Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G165700.1
Synonym Sb10g021935
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YJN9
Pfam PF16900 PF08646
Panther DB PTHR23273 PTHR23273:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology K07466; RFA1, RPA1, replication factor A1
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G52950 : Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02230.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G318100 - -
2 Sobic.010G165900 - -
3 Sobic.002G101100 - -
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8 Sobic.005G102350 - -
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11 Sobic.008G127250 - -
12 Sobic.002G272500 6-phosphogluconolactonase, putative, expressed K01057: PGLS, pgl, 6-phosphogluconolactonase
13 Sobic.010G060166 - -
14 Sobic.008G090100 - -
15 Sobic.009G129400 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
16 Sobic.010G143000 - -
17 Sobic.008G120132 - -
18 Sobic.002G340700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@secretory carrier-associated membrane protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G127900 - -
20 Sobic.002G310300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G165700 Sobic010G165700 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic010G165700--Sobic001G318100 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic010G165700--Sobic010G165900 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic010G165700--Sobic002G101100 Sobic005G098900 Sobic005G098900 Sobic010G165700--Sobic005G098900 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic010G165700--Sobic005G110547 Sobic002G013800 Sobic002G013800 Sobic010G165700--Sobic002G013800 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic010G165700--Sobic009G070250 Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic010G165700--Sobic005G102350 Sobic010G165800 Sobic010G165800 Sobic010G165700--Sobic010G165800 Sobic001G318100--Sobic010G165700 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic001G318100--Sobic010G143000 Sobic001G318100--Sobic002G101100 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic001G318100--Sobic008G120132 Sobic001G318100--Sobic010G165900 Sobic005G075500 Sobic005G075500 Sobic001G318100--Sobic005G075500 Sobic001G318100--Sobic009G070250 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic001G318100--Sobic005G108225 Sobic008G127250 Sobic008G127250 Sobic001G318100--Sobic008G127250 Sobic010G165900--Sobic010G165700 Sobic010G165900--Sobic002G101100 Sobic010G165900--Sobic005G098900 Sobic010G248500 Sobic010G248500 Sobic010G165900--Sobic010G248500 Sobic010G165900--Sobic001G318100 Sobic003G401800 Sobic003G401800 Sobic010G165900--Sobic003G401800 Sobic010G165900--Sobic010G165800 Sobic008G090100 Sobic008G090100 Sobic010G165900--Sobic008G090100 Sobic008G127550 Sobic008G127550 Sobic010G165900--Sobic008G127550 Sobic002G101100--Sobic010G165900 Sobic002G101100--Sobic001G318100 Sobic002G101100--Sobic010G165700 Sobic005G115350 Sobic005G115350 Sobic002G101100--Sobic005G115350 Sobic002G101100--Sobic005G108225 Sobic002G101100--Sobic008G127550 Sobic002G101100--Sobic008G090100 Sobic002G101100--Sobic010G165800 Sobic002G101100--Sobic008G127250 Sobic005G098900--Sobic010G165900 Sobic005G098900--Sobic005G108225 Sobic005G098900--Sobic008G090100 Sobic005G098900--Sobic003G401800 Sobic005G098900--Sobic010G165700 Sobic010G156200 Sobic010G156200 Sobic005G098900--Sobic010G156200 Sobic001G025900 Sobic001G025900 Sobic005G098900--Sobic001G025900 Sobic005G098900--Sobic010G248500 Sobic004G328300 Sobic004G328300 Sobic005G098900--Sobic004G328300 Sobic004G213400 Sobic004G213400 Sobic005G110547--Sobic004G213400 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic005G110547--Sobic002G239400 Sobic005G110547--Sobic005G115350 Sobic001G440000 Sobic001G440000 Sobic005G110547--Sobic001G440000 Sobic002G053500 Sobic002G053500 Sobic005G110547--Sobic002G053500 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic005G110547--Sobic005G127900 Sobic005G110547--Sobic009G070250 Sobic010G036901 Sobic010G036901 Sobic005G110547--Sobic010G036901 Sobic005G110547--Sobic010G165700 Sobic002G013800--Sobic005G127900 Sobic002G013800--Sobic005G110547 Sobic002G013800--Sobic010G165700 Sobic002G013800--Sobic004G213400 Sobic008G126500 Sobic008G126500 Sobic002G013800--Sobic008G126500 Sobic002G013800--Sobic010G143000 Sobic002G013800--Sobic002G101100 Sobic002G013800--Sobic005G098900 Sobic002G013800--Sobic001G318100 Sobic009G070250--Sobic005G127900 Sobic009G070250--Sobic008G120132 Sobic009G070250--Sobic005G110547 Sobic009G070250--Sobic001G318100 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic009G070250--Sobic005G145800 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic009G070250--Sobic005G128800 Sobic009G070250--Sobic005G108225 Sobic009G070250--Sobic010G165700 Sobic009G070250--Sobic005G115350 Sobic005G102350--Sobic005G110547 Sobic002G240500 Sobic002G240500 Sobic005G102350--Sobic002G240500 Sobic001G027500 Sobic001G027500 Sobic005G102350--Sobic001G027500 Sobic005G102350--Sobic005G115350 Sobic005G102350--Sobic010G165800 Sobic005G102350--Sobic010G165900 Sobic005G102350--Sobic010G165700 Sobic005G102350--Sobic009G070250 Sobic009G051800 Sobic009G051800 Sobic005G102350--Sobic009G051800 Sobic009G081800 Sobic009G081800 Sobic010G165800--Sobic009G081800 Sobic010G165800--Sobic010G165900 Sobic007G112100 Sobic007G112100 Sobic010G165800--Sobic007G112100 Sobic001G530100 Sobic001G530100 Sobic010G165800--Sobic001G530100 Sobic006G095300 Sobic006G095300 Sobic010G165800--Sobic006G095300 Sobic004G291200 Sobic004G291200 Sobic010G165800--Sobic004G291200 Sobic001G506300 Sobic001G506300 Sobic010G165800--Sobic001G506300 Sobic001G532800 Sobic001G532800 Sobic010G165800--Sobic001G532800 Sobic002G286632 Sobic002G286632 Sobic010G165800--Sobic002G286632
Octagon: transcription factors


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