Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G221300.1
Synonym Sb06g029080
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YG71
Pfam -
Panther DB PTHR31071 PTHR31071:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G50660 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g53350.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057068 , Zm00025a054793 , Zm00025a009710
Brachypodium KQJ84699 , KQJ84698 , KQJ84700 , PNT70984 , PNT70982 , PNT70983
Barley -
Wheat TraesCS2A02G469100 , TraesCS2B02G492000 , TraesCS2D02G469200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G127800 BZIP protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G054700 seed specific protein Bn15D14A, putative, expressed -
3 Sobic.009G077300 protein kinase, putative, expressed -
4 Sobic.005G153000 agenet domain containing protein, expressed -
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6 Sobic.004G108400 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G052200 expressed protein -
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9 Sobic.008G052300 plant protein of unknown function DUF869 domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G101100 patellin protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G162400 ABC-2 type transporter domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G279400 DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.005G157300 protein binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G282601 - -
15 Sobic.002G050700 tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed -
16 Sobic.005G163400 dnaJ domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G021200 expressed protein K19001: HELLS, ATP-dependent DNA helicase
18 Sobic.006G142500 protein kinase, putative, expressed -
19 Sobic.006G124400 ATP binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G296000 HEAT repeat family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G221300 Sobic006G221300 Sobic009G127800 Sobic009G127800 Sobic006G221300--Sobic009G127800 Sobic001G054700 Sobic001G054700 Sobic006G221300--Sobic001G054700 Sobic009G077300 Sobic009G077300 Sobic006G221300--Sobic009G077300 Sobic005G153000 Sobic005G153000 Sobic006G221300--Sobic005G153000 Sobic009G143200 Sobic009G143200 Sobic006G221300--Sobic009G143200 Sobic004G108400 Sobic004G108400 Sobic006G221300--Sobic004G108400 Sobic004G052200 Sobic004G052200 Sobic006G221300--Sobic004G052200 Sobic009G225500 Sobic009G225500 Sobic006G221300--Sobic009G225500 Sobic008G052300 Sobic008G052300 Sobic006G221300--Sobic008G052300 Sobic009G127800--Sobic006G221300 Sobic009G127800--Sobic009G225500 Sobic009G127800--Sobic001G054700 Sobic006G142500 Sobic006G142500 Sobic009G127800--Sobic006G142500 Sobic009G127800--Sobic008G052300 Sobic002G279400 Sobic002G279400 Sobic009G127800--Sobic002G279400 Sobic007G162400 Sobic007G162400 Sobic009G127800--Sobic007G162400 Sobic002G027600 Sobic002G027600 Sobic009G127800--Sobic002G027600 Sobic005G157300 Sobic005G157300 Sobic009G127800--Sobic005G157300 Sobic001G054700--Sobic006G221300 Sobic001G054700--Sobic009G077300 Sobic001G054700--Sobic004G108400 Sobic001G054700--Sobic009G143200 Sobic002G050700 Sobic002G050700 Sobic001G054700--Sobic002G050700 Sobic006G124400 Sobic006G124400 Sobic001G054700--Sobic006G124400 Sobic001G054700--Sobic009G127800 Sobic001G054700--Sobic005G153000 Sobic006G221800 Sobic006G221800 Sobic001G054700--Sobic006G221800 Sobic009G077300--Sobic005G153000 Sobic009G077300--Sobic006G221300 Sobic009G077300--Sobic001G054700 Sobic005G163400 Sobic005G163400 Sobic009G077300--Sobic005G163400 Sobic002G168000 Sobic002G168000 Sobic009G077300--Sobic002G168000 Sobic009G077300--Sobic002G050700 Sobic004G282601 Sobic004G282601 Sobic009G077300--Sobic004G282601 Sobic009G077300--Sobic009G143200 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic009G077300--Sobic007G187700 Sobic005G153000--Sobic009G077300 Sobic005G153000--Sobic002G168000 Sobic005G153000--Sobic004G282601 Sobic010G037901 Sobic010G037901 Sobic005G153000--Sobic010G037901 Sobic003G290400 Sobic003G290400 Sobic005G153000--Sobic003G290400 Sobic005G153000--Sobic007G187700 Sobic005G153000--Sobic006G221300 Sobic003G129500 Sobic003G129500 Sobic005G153000--Sobic003G129500 Sobic005G196600 Sobic005G196600 Sobic005G153000--Sobic005G196600 Sobic009G143200--Sobic005G157300 Sobic004G317000 Sobic004G317000 Sobic009G143200--Sobic004G317000 Sobic009G143200--Sobic001G054700 Sobic003G055600 Sobic003G055600 Sobic009G143200--Sobic003G055600 Sobic009G143200--Sobic006G221300 Sobic009G143200--Sobic009G077300 Sobic009G143200--Sobic004G108400 Sobic009G143200--Sobic004G052200 Sobic009G143200--Sobic007G187700 Sobic004G108400--Sobic001G054700 Sobic004G108400--Sobic006G221300 Sobic004G108400--Sobic009G143200 Sobic001G452900 Sobic001G452900 Sobic004G108400--Sobic001G452900 Sobic007G008300 Sobic007G008300 Sobic004G108400--Sobic007G008300 Sobic004G108400--Sobic009G127800 Sobic004G108400--Sobic007G162400 Sobic004G108400--Sobic002G050700 Sobic009G101100 Sobic009G101100 Sobic004G108400--Sobic009G101100 Sobic004G052200--Sobic006G221300 Sobic004G052200--Sobic009G143200 Sobic004G052200--Sobic009G077300 Sobic004G052200--Sobic001G054700 Sobic004G052200--Sobic006G124400 Sobic007G218100 Sobic007G218100 Sobic004G052200--Sobic007G218100 Sobic006G275500 Sobic006G275500 Sobic004G052200--Sobic006G275500 Sobic001G104500 Sobic001G104500 Sobic004G052200--Sobic001G104500 Sobic002G230800 Sobic002G230800 Sobic004G052200--Sobic002G230800 Sobic009G225500--Sobic009G127800 Sobic003G259300 Sobic003G259300 Sobic009G225500--Sobic003G259300 Sobic009G225500--Sobic006G142500 Sobic009G225500--Sobic006G221300 Sobic010G086000 Sobic010G086000 Sobic009G225500--Sobic010G086000 Sobic001G425700 Sobic001G425700 Sobic009G225500--Sobic001G425700 Sobic004G179800 Sobic004G179800 Sobic009G225500--Sobic004G179800 Sobic006G272800 Sobic006G272800 Sobic009G225500--Sobic006G272800 Sobic006G281900 Sobic006G281900 Sobic009G225500--Sobic006G281900 Sobic004G269100 Sobic004G269100 Sobic008G052300--Sobic004G269100 Sobic003G104100 Sobic003G104100 Sobic008G052300--Sobic003G104100 Sobic008G052300--Sobic009G127800 Sobic008G052300--Sobic006G221300 Sobic008G052300--Sobic005G163400 Sobic002G259200 Sobic002G259200 Sobic008G052300--Sobic002G259200 Sobic006G016700 Sobic006G016700 Sobic008G052300--Sobic006G016700 Sobic008G052300--Sobic005G153000 Sobic008G052300--Sobic009G225500
Octagon: transcription factors


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