Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G102350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RHR0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G110547 - -
2 Sobic.002G240500 disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
3 Sobic.001G027500 haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G115350 - -
5 Sobic.010G165800 - -
6 Sobic.010G165900 - -
7 Sobic.010G165700 expressed protein K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
8 Sobic.009G070250 - -
9 Sobic.009G051800 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
10 Sobic.007G180050 - -
11 Sobic.007G122700 expressed protein -
12 Sobic.008G046200 PHD-finger family protein, expressed -
13 Sobic.003G396700 DCL2, putative, expressed K11592: DICER1, endoribonuclease Dicer
14 Sobic.002G173400 expressed protein -
15 Sobic.005G145800 - -
16 Sobic.009G012400 RPA1C - Putative single-stranded DNA binding complex subunit 1, expressed K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
17 Sobic.006G150001 - -
18 Sobic.009G093800 - -
19 Sobic.003G183466 - -
20 Sobic.004G213400 ATP8, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic005G102350--Sobic005G110547 Sobic002G240500 Sobic002G240500 Sobic005G102350--Sobic002G240500 Sobic001G027500 Sobic001G027500 Sobic005G102350--Sobic001G027500 Sobic005G115350 Sobic005G115350 Sobic005G102350--Sobic005G115350 Sobic010G165800 Sobic010G165800 Sobic005G102350--Sobic010G165800 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic005G102350--Sobic010G165900 Sobic010G165700 Sobic010G165700 Sobic005G102350--Sobic010G165700 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic005G102350--Sobic009G070250 Sobic009G051800 Sobic009G051800 Sobic005G102350--Sobic009G051800 Sobic004G213400 Sobic004G213400 Sobic005G110547--Sobic004G213400 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic005G110547--Sobic002G239400 Sobic005G110547--Sobic005G115350 Sobic001G440000 Sobic001G440000 Sobic005G110547--Sobic001G440000 Sobic002G053500 Sobic002G053500 Sobic005G110547--Sobic002G053500 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic005G110547--Sobic005G127900 Sobic005G110547--Sobic009G070250 Sobic010G036901 Sobic010G036901 Sobic005G110547--Sobic010G036901 Sobic005G110547--Sobic010G165700 Sobic004G291200 Sobic004G291200 Sobic002G240500--Sobic004G291200 Sobic009G031800 Sobic009G031800 Sobic002G240500--Sobic009G031800 Sobic007G192200 Sobic007G192200 Sobic002G240500--Sobic007G192200 Sobic006G226000 Sobic006G226000 Sobic002G240500--Sobic006G226000 Sobic001G320000 Sobic001G320000 Sobic002G240500--Sobic001G320000 Sobic002G240500--Sobic001G027500 Sobic010G214800 Sobic010G214800 Sobic002G240500--Sobic010G214800 Sobic010G037901 Sobic010G037901 Sobic002G240500--Sobic010G037901 Sobic001G493100 Sobic001G493100 Sobic002G240500--Sobic001G493100 Sobic010G257000 Sobic010G257000 Sobic001G027500--Sobic010G257000 Sobic002G168000 Sobic002G168000 Sobic001G027500--Sobic002G168000 Sobic008G063600 Sobic008G063600 Sobic001G027500--Sobic008G063600 Sobic004G222200 Sobic004G222200 Sobic001G027500--Sobic004G222200 Sobic001G027500--Sobic006G226000 Sobic006G262501 Sobic006G262501 Sobic001G027500--Sobic006G262501 Sobic002G055800 Sobic002G055800 Sobic001G027500--Sobic002G055800 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic001G027500--Sobic007G187700 Sobic005G153000 Sobic005G153000 Sobic001G027500--Sobic005G153000 Sobic005G115350--Sobic005G110547 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic005G115350--Sobic002G101100 Sobic005G115350--Sobic002G240500 Sobic005G115350--Sobic010G165800 Sobic005G115350--Sobic004G291200 Sobic005G115350--Sobic005G102350 Sobic010G257500 Sobic010G257500 Sobic005G115350--Sobic010G257500 Sobic005G115350--Sobic009G070250 Sobic009G178500 Sobic009G178500 Sobic005G115350--Sobic009G178500 Sobic009G081800 Sobic009G081800 Sobic010G165800--Sobic009G081800 Sobic010G165800--Sobic010G165900 Sobic007G112100 Sobic007G112100 Sobic010G165800--Sobic007G112100 Sobic001G530100 Sobic001G530100 Sobic010G165800--Sobic001G530100 Sobic006G095300 Sobic006G095300 Sobic010G165800--Sobic006G095300 Sobic010G165800--Sobic004G291200 Sobic001G506300 Sobic001G506300 Sobic010G165800--Sobic001G506300 Sobic001G532800 Sobic001G532800 Sobic010G165800--Sobic001G532800 Sobic002G286632 Sobic002G286632 Sobic010G165800--Sobic002G286632 Sobic010G165900--Sobic010G165700 Sobic010G165900--Sobic002G101100 Sobic005G098900 Sobic005G098900 Sobic010G165900--Sobic005G098900 Sobic010G248500 Sobic010G248500 Sobic010G165900--Sobic010G248500 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic010G165900--Sobic001G318100 Sobic003G401800 Sobic003G401800 Sobic010G165900--Sobic003G401800 Sobic010G165900--Sobic010G165800 Sobic008G090100 Sobic008G090100 Sobic010G165900--Sobic008G090100 Sobic008G127550 Sobic008G127550 Sobic010G165900--Sobic008G127550 Sobic010G165700--Sobic001G318100 Sobic010G165700--Sobic010G165900 Sobic010G165700--Sobic002G101100 Sobic010G165700--Sobic005G098900 Sobic010G165700--Sobic005G110547 Sobic002G013800 Sobic002G013800 Sobic010G165700--Sobic002G013800 Sobic010G165700--Sobic009G070250 Sobic010G165700--Sobic005G102350 Sobic010G165700--Sobic010G165800 Sobic009G070250--Sobic005G127900 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic009G070250--Sobic008G120132 Sobic009G070250--Sobic005G110547 Sobic009G070250--Sobic001G318100 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic009G070250--Sobic005G145800 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic009G070250--Sobic005G128800 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic009G070250--Sobic005G108225 Sobic009G070250--Sobic010G165700 Sobic009G070250--Sobic005G115350 Sobic009G051800--Sobic004G213400 Sobic010G024000 Sobic010G024000 Sobic009G051800--Sobic010G024000 Sobic009G084700 Sobic009G084700 Sobic009G051800--Sobic009G084700 Sobic010G009700 Sobic010G009700 Sobic009G051800--Sobic010G009700 Sobic002G173400 Sobic002G173400 Sobic009G051800--Sobic002G173400 Sobic010G038200 Sobic010G038200 Sobic009G051800--Sobic010G038200 Sobic003G005500 Sobic003G005500 Sobic009G051800--Sobic003G005500 Sobic005G060100 Sobic005G060100 Sobic009G051800--Sobic005G060100 Sobic009G084800 Sobic009G084800 Sobic009G051800--Sobic009G084800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.