Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G053500.1
Synonym CHA16, Sb02g004476, RGD3, CHR16, BTAF1, ATBTAF1
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q9F1
Pfam PF00176
Panther DB PTHR10799 PTHR10799:SF753
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005524; ATP binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G54280 : DNA binding;ATP binding;nucleic acid binding;binding;helicases;ATP binding;DNA binding;helicases
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g05230.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044741
Brachypodium KQK04568 , KQK04569 , KQK04567
Barley HORVU1Hr1G094870.13 , HORVU1Hr1G094870.12 , HORVU1Hr1G094870.11 , HORVU1Hr1G094870.10 , HORVU1Hr1G094870.9 , HORVU1Hr1G094870.8 , HORVU1Hr1G094870.3 , HORVU1Hr1G094870.2 , HORVU1Hr1G094870.1 , HORVU1Hr1G094870.7 , HORVU1Hr1G094870.6 , HORVU1Hr1G094870.5 , HORVU1Hr1G094870.4
Wheat TraesCS1A02G442400 , TraesCS1A02G442400 , TraesCS1B02G476500 , TraesCS1D02G450200
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.004G298600 histone-lysine N-methyltransferase, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT


Gene co-expression network
sample Sobic002G053500 Sobic002G053500 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic002G053500--Sobic005G110547 Sobic004G213400 Sobic004G213400 Sobic002G053500--Sobic004G213400 Sobic005G115350 Sobic005G115350 Sobic002G053500--Sobic005G115350 Sobic008G143100 Sobic008G143100 Sobic002G053500--Sobic008G143100 Sobic002G392400 Sobic002G392400 Sobic002G053500--Sobic002G392400 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic002G053500--Sobic002G239400 Sobic010G222732 Sobic010G222732 Sobic002G053500--Sobic010G222732 Sobic002G193500 Sobic002G193500 Sobic002G053500--Sobic002G193500 Sobic004G081900 Sobic004G081900 Sobic002G053500--Sobic004G081900 Sobic005G110547--Sobic004G213400 Sobic005G110547--Sobic002G239400 Sobic005G110547--Sobic005G115350 Sobic001G440000 Sobic001G440000 Sobic005G110547--Sobic001G440000 Sobic005G110547--Sobic002G053500 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic005G110547--Sobic005G127900 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic005G110547--Sobic009G070250 Sobic010G036901 Sobic010G036901 Sobic005G110547--Sobic010G036901 Sobic010G165700 Sobic010G165700 Sobic005G110547--Sobic010G165700 Sobic004G213400--Sobic002G239400 Sobic004G213400--Sobic005G110547 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic004G213400--Sobic004G298600 Sobic003G293400 Sobic003G293400 Sobic004G213400--Sobic003G293400 Sobic001G248400 Sobic001G248400 Sobic004G213400--Sobic001G248400 Sobic001G131900 Sobic001G131900 Sobic004G213400--Sobic001G131900 Sobic009G220700 Sobic009G220700 Sobic004G213400--Sobic009G220700 Sobic002G308000 Sobic002G308000 Sobic004G213400--Sobic002G308000 Sobic007G105700 Sobic007G105700 Sobic004G213400--Sobic007G105700 Sobic005G115350--Sobic005G110547 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic005G115350--Sobic002G101100 Sobic002G240500 Sobic002G240500 Sobic005G115350--Sobic002G240500 Sobic010G165800 Sobic010G165800 Sobic005G115350--Sobic010G165800 Sobic004G291200 Sobic004G291200 Sobic005G115350--Sobic004G291200 Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic005G115350--Sobic005G102350 Sobic010G257500 Sobic010G257500 Sobic005G115350--Sobic010G257500 Sobic005G115350--Sobic009G070250 Sobic009G178500 Sobic009G178500 Sobic005G115350--Sobic009G178500 Sobic008G143100--Sobic004G081900 Sobic006G162400 Sobic006G162400 Sobic008G143100--Sobic006G162400 Sobic001G453600 Sobic001G453600 Sobic008G143100--Sobic001G453600 Sobic007G049900 Sobic007G049900 Sobic008G143100--Sobic007G049900 Sobic008G124600 Sobic008G124600 Sobic008G143100--Sobic008G124600 Sobic003G428000 Sobic003G428000 Sobic008G143100--Sobic003G428000 Sobic008G143100--Sobic002G392400 Sobic002G414800 Sobic002G414800 Sobic008G143100--Sobic002G414800 Sobic006G119900 Sobic006G119900 Sobic008G143100--Sobic006G119900 Sobic002G392400--Sobic007G105700 Sobic002G392400--Sobic002G308000 Sobic001G117900 Sobic001G117900 Sobic002G392400--Sobic001G117900 Sobic002G348400 Sobic002G348400 Sobic002G392400--Sobic002G348400 Sobic002G313100 Sobic002G313100 Sobic002G392400--Sobic002G313100 Sobic002G392400--Sobic003G293400 Sobic002G392400--Sobic001G131900 Sobic006G232800 Sobic006G232800 Sobic002G392400--Sobic006G232800 Sobic010G153400 Sobic010G153400 Sobic002G392400--Sobic010G153400 Sobic002G239400--Sobic004G213400 Sobic002G239400--Sobic002G348400 Sobic002G239400--Sobic001G131900 Sobic002G239400--Sobic001G117900 Sobic002G239400--Sobic002G392400 Sobic002G239400--Sobic003G293400 Sobic002G239400--Sobic007G105700 Sobic009G054400 Sobic009G054400 Sobic002G239400--Sobic009G054400 Sobic005G048600 Sobic005G048600 Sobic002G239400--Sobic005G048600 Sobic006G109650 Sobic006G109650 Sobic010G222732--Sobic006G109650 Sobic010G222732--Sobic002G053500 Sobic003G045450 Sobic003G045450 Sobic010G222732--Sobic003G045450 Sobic010G222732--Sobic005G115350 Sobic003G204100 Sobic003G204100 Sobic010G222732--Sobic003G204100 Sobic007G122700 Sobic007G122700 Sobic010G222732--Sobic007G122700 Sobic010G222732--Sobic010G165800 Sobic010G222732--Sobic004G213400 Sobic007G102300 Sobic007G102300 Sobic010G222732--Sobic007G102300 Sobic007G086600 Sobic007G086600 Sobic002G193500--Sobic007G086600 Sobic007G111300 Sobic007G111300 Sobic002G193500--Sobic007G111300 Sobic002G193500--Sobic001G117900 Sobic002G193500--Sobic002G392400 Sobic002G193500--Sobic006G232800 Sobic008G072500 Sobic008G072500 Sobic002G193500--Sobic008G072500 Sobic002G193500--Sobic002G308000 Sobic002G201700 Sobic002G201700 Sobic002G193500--Sobic002G201700 Sobic003G004800 Sobic003G004800 Sobic002G193500--Sobic003G004800 Sobic002G123400 Sobic002G123400 Sobic004G081900--Sobic002G123400 Sobic008G071700 Sobic008G071700 Sobic004G081900--Sobic008G071700 Sobic005G006900 Sobic005G006900 Sobic004G081900--Sobic005G006900 Sobic003G090200 Sobic003G090200 Sobic004G081900--Sobic003G090200 Sobic002G100300 Sobic002G100300 Sobic004G081900--Sobic002G100300 Sobic005G212300 Sobic005G212300 Sobic004G081900--Sobic005G212300 Sobic003G354850 Sobic003G354850 Sobic004G081900--Sobic003G354850 Sobic004G254700 Sobic004G254700 Sobic004G081900--Sobic004G254700 Sobic002G019300 Sobic002G019300 Sobic004G081900--Sobic002G019300
Octagon: transcription factors


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