Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G196600.1
Synonym Sb05g025360
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y6Y2
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF16
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45470 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g17050.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK02445
Barley -
Wheat TraesCS7A02G520400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G037901 - -
2 Sobic.005G153000 agenet domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G226000 expressed protein -
4 Sobic.004G282601 - -
5 Sobic.003G086800 ZOS1-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.009G031800 - -
7 Sobic.001G136400 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@Desulfoglucosinolate sulfotransferase (At)(PubMedID : 27208977)@sulfotransferase domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G055800 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K16277: E3 ubiquitin-protein ligase DRIP
9 Sobic.006G135800 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
10 Sobic.003G001800 expressed protein -
11 Sobic.009G188600 lysM domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G104500 growth-regulating factor, putative, expressed -
13 Sobic.009G014800 - -
14 Sobic.009G057800 kelch repeat-containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G144600 - -
16 Sobic.009G188500 expressed protein -
17 Sobic.009G222400 expressed protein -
18 Sobic.003G282500 keratin, type I cytoskeletal 9, putative, expressed -
19 Sobic.007G187700 retinoblastoma-related protein-like, putative, expressed K04681: retinoblastoma-like protein 1
20 Sobic.007G160400 ZF-HD homeobox protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G196600 Sobic005G196600 Sobic010G037901 Sobic010G037901 Sobic005G196600--Sobic010G037901 Sobic005G153000 Sobic005G153000 Sobic005G196600--Sobic005G153000 Sobic006G226000 Sobic006G226000 Sobic005G196600--Sobic006G226000 Sobic004G282601 Sobic004G282601 Sobic005G196600--Sobic004G282601 Sobic003G086800 Sobic003G086800 Sobic005G196600--Sobic003G086800 Sobic009G031800 Sobic009G031800 Sobic005G196600--Sobic009G031800 Sobic001G136400 Sobic001G136400 Sobic005G196600--Sobic001G136400 Sobic002G055800 Sobic002G055800 Sobic005G196600--Sobic002G055800 Sobic006G135800 Sobic006G135800 Sobic005G196600--Sobic006G135800 Sobic010G037901--Sobic005G196600 Sobic010G037901--Sobic006G226000 Sobic010G037901--Sobic003G086800 Sobic010G037901--Sobic009G031800 Sobic009G188600 Sobic009G188600 Sobic010G037901--Sobic009G188600 Sobic010G037901--Sobic005G153000 Sobic010G037901--Sobic006G135800 Sobic007G160400 Sobic007G160400 Sobic010G037901--Sobic007G160400 Sobic010G037901--Sobic004G282601 Sobic009G077300 Sobic009G077300 Sobic005G153000--Sobic009G077300 Sobic002G168000 Sobic002G168000 Sobic005G153000--Sobic002G168000 Sobic005G153000--Sobic004G282601 Sobic005G153000--Sobic010G037901 Sobic003G290400 Sobic003G290400 Sobic005G153000--Sobic003G290400 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic005G153000--Sobic007G187700 Sobic006G221300 Sobic006G221300 Sobic005G153000--Sobic006G221300 Sobic003G129500 Sobic003G129500 Sobic005G153000--Sobic003G129500 Sobic005G153000--Sobic005G196600 Sobic006G226000--Sobic009G031800 Sobic006G226000--Sobic007G160400 Sobic006G226000--Sobic010G037901 Sobic006G226000--Sobic002G055800 Sobic002G256900 Sobic002G256900 Sobic006G226000--Sobic002G256900 Sobic004G123200 Sobic004G123200 Sobic006G226000--Sobic004G123200 Sobic006G226000--Sobic003G086800 Sobic002G240000 Sobic002G240000 Sobic006G226000--Sobic002G240000 Sobic006G226000--Sobic001G136400 Sobic004G282601--Sobic005G153000 Sobic001G104500 Sobic001G104500 Sobic004G282601--Sobic001G104500 Sobic004G282601--Sobic010G037901 Sobic004G282601--Sobic009G077300 Sobic009G002200 Sobic009G002200 Sobic004G282601--Sobic009G002200 Sobic004G282601--Sobic007G187700 Sobic004G282601--Sobic003G290400 Sobic004G282601--Sobic006G221300 Sobic004G282601--Sobic005G196600 Sobic003G086800--Sobic010G037901 Sobic003G086800--Sobic007G160400 Sobic003G086800--Sobic006G226000 Sobic003G086800--Sobic002G256900 Sobic004G142400 Sobic004G142400 Sobic003G086800--Sobic004G142400 Sobic009G014800 Sobic009G014800 Sobic003G086800--Sobic009G014800 Sobic003G086800--Sobic004G123200 Sobic006G083900 Sobic006G083900 Sobic003G086800--Sobic006G083900 Sobic001G203350 Sobic001G203350 Sobic003G086800--Sobic001G203350 Sobic009G031800--Sobic006G226000 Sobic009G031800--Sobic007G160400 Sobic009G031800--Sobic010G037901 Sobic009G012500 Sobic009G012500 Sobic009G031800--Sobic009G012500 Sobic005G126701 Sobic005G126701 Sobic009G031800--Sobic005G126701 Sobic001G254700 Sobic001G254700 Sobic009G031800--Sobic001G254700 Sobic009G031800--Sobic006G083900 Sobic007G025600 Sobic007G025600 Sobic009G031800--Sobic007G025600 Sobic001G534200 Sobic001G534200 Sobic009G031800--Sobic001G534200 Sobic001G136400--Sobic009G014800 Sobic001G136400--Sobic009G012500 Sobic001G136400--Sobic001G203350 Sobic010G053400 Sobic010G053400 Sobic001G136400--Sobic010G053400 Sobic001G136400--Sobic002G240000 Sobic008G149300 Sobic008G149300 Sobic001G136400--Sobic008G149300 Sobic009G246250 Sobic009G246250 Sobic001G136400--Sobic009G246250 Sobic001G136400--Sobic006G083900 Sobic002G197700 Sobic002G197700 Sobic001G136400--Sobic002G197700 Sobic002G055800--Sobic004G123200 Sobic002G055800--Sobic006G226000 Sobic002G055800--Sobic001G136400 Sobic001G366300 Sobic001G366300 Sobic002G055800--Sobic001G366300 Sobic003G001800 Sobic003G001800 Sobic002G055800--Sobic003G001800 Sobic002G055800--Sobic009G012500 Sobic002G055800--Sobic006G083900 Sobic002G055800--Sobic002G240000 Sobic002G055800--Sobic004G142400 Sobic001G493100 Sobic001G493100 Sobic006G135800--Sobic001G493100 Sobic006G135800--Sobic010G037901 Sobic006G135800--Sobic006G226000 Sobic006G172000 Sobic006G172000 Sobic006G135800--Sobic006G172000 Sobic006G135800--Sobic009G002200 Sobic006G135800--Sobic005G153000 Sobic007G192200 Sobic007G192200 Sobic006G135800--Sobic007G192200 Sobic006G135800--Sobic009G031800 Sobic006G135800--Sobic007G160400
Octagon: transcription factors


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