Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G188500.1
Synonym Sb09g024750
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z0G1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g42240.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044142
Brachypodium PNT70968
Barley -
Wheat TraesCS1A02G321600 , TraesCS1B02G334000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G037901 - -
2 Sobic.003G086800 ZOS1-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
3 Sobic.009G208300 TOO MANY MOUTHS precursor, putative, expressed -
4 Sobic.005G153000 agenet domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G279400 DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G144600 - -
7 Sobic.006G197400 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
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10 Sobic.007G209200 CUP-SHAPED COTYLEDON3, putative, expressed -
11 Sobic.005G196600 expressed protein -
12 Sobic.001G493100 LTPL82 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
13 Sobic.001G068132 - -
14 Sobic.005G163400 dnaJ domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G052200 expressed protein -
16 Sobic.006G221300 expressed protein -
17 Sobic.004G282601 - -
18 Sobic.001G390400 expressed protein -
19 Sobic.001G038450 - -
20 Sobic.009G057800 kelch repeat-containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G188500 Sobic009G188500 Sobic010G037901 Sobic010G037901 Sobic009G188500--Sobic010G037901 Sobic003G086800 Sobic003G086800 Sobic009G188500--Sobic003G086800 Sobic009G208300 Sobic009G208300 Sobic009G188500--Sobic009G208300 Sobic005G153000 Sobic005G153000 Sobic009G188500--Sobic005G153000 Sobic002G279400 Sobic002G279400 Sobic009G188500--Sobic002G279400 Sobic002G144600 Sobic002G144600 Sobic009G188500--Sobic002G144600 Sobic006G197400 Sobic006G197400 Sobic009G188500--Sobic006G197400 Sobic009G077300 Sobic009G077300 Sobic009G188500--Sobic009G077300 Sobic006G041700 Sobic006G041700 Sobic009G188500--Sobic006G041700 Sobic005G196600 Sobic005G196600 Sobic010G037901--Sobic005G196600 Sobic006G226000 Sobic006G226000 Sobic010G037901--Sobic006G226000 Sobic010G037901--Sobic003G086800 Sobic009G031800 Sobic009G031800 Sobic010G037901--Sobic009G031800 Sobic009G188600 Sobic009G188600 Sobic010G037901--Sobic009G188600 Sobic010G037901--Sobic005G153000 Sobic006G135800 Sobic006G135800 Sobic010G037901--Sobic006G135800 Sobic007G160400 Sobic007G160400 Sobic010G037901--Sobic007G160400 Sobic004G282601 Sobic004G282601 Sobic010G037901--Sobic004G282601 Sobic003G086800--Sobic010G037901 Sobic003G086800--Sobic007G160400 Sobic003G086800--Sobic006G226000 Sobic002G256900 Sobic002G256900 Sobic003G086800--Sobic002G256900 Sobic004G142400 Sobic004G142400 Sobic003G086800--Sobic004G142400 Sobic009G014800 Sobic009G014800 Sobic003G086800--Sobic009G014800 Sobic004G123200 Sobic004G123200 Sobic003G086800--Sobic004G123200 Sobic006G083900 Sobic006G083900 Sobic003G086800--Sobic006G083900 Sobic001G203350 Sobic001G203350 Sobic003G086800--Sobic001G203350 Sobic009G060800 Sobic009G060800 Sobic009G208300--Sobic009G060800 Sobic010G192500 Sobic010G192500 Sobic009G208300--Sobic010G192500 Sobic007G209200 Sobic007G209200 Sobic009G208300--Sobic007G209200 Sobic003G366000 Sobic003G366000 Sobic009G208300--Sobic003G366000 Sobic001G473500 Sobic001G473500 Sobic009G208300--Sobic001G473500 Sobic001G390400 Sobic001G390400 Sobic009G208300--Sobic001G390400 Sobic001G286700 Sobic001G286700 Sobic009G208300--Sobic001G286700 Sobic009G208300--Sobic009G188500 Sobic001G046400 Sobic001G046400 Sobic009G208300--Sobic001G046400 Sobic005G153000--Sobic009G077300 Sobic002G168000 Sobic002G168000 Sobic005G153000--Sobic002G168000 Sobic005G153000--Sobic004G282601 Sobic005G153000--Sobic010G037901 Sobic003G290400 Sobic003G290400 Sobic005G153000--Sobic003G290400 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic005G153000--Sobic007G187700 Sobic006G221300 Sobic006G221300 Sobic005G153000--Sobic006G221300 Sobic003G129500 Sobic003G129500 Sobic005G153000--Sobic003G129500 Sobic005G153000--Sobic005G196600 Sobic007G201900 Sobic007G201900 Sobic002G279400--Sobic007G201900 Sobic009G057800 Sobic009G057800 Sobic002G279400--Sobic009G057800 Sobic009G127800 Sobic009G127800 Sobic002G279400--Sobic009G127800 Sobic002G279400--Sobic006G221300 Sobic002G279400--Sobic005G153000 Sobic001G101700 Sobic001G101700 Sobic002G279400--Sobic001G101700 Sobic002G279400--Sobic009G188500 Sobic001G054700 Sobic001G054700 Sobic002G279400--Sobic001G054700 Sobic002G279400--Sobic009G208300 Sobic008G046200 Sobic008G046200 Sobic002G144600--Sobic008G046200 Sobic004G222200 Sobic004G222200 Sobic002G144600--Sobic004G222200 Sobic002G144600--Sobic009G188500 Sobic002G144600--Sobic005G153000 Sobic002G144600--Sobic005G196600 Sobic002G144600--Sobic006G197400 Sobic002G144600--Sobic003G086800 Sobic010G250400 Sobic010G250400 Sobic002G144600--Sobic010G250400 Sobic002G144600--Sobic010G037901 Sobic001G493100 Sobic001G493100 Sobic006G197400--Sobic001G493100 Sobic001G199200 Sobic001G199200 Sobic006G197400--Sobic001G199200 Sobic006G197400--Sobic006G041700 Sobic006G255300 Sobic006G255300 Sobic006G197400--Sobic006G255300 Sobic006G197400--Sobic003G086800 Sobic006G016700 Sobic006G016700 Sobic006G197400--Sobic006G016700 Sobic006G172000 Sobic006G172000 Sobic006G197400--Sobic006G172000 Sobic001G246600 Sobic001G246600 Sobic006G197400--Sobic001G246600 Sobic002G175200 Sobic002G175200 Sobic006G197400--Sobic002G175200 Sobic009G077300--Sobic005G153000 Sobic009G077300--Sobic006G221300 Sobic009G077300--Sobic001G054700 Sobic005G163400 Sobic005G163400 Sobic009G077300--Sobic005G163400 Sobic009G077300--Sobic002G168000 Sobic002G050700 Sobic002G050700 Sobic009G077300--Sobic002G050700 Sobic009G077300--Sobic004G282601 Sobic009G143200 Sobic009G143200 Sobic009G077300--Sobic009G143200 Sobic009G077300--Sobic007G187700 Sobic006G041700--Sobic001G493100 Sobic006G041700--Sobic006G172000 Sobic006G041700--Sobic006G197400 Sobic006G041700--Sobic003G086800 Sobic006G041700--Sobic001G246600 Sobic006G041700--Sobic002G175200 Sobic004G330200 Sobic004G330200 Sobic006G041700--Sobic004G330200 Sobic003G350400 Sobic003G350400 Sobic006G041700--Sobic003G350400 Sobic002G259200 Sobic002G259200 Sobic006G041700--Sobic002G259200
Octagon: transcription factors


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