Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G005500.1,Sobic.003G005500.6,Sobic.003G005500.2,Sobic.003G005500.4
Synonym
Functional annotation B3 DNA binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A1W0VVD3 , A0A1B6Q0R0 , A0A1B6Q0L5 , A0A1B6Q0M7
Pfam PF02362
Panther DB PTHR31391 PTHR31391:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G19184 : AP2/B3-like transcriptional factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g13300.1 : B3 DNA binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G010500 frigida, putative, expressed -
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Gene co-expression network
sample Sobic003G005500 Sobic003G005500 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic003G005500--Sobic001G010500 Sobic007G102300 Sobic007G102300 Sobic003G005500--Sobic007G102300 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic003G005500--Sobic009G163400 Sobic009G214500 Sobic009G214500 Sobic003G005500--Sobic009G214500 Sobic002G339666 Sobic002G339666 Sobic003G005500--Sobic002G339666 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic003G005500--Sobic008G141900 Sobic007G122700 Sobic007G122700 Sobic003G005500--Sobic007G122700 Sobic002G286632 Sobic002G286632 Sobic003G005500--Sobic002G286632 Sobic002G309100 Sobic002G309100 Sobic003G005500--Sobic002G309100 Sobic001G010500--Sobic009G163400 Sobic001G010500--Sobic002G309100 Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic001G010500--Sobic001G376501 Sobic001G010500--Sobic008G141900 Sobic001G257650 Sobic001G257650 Sobic001G010500--Sobic001G257650 Sobic003G009000 Sobic003G009000 Sobic001G010500--Sobic003G009000 Sobic001G130600 Sobic001G130600 Sobic001G010500--Sobic001G130600 Sobic008G121501 Sobic008G121501 Sobic001G010500--Sobic008G121501 Sobic001G010500--Sobic003G005500 Sobic007G102300--Sobic009G214500 Sobic005G060100 Sobic005G060100 Sobic007G102300--Sobic005G060100 Sobic001G385300 Sobic001G385300 Sobic007G102300--Sobic001G385300 Sobic009G220700 Sobic009G220700 Sobic007G102300--Sobic009G220700 Sobic003G217800 Sobic003G217800 Sobic007G102300--Sobic003G217800 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic007G102300--Sobic003G352900 Sobic003G216600 Sobic003G216600 Sobic007G102300--Sobic003G216600 Sobic002G299500 Sobic002G299500 Sobic007G102300--Sobic002G299500 Sobic007G102300--Sobic003G005500 Sobic009G163400--Sobic001G376501 Sobic009G163400--Sobic008G141900 Sobic009G163400--Sobic001G010500 Sobic009G163400--Sobic008G121501 Sobic009G163400--Sobic002G309100 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic009G163400--Sobic002G064800 Sobic009G163400--Sobic001G257650 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic009G163400--Sobic003G275400 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic009G163400--Sobic009G168200 Sobic009G214500--Sobic007G102300 Sobic009G214500--Sobic001G385300 Sobic007G102000 Sobic007G102000 Sobic009G214500--Sobic007G102000 Sobic009G163100 Sobic009G163100 Sobic009G214500--Sobic009G163100 Sobic001G327100 Sobic001G327100 Sobic009G214500--Sobic001G327100 Sobic001G380700 Sobic001G380700 Sobic009G214500--Sobic001G380700 Sobic003G376900 Sobic003G376900 Sobic009G214500--Sobic003G376900 Sobic004G241300 Sobic004G241300 Sobic009G214500--Sobic004G241300 Sobic003G423700 Sobic003G423700 Sobic009G214500--Sobic003G423700 Sobic002G339666--Sobic001G010500 Sobic002G339666--Sobic001G257650 Sobic002G339666--Sobic002G309100 Sobic002G339666--Sobic003G009000 Sobic001G485700 Sobic001G485700 Sobic002G339666--Sobic001G485700 Sobic002G339666--Sobic001G130600 Sobic002G339666--Sobic007G102300 Sobic009G098700 Sobic009G098700 Sobic002G339666--Sobic009G098700 Sobic002G339666--Sobic003G005500 Sobic008G141900--Sobic009G163400 Sobic008G141900--Sobic001G376501 Sobic008G141900--Sobic002G064800 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic008G141900--Sobic005G212201 Sobic008G141900--Sobic009G168200 Sobic004G276000 Sobic004G276000 Sobic008G141900--Sobic004G276000 Sobic008G141900--Sobic001G010500 Sobic008G141900--Sobic003G275400 Sobic008G141900--Sobic001G257650 Sobic007G122700--Sobic003G005500 Sobic007G122700--Sobic009G163400 Sobic007G122700--Sobic008G141900 Sobic003G045450 Sobic003G045450 Sobic007G122700--Sobic003G045450 Sobic007G122700--Sobic001G010500 Sobic007G122700--Sobic004G276000 Sobic007G122700--Sobic001G376501 Sobic008G046200 Sobic008G046200 Sobic007G122700--Sobic008G046200 Sobic006G119900 Sobic006G119900 Sobic007G122700--Sobic006G119900 Sobic002G286632--Sobic009G168200 Sobic006G081700 Sobic006G081700 Sobic002G286632--Sobic006G081700 Sobic002G286632--Sobic009G163400 Sobic005G034200 Sobic005G034200 Sobic002G286632--Sobic005G034200 Sobic002G286632--Sobic008G141900 Sobic002G286632--Sobic003G005500 Sobic002G286632--Sobic001G010500 Sobic002G173400 Sobic002G173400 Sobic002G286632--Sobic002G173400 Sobic008G180200 Sobic008G180200 Sobic002G286632--Sobic008G180200 Sobic010G062900 Sobic010G062900 Sobic002G309100--Sobic010G062900 Sobic002G309100--Sobic003G009000 Sobic002G309100--Sobic001G010500 Sobic002G309100--Sobic009G163400 Sobic002G309100--Sobic009G098700 Sobic002G309100--Sobic001G485700 Sobic002G309100--Sobic001G257650 Sobic002G309100--Sobic008G121501 Sobic002G309100--Sobic001G130600
Octagon: transcription factors


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