Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G046200.1
Synonym Sb08g003910
Functional annotation PHD-finger family protein, expressed
UniProt A0A1Z5R4X2
Pfam -
Panther DB PTHR33304 PTHR33304:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G02890 : RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g06130.1 : PHD-finger family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G144600 - -
2 Sobic.003G005500 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.007G122700 expressed protein -
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6 Sobic.009G012400 RPA1C - Putative single-stranded DNA binding complex subunit 1, expressed K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
7 Sobic.004G222200 - -
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9 Sobic.003G183466 - -
10 Sobic.004G222150 - -
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12 Sobic.009G163400 growth regulator related protein, putative, expressed -
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14 Sobic.003G423800 endonuclease, putative, expressed K08991: crossover junction endonuclease MUS81
15 Sobic.002G173400 expressed protein -
16 Sobic.002G052800 FAR1 family protein, expressed -
17 Sobic.007G014100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
18 Sobic.001G010500 frigida, putative, expressed -
19 Sobic.002G206750 - -
20 Sobic.004G123200 MYB family transcription factor, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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