Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G110547.2,Sobic.005G110547.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A109NDJ3 , A0A1Z5RI07
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G213400 ATP8, putative, expressed -
2 Sobic.002G239400 OsFBX338 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G115350 - -
4 Sobic.001G440000 ras-related protein, putative, expressed K07933: Rab-like protein 3
5 Sobic.002G053500 - -
6 Sobic.005G127900 - -
7 Sobic.009G070250 - -
8 Sobic.010G036901 - -
9 Sobic.010G165700 expressed protein K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
10 Sobic.005G102350 - -
11 Sobic.004G138450 - -
12 Sobic.010G257500 expressed protein -
13 Sobic.002G013800 NB-ARC domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G193500 malonyl-CoA decarboxylase, mitochondrial precursor, putative, expressed K01578: malonyl-CoA decarboxylase
15 Sobic.004G026600 - -
16 Sobic.004G298600 histone-lysine N-methyltransferase, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
17 Sobic.008G126500 - -
18 Sobic.007G105700 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed K13648: alpha-1,4-galacturonosyltransferase
19 Sobic.002G377200 expressed protein -
20 Sobic.003G293400 oligosaccharyl transferase, putative, expressed K07151: dolichyl-diphosphooligosaccharide---protein glycosyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic004G213400 Sobic004G213400 Sobic005G110547--Sobic004G213400 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic005G110547--Sobic002G239400 Sobic005G115350 Sobic005G115350 Sobic005G110547--Sobic005G115350 Sobic001G440000 Sobic001G440000 Sobic005G110547--Sobic001G440000 Sobic002G053500 Sobic002G053500 Sobic005G110547--Sobic002G053500 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic005G110547--Sobic005G127900 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic005G110547--Sobic009G070250 Sobic010G036901 Sobic010G036901 Sobic005G110547--Sobic010G036901 Sobic010G165700 Sobic010G165700 Sobic005G110547--Sobic010G165700 Sobic004G213400--Sobic002G239400 Sobic004G213400--Sobic005G110547 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic004G213400--Sobic004G298600 Sobic003G293400 Sobic003G293400 Sobic004G213400--Sobic003G293400 Sobic001G248400 Sobic001G248400 Sobic004G213400--Sobic001G248400 Sobic001G131900 Sobic001G131900 Sobic004G213400--Sobic001G131900 Sobic009G220700 Sobic009G220700 Sobic004G213400--Sobic009G220700 Sobic002G308000 Sobic002G308000 Sobic004G213400--Sobic002G308000 Sobic007G105700 Sobic007G105700 Sobic004G213400--Sobic007G105700 Sobic002G239400--Sobic004G213400 Sobic002G348400 Sobic002G348400 Sobic002G239400--Sobic002G348400 Sobic002G239400--Sobic001G131900 Sobic001G117900 Sobic001G117900 Sobic002G239400--Sobic001G117900 Sobic002G392400 Sobic002G392400 Sobic002G239400--Sobic002G392400 Sobic002G239400--Sobic003G293400 Sobic002G239400--Sobic007G105700 Sobic009G054400 Sobic009G054400 Sobic002G239400--Sobic009G054400 Sobic005G048600 Sobic005G048600 Sobic002G239400--Sobic005G048600 Sobic005G115350--Sobic005G110547 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic005G115350--Sobic002G101100 Sobic002G240500 Sobic002G240500 Sobic005G115350--Sobic002G240500 Sobic010G165800 Sobic010G165800 Sobic005G115350--Sobic010G165800 Sobic004G291200 Sobic004G291200 Sobic005G115350--Sobic004G291200 Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic005G115350--Sobic005G102350 Sobic010G257500 Sobic010G257500 Sobic005G115350--Sobic010G257500 Sobic005G115350--Sobic009G070250 Sobic009G178500 Sobic009G178500 Sobic005G115350--Sobic009G178500 Sobic001G440000--Sobic002G239400 Sobic010G153400 Sobic010G153400 Sobic001G440000--Sobic010G153400 Sobic009G066200 Sobic009G066200 Sobic001G440000--Sobic009G066200 Sobic001G440000--Sobic004G298600 Sobic001G440000--Sobic001G131900 Sobic003G435300 Sobic003G435300 Sobic001G440000--Sobic003G435300 Sobic001G440000--Sobic004G213400 Sobic001G091701 Sobic001G091701 Sobic001G440000--Sobic001G091701 Sobic001G440000--Sobic002G392400 Sobic002G053500--Sobic005G110547 Sobic002G053500--Sobic004G213400 Sobic002G053500--Sobic005G115350 Sobic008G143100 Sobic008G143100 Sobic002G053500--Sobic008G143100 Sobic002G053500--Sobic002G392400 Sobic002G053500--Sobic002G239400 Sobic010G222732 Sobic010G222732 Sobic002G053500--Sobic010G222732 Sobic002G193500 Sobic002G193500 Sobic002G053500--Sobic002G193500 Sobic004G081900 Sobic004G081900 Sobic002G053500--Sobic004G081900 Sobic005G127900--Sobic009G070250 Sobic008G126500 Sobic008G126500 Sobic005G127900--Sobic008G126500 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic005G127900--Sobic005G108225 Sobic002G013800 Sobic002G013800 Sobic005G127900--Sobic002G013800 Sobic005G127900--Sobic005G110547 Sobic007G026900 Sobic007G026900 Sobic005G127900--Sobic007G026900 Sobic001G538100 Sobic001G538100 Sobic005G127900--Sobic001G538100 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic005G127900--Sobic008G120132 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic005G127900--Sobic005G145800 Sobic009G070250--Sobic005G127900 Sobic009G070250--Sobic008G120132 Sobic009G070250--Sobic005G110547 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic009G070250--Sobic001G318100 Sobic009G070250--Sobic005G145800 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic009G070250--Sobic005G128800 Sobic009G070250--Sobic005G108225 Sobic009G070250--Sobic010G165700 Sobic009G070250--Sobic005G115350 Sobic004G064800 Sobic004G064800 Sobic010G036901--Sobic004G064800 Sobic010G255400 Sobic010G255400 Sobic010G036901--Sobic010G255400 Sobic002G304500 Sobic002G304500 Sobic010G036901--Sobic002G304500 Sobic001G053350 Sobic001G053350 Sobic010G036901--Sobic001G053350 Sobic001G485500 Sobic001G485500 Sobic010G036901--Sobic001G485500 Sobic008G007800 Sobic008G007800 Sobic010G036901--Sobic008G007800 Sobic010G036901--Sobic003G293400 Sobic006G189000 Sobic006G189000 Sobic010G036901--Sobic006G189000 Sobic010G036901--Sobic001G131900 Sobic010G165700--Sobic001G318100 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic010G165700--Sobic010G165900 Sobic010G165700--Sobic002G101100 Sobic005G098900 Sobic005G098900 Sobic010G165700--Sobic005G098900 Sobic010G165700--Sobic005G110547 Sobic010G165700--Sobic002G013800 Sobic010G165700--Sobic009G070250 Sobic010G165700--Sobic005G102350 Sobic010G165700--Sobic010G165800
Octagon: transcription factors


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