Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G222400.1,Sobic.009G222400.2
Synonym Sb09g027630
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YV17 , A0A1Z5R3P9
Pfam PF14383
Panther DB PTHR21726 PTHR21726:SF43
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G67040 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g47790.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036528
Brachypodium PNT70771 , PNT70770
Barley HORVU1Hr1G083270.7 , HORVU1Hr1G083270.9 , HORVU1Hr1G083270.10
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G196600 expressed protein -
2 Sobic.009G002200 formin-like protein 1 precursor, putative, expressed -
3 Sobic.005G153000 agenet domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G112000 protein binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.010G037901 - -
6 Sobic.003G247000 OsMan01 - Endo-Beta-Mannanase, expressed K19355: mannan endo-1,4-beta-mannosidase
7 Sobic.004G282601 - -
8 Sobic.007G187700 retinoblastoma-related protein-like, putative, expressed K04681: retinoblastoma-like protein 1
9 Sobic.005G157300 protein binding protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G129500 argonaute, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
11 Sobic.001G320000 OsSub61 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
12 Sobic.006G135800 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
13 Sobic.007G023500 - -
14 Sobic.002G055800 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K16277: E3 ubiquitin-protein ligase DRIP
15 Sobic.009G143200 DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G493100 LTPL82 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
17 Sobic.002G168000 expressed protein -
18 Sobic.007G201900 expressed protein -
19 Sobic.008G118100 kelch repeat protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G087100 MCM9 - Putative minichromosome maintenance MCM family subunit 9, expressed K10738: DNA helicase MCM9


Gene co-expression network
sample Sobic009G222400 Sobic009G222400 Sobic005G196600 Sobic005G196600 Sobic009G222400--Sobic005G196600 Sobic009G002200 Sobic009G002200 Sobic009G222400--Sobic009G002200 Sobic005G153000 Sobic005G153000 Sobic009G222400--Sobic005G153000 Sobic002G112000 Sobic002G112000 Sobic009G222400--Sobic002G112000 Sobic010G037901 Sobic010G037901 Sobic009G222400--Sobic010G037901 Sobic003G247000 Sobic003G247000 Sobic009G222400--Sobic003G247000 Sobic004G282601 Sobic004G282601 Sobic009G222400--Sobic004G282601 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic009G222400--Sobic007G187700 Sobic005G157300 Sobic005G157300 Sobic009G222400--Sobic005G157300 Sobic005G196600--Sobic010G037901 Sobic005G196600--Sobic005G153000 Sobic006G226000 Sobic006G226000 Sobic005G196600--Sobic006G226000 Sobic005G196600--Sobic004G282601 Sobic003G086800 Sobic003G086800 Sobic005G196600--Sobic003G086800 Sobic009G031800 Sobic009G031800 Sobic005G196600--Sobic009G031800 Sobic001G136400 Sobic001G136400 Sobic005G196600--Sobic001G136400 Sobic002G055800 Sobic002G055800 Sobic005G196600--Sobic002G055800 Sobic006G135800 Sobic006G135800 Sobic005G196600--Sobic006G135800 Sobic007G050800 Sobic007G050800 Sobic009G002200--Sobic007G050800 Sobic003G290400 Sobic003G290400 Sobic009G002200--Sobic003G290400 Sobic009G002200--Sobic004G282601 Sobic009G002200--Sobic006G135800 Sobic005G036200 Sobic005G036200 Sobic009G002200--Sobic005G036200 Sobic009G002200--Sobic005G153000 Sobic001G375800 Sobic001G375800 Sobic009G002200--Sobic001G375800 Sobic004G078500 Sobic004G078500 Sobic009G002200--Sobic004G078500 Sobic009G002200--Sobic010G037901 Sobic009G077300 Sobic009G077300 Sobic005G153000--Sobic009G077300 Sobic002G168000 Sobic002G168000 Sobic005G153000--Sobic002G168000 Sobic005G153000--Sobic004G282601 Sobic005G153000--Sobic010G037901 Sobic005G153000--Sobic003G290400 Sobic005G153000--Sobic007G187700 Sobic006G221300 Sobic006G221300 Sobic005G153000--Sobic006G221300 Sobic003G129500 Sobic003G129500 Sobic005G153000--Sobic003G129500 Sobic005G153000--Sobic005G196600 Sobic009G057800 Sobic009G057800 Sobic002G112000--Sobic009G057800 Sobic007G201900 Sobic007G201900 Sobic002G112000--Sobic007G201900 Sobic002G317700 Sobic002G317700 Sobic002G112000--Sobic002G317700 Sobic008G070700 Sobic008G070700 Sobic002G112000--Sobic008G070700 Sobic010G222800 Sobic010G222800 Sobic002G112000--Sobic010G222800 Sobic002G112000--Sobic003G129500 Sobic006G272800 Sobic006G272800 Sobic002G112000--Sobic006G272800 Sobic004G190500 Sobic004G190500 Sobic002G112000--Sobic004G190500 Sobic002G112000--Sobic009G002200 Sobic010G037901--Sobic005G196600 Sobic010G037901--Sobic006G226000 Sobic010G037901--Sobic003G086800 Sobic010G037901--Sobic009G031800 Sobic009G188600 Sobic009G188600 Sobic010G037901--Sobic009G188600 Sobic010G037901--Sobic005G153000 Sobic010G037901--Sobic006G135800 Sobic007G160400 Sobic007G160400 Sobic010G037901--Sobic007G160400 Sobic010G037901--Sobic004G282601 Sobic003G247000--Sobic009G222400 Sobic003G247000--Sobic001G136400 Sobic003G247000--Sobic005G196600 Sobic003G247000--Sobic002G055800 Sobic001G320000 Sobic001G320000 Sobic003G247000--Sobic001G320000 Sobic003G247000--Sobic007G160400 Sobic007G197500 Sobic007G197500 Sobic003G247000--Sobic007G197500 Sobic002G374500 Sobic002G374500 Sobic003G247000--Sobic002G374500 Sobic009G012500 Sobic009G012500 Sobic003G247000--Sobic009G012500 Sobic004G282601--Sobic005G153000 Sobic001G104500 Sobic001G104500 Sobic004G282601--Sobic001G104500 Sobic004G282601--Sobic010G037901 Sobic004G282601--Sobic009G077300 Sobic004G282601--Sobic009G002200 Sobic004G282601--Sobic007G187700 Sobic004G282601--Sobic003G290400 Sobic004G282601--Sobic006G221300 Sobic004G282601--Sobic005G196600 Sobic007G187700--Sobic002G168000 Sobic002G021200 Sobic002G021200 Sobic007G187700--Sobic002G021200 Sobic007G187700--Sobic005G153000 Sobic007G187700--Sobic001G104500 Sobic001G377700 Sobic001G377700 Sobic007G187700--Sobic001G377700 Sobic006G275500 Sobic006G275500 Sobic007G187700--Sobic006G275500 Sobic004G317000 Sobic004G317000 Sobic007G187700--Sobic004G317000 Sobic007G187700--Sobic004G282601 Sobic007G187700--Sobic009G077300 Sobic009G143200 Sobic009G143200 Sobic005G157300--Sobic009G143200 Sobic003G055600 Sobic003G055600 Sobic005G157300--Sobic003G055600 Sobic003G183700 Sobic003G183700 Sobic005G157300--Sobic003G183700 Sobic005G157300--Sobic001G377700 Sobic001G054700 Sobic001G054700 Sobic005G157300--Sobic001G054700 Sobic005G157300--Sobic006G221300 Sobic005G157300--Sobic007G187700 Sobic009G172950 Sobic009G172950 Sobic005G157300--Sobic009G172950 Sobic009G127800 Sobic009G127800 Sobic005G157300--Sobic009G127800
Octagon: transcription factors


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