Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G183466.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VXX0
Pfam -
Panther DB PTHR10706 PTHR10706:SF131
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G07610 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g35060.2 : OsFBX238 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G326500 apurinic endonuclease-redox protein, putative, expressed K01142: E3.1.11.2, exodeoxyribonuclease III
2 Sobic.010G143600 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G173400 expressed protein -
4 Sobic.003G129500 argonaute, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
5 Sobic.004G278900 regulatory protein, putative, expressed -
6 Sobic.009G120400 methyltransferase, putative, expressed -
7 Sobic.002G095300 deoxynucleoside kinase family, putative, expressed K00893: deoxycitidine kinase
8 Sobic.002G286632 - -
9 Sobic.008G046200 PHD-finger family protein, expressed -
10 Sobic.002G066800 RNA ligase isoform 1, putative, expressed -
11 Sobic.002G426100 aldehyde dehydrogenase, putative, expressed -
12 Sobic.002G078100 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G184666 - -
14 Sobic.007G122700 expressed protein -
15 Sobic.006G106600 arsenical pump-driving ATPase, putative, expressed K01551: arsA, ASNA1, arsenite/tail-anchored protein-transporting ATPase
16 Sobic.004G000400 OsPDIL1-4 protein disulfide isomerase PDIL1-4, expressed K09580: PDIA1, protein disulfide-isomerase A1
17 Sobic.002G123600 expressed protein -
18 Sobic.003G194800 EF hand family protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G229300 expressed protein -
20 Sobic.008G141900 ZOS12-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed -


Gene co-expression network
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Sobic004G222200 Sobic008G046200--Sobic004G222200 Sobic008G046200--Sobic008G141900 Sobic008G046200--Sobic003G183466
Octagon: transcription factors


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