Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G153000.2,Sobic.005G153000.3
Synonym DUF6, ATDUF6
Functional annotation agenet domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RIT8 , A0A1Z5RJ74
Pfam PF05266 PF05641 PF05641 PF05266
Panther DB PTHR31917 PTHR31917:SF18 PTHR31917:SF18 PTHR31917
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G47220 : DOMAIN OF UNKNOWN FUNCTION 724 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g35050.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034098 , Zm00025a015745
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G153000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G077300 protein kinase, putative, expressed -
2 Sobic.002G168000 expressed protein -
3 Sobic.004G282601 - -
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5 Sobic.003G290400 glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
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13 Sobic.005G163400 dnaJ domain containing protein, expressed -
14 Sobic.009G127800 BZIP protein, putative, expressed -
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17 Sobic.002G021200 expressed protein K19001: HELLS, ATP-dependent DNA helicase
18 Sobic.002G279400 DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G143200 DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G052300 plant protein of unknown function DUF869 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G153000 Sobic005G153000 Sobic009G077300 Sobic009G077300 Sobic005G153000--Sobic009G077300 Sobic002G168000 Sobic002G168000 Sobic005G153000--Sobic002G168000 Sobic004G282601 Sobic004G282601 Sobic005G153000--Sobic004G282601 Sobic010G037901 Sobic010G037901 Sobic005G153000--Sobic010G037901 Sobic003G290400 Sobic003G290400 Sobic005G153000--Sobic003G290400 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic005G153000--Sobic007G187700 Sobic006G221300 Sobic006G221300 Sobic005G153000--Sobic006G221300 Sobic003G129500 Sobic003G129500 Sobic005G153000--Sobic003G129500 Sobic005G196600 Sobic005G196600 Sobic005G153000--Sobic005G196600 Sobic009G077300--Sobic005G153000 Sobic009G077300--Sobic006G221300 Sobic001G054700 Sobic001G054700 Sobic009G077300--Sobic001G054700 Sobic005G163400 Sobic005G163400 Sobic009G077300--Sobic005G163400 Sobic009G077300--Sobic002G168000 Sobic002G050700 Sobic002G050700 Sobic009G077300--Sobic002G050700 Sobic009G077300--Sobic004G282601 Sobic009G143200 Sobic009G143200 Sobic009G077300--Sobic009G143200 Sobic009G077300--Sobic007G187700 Sobic002G168000--Sobic007G187700 Sobic002G168000--Sobic005G153000 Sobic002G021200 Sobic002G021200 Sobic002G168000--Sobic002G021200 Sobic006G281900 Sobic006G281900 Sobic002G168000--Sobic006G281900 Sobic006G275500 Sobic006G275500 Sobic002G168000--Sobic006G275500 Sobic009G188900 Sobic009G188900 Sobic002G168000--Sobic009G188900 Sobic002G168000--Sobic009G077300 Sobic006G016700 Sobic006G016700 Sobic002G168000--Sobic006G016700 Sobic001G104500 Sobic001G104500 Sobic002G168000--Sobic001G104500 Sobic004G282601--Sobic005G153000 Sobic004G282601--Sobic001G104500 Sobic004G282601--Sobic010G037901 Sobic004G282601--Sobic009G077300 Sobic009G002200 Sobic009G002200 Sobic004G282601--Sobic009G002200 Sobic004G282601--Sobic007G187700 Sobic004G282601--Sobic003G290400 Sobic004G282601--Sobic006G221300 Sobic004G282601--Sobic005G196600 Sobic010G037901--Sobic005G196600 Sobic006G226000 Sobic006G226000 Sobic010G037901--Sobic006G226000 Sobic003G086800 Sobic003G086800 Sobic010G037901--Sobic003G086800 Sobic009G031800 Sobic009G031800 Sobic010G037901--Sobic009G031800 Sobic009G188600 Sobic009G188600 Sobic010G037901--Sobic009G188600 Sobic010G037901--Sobic005G153000 Sobic006G135800 Sobic006G135800 Sobic010G037901--Sobic006G135800 Sobic007G160400 Sobic007G160400 Sobic010G037901--Sobic007G160400 Sobic010G037901--Sobic004G282601 Sobic003G290400--Sobic005G153000 Sobic003G290400--Sobic009G002200 Sobic003G290400--Sobic004G282601 Sobic003G290400--Sobic009G077300 Sobic003G290400--Sobic006G221300 Sobic002G027600 Sobic002G027600 Sobic003G290400--Sobic002G027600 Sobic003G290400--Sobic006G135800 Sobic007G162400 Sobic007G162400 Sobic003G290400--Sobic007G162400 Sobic003G259300 Sobic003G259300 Sobic003G290400--Sobic003G259300 Sobic007G187700--Sobic002G168000 Sobic007G187700--Sobic002G021200 Sobic007G187700--Sobic005G153000 Sobic007G187700--Sobic001G104500 Sobic001G377700 Sobic001G377700 Sobic007G187700--Sobic001G377700 Sobic007G187700--Sobic006G275500 Sobic004G317000 Sobic004G317000 Sobic007G187700--Sobic004G317000 Sobic007G187700--Sobic004G282601 Sobic007G187700--Sobic009G077300 Sobic009G127800 Sobic009G127800 Sobic006G221300--Sobic009G127800 Sobic006G221300--Sobic001G054700 Sobic006G221300--Sobic009G077300 Sobic006G221300--Sobic005G153000 Sobic006G221300--Sobic009G143200 Sobic004G108400 Sobic004G108400 Sobic006G221300--Sobic004G108400 Sobic004G052200 Sobic004G052200 Sobic006G221300--Sobic004G052200 Sobic009G225500 Sobic009G225500 Sobic006G221300--Sobic009G225500 Sobic008G052300 Sobic008G052300 Sobic006G221300--Sobic008G052300 Sobic003G129500--Sobic005G153000 Sobic002G112000 Sobic002G112000 Sobic003G129500--Sobic002G112000 Sobic003G129500--Sobic002G168000 Sobic009G012400 Sobic009G012400 Sobic003G129500--Sobic009G012400 Sobic010G250400 Sobic010G250400 Sobic003G129500--Sobic010G250400 Sobic003G423800 Sobic003G423800 Sobic003G129500--Sobic003G423800 Sobic003G370300 Sobic003G370300 Sobic003G129500--Sobic003G370300 Sobic010G222800 Sobic010G222800 Sobic003G129500--Sobic010G222800 Sobic003G183466 Sobic003G183466 Sobic003G129500--Sobic003G183466 Sobic005G196600--Sobic010G037901 Sobic005G196600--Sobic005G153000 Sobic005G196600--Sobic006G226000 Sobic005G196600--Sobic004G282601 Sobic005G196600--Sobic003G086800 Sobic005G196600--Sobic009G031800 Sobic001G136400 Sobic001G136400 Sobic005G196600--Sobic001G136400 Sobic002G055800 Sobic002G055800 Sobic005G196600--Sobic002G055800 Sobic005G196600--Sobic006G135800
Octagon: transcription factors


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