G036200 Sobic005G036200 Sobic003G379900--Sobic005G036200 Sobic008G141900--Sobic009G163400 Sobic008G141900--Sobic001G376501 Sobic008G141900--Sobic002G064800 Sobic008G141900--Sobic005G212201 Sobic008G141900--Sobic009G168200 Sobic004G276000 Sobic004G276000 Sobic008G141900--Sobic004G276000 Sobic008G141900--Sobic001G010500 Sobic008G141900--Sobic003G275400 Sobic001G257650 Sobic001G257650 Sobic008G141900--Sobic001G257650 Sobic002G095300 Sobic002G095300 Sobic010G087100--Sobic002G095300 Sobic010G087100--Sobic003G379900 Sobic001G506300 Sobic001G506300 Sobic010G087100--Sobic001G506300 Sobic002G131100 Sobic002G131100 Sobic010G087100--Sobic002G131100 Sobic008G090400 Sobic008G090400 Sobic010G087100--Sobic008G090400 Sobic008G118100 Sobic008G118100 Sobic010G087100--Sobic008G118100 Sobic010G087100--Sobic002G238800 Sobic008G160600 Sobic008G160600 Sobic010G087100--Sobic008G160600 Sobic009G002200 Sobic009G002200 Sobic010G087100--Sobic009G002200 Sobic003G005500--Sobic001G010500 Sobic003G005500--Sobic007G102300 Sobic003G005500--Sobic009G163400 Sobic003G005500--Sobic009G214500 Sobic002G339666 Sobic002G339666 Sobic003G005500--Sobic002G339666 Sobic003G005500--Sobic008G141900 Sobic007G122700 Sobic007G122700 Sobic003G005500--Sobic007G122700 Sobic003G005500--Sobic002G286632 Sobic002G309100 Sobic002G309100 Sobic003G005500--Sobic002G309100 Sobic004G198300 Sobic004G198300 Sobic002G336400--Sobic004G198300 Sobic003G293400 Sobic003G293400 Sobic002G336400--Sobic003G293400 Sobic005G048600 Sobic005G048600 Sobic002G336400--Sobic005G048600 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic002G336400--Sobic002G239400 Sobic003G044000 Sobic003G044000 Sobic002G336400--Sobic003G044000 Sobic002G336400--Sobic001G117900 Sobic002G348400 Sobic002G348400 Sobic002G336400--Sobic002G348400 Sobic001G131900 Sobic001G131900 Sobic002G336400--Sobic001G131900 Sobic006G189000 Sobic006G189000 Sobic002G336400--Sobic006G189000
Octagon: transcription factors


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