Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G126500.1,Sobic.008G126500.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R6F1 , A0A1B6PDC1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G127900 - -
2 Sobic.005G110547 - -
3 Sobic.009G070250 - -
4 Sobic.002G013800 NB-ARC domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G175400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@desaturase/cytochrome b5 protein, putative, expressed K13076: sphingolipid 8-(E)-desaturase
6 Sobic.005G067400 - -
7 Sobic.005G108225 - -
8 Sobic.003G058100 kelch repeat-containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G030600 similar to Non-specific lipid-transfer protein(PubMedID : 29862293)@SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@Protease inhibitor/seed storage/LTP("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@LTPL14 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.005G003400 - -
11 Sobic.010G168000 - -
12 Sobic.005G117200 - -
13 Sobic.001G440000 ras-related protein, putative, expressed K07933: Rab-like protein 3
14 Sobic.001G538100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K15691: E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3
15 Sobic.010G143000 - -
16 Sobic.007G026900 - -
17 Sobic.009G106000 - -
18 Sobic.008G066300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G115350 - -
20 Sobic.008G168700 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G126500 Sobic008G126500 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic008G126500--Sobic005G127900 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic008G126500--Sobic005G110547 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic008G126500--Sobic009G070250 Sobic002G013800 Sobic002G013800 Sobic008G126500--Sobic002G013800 Sobic002G175400 Sobic002G175400 Sobic008G126500--Sobic002G175400 Sobic005G067400 Sobic005G067400 Sobic008G126500--Sobic005G067400 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic008G126500--Sobic005G108225 Sobic003G058100 Sobic003G058100 Sobic008G126500--Sobic003G058100 Sobic008G030600 Sobic008G030600 Sobic008G126500--Sobic008G030600 Sobic005G127900--Sobic009G070250 Sobic005G127900--Sobic008G126500 Sobic005G127900--Sobic005G108225 Sobic005G127900--Sobic002G013800 Sobic005G127900--Sobic005G110547 Sobic007G026900 Sobic007G026900 Sobic005G127900--Sobic007G026900 Sobic001G538100 Sobic001G538100 Sobic005G127900--Sobic001G538100 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic005G127900--Sobic008G120132 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic005G127900--Sobic005G145800 Sobic004G213400 Sobic004G213400 Sobic005G110547--Sobic004G213400 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic005G110547--Sobic002G239400 Sobic005G115350 Sobic005G115350 Sobic005G110547--Sobic005G115350 Sobic001G440000 Sobic001G440000 Sobic005G110547--Sobic001G440000 Sobic002G053500 Sobic002G053500 Sobic005G110547--Sobic002G053500 Sobic005G110547--Sobic005G127900 Sobic005G110547--Sobic009G070250 Sobic010G036901 Sobic010G036901 Sobic005G110547--Sobic010G036901 Sobic010G165700 Sobic010G165700 Sobic005G110547--Sobic010G165700 Sobic009G070250--Sobic005G127900 Sobic009G070250--Sobic008G120132 Sobic009G070250--Sobic005G110547 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic009G070250--Sobic001G318100 Sobic009G070250--Sobic005G145800 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic009G070250--Sobic005G128800 Sobic009G070250--Sobic005G108225 Sobic009G070250--Sobic010G165700 Sobic009G070250--Sobic005G115350 Sobic002G013800--Sobic005G127900 Sobic002G013800--Sobic005G110547 Sobic002G013800--Sobic010G165700 Sobic002G013800--Sobic004G213400 Sobic002G013800--Sobic008G126500 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic002G013800--Sobic010G143000 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic002G013800--Sobic002G101100 Sobic005G098900 Sobic005G098900 Sobic002G013800--Sobic005G098900 Sobic002G013800--Sobic001G318100 Sobic002G175400--Sobic001G440000 Sobic008G181400 Sobic008G181400 Sobic002G175400--Sobic008G181400 Sobic004G319000 Sobic004G319000 Sobic002G175400--Sobic004G319000 Sobic001G415700 Sobic001G415700 Sobic002G175400--Sobic001G415700 Sobic002G138300 Sobic002G138300 Sobic002G175400--Sobic002G138300 Sobic002G175400--Sobic005G067400 Sobic010G109400 Sobic010G109400 Sobic002G175400--Sobic010G109400 Sobic004G162500 Sobic004G162500 Sobic002G175400--Sobic004G162500 Sobic002G175400--Sobic008G126500 Sobic008G168700 Sobic008G168700 Sobic005G067400--Sobic008G168700 Sobic007G010200 Sobic007G010200 Sobic005G067400--Sobic007G010200 Sobic005G067400--Sobic001G538100 Sobic005G067400--Sobic005G127900 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic005G067400--Sobic005G115400 Sobic005G166000 Sobic005G166000 Sobic005G067400--Sobic005G166000 Sobic005G067400--Sobic002G175400 Sobic002G220200 Sobic002G220200 Sobic005G067400--Sobic002G220200 Sobic009G085300 Sobic009G085300 Sobic005G067400--Sobic009G085300 Sobic005G108225--Sobic005G098900 Sobic010G168000 Sobic010G168000 Sobic005G108225--Sobic010G168000 Sobic005G108225--Sobic005G127900 Sobic008G047200 Sobic008G047200 Sobic005G108225--Sobic008G047200 Sobic010G248500 Sobic010G248500 Sobic005G108225--Sobic010G248500 Sobic005G108225--Sobic002G101100 Sobic005G108225--Sobic001G318100 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic005G108225--Sobic010G165900 Sobic005G108225--Sobic008G120132 Sobic003G058100--Sobic005G108225 Sobic003G058100--Sobic005G127900 Sobic009G186001 Sobic009G186001 Sobic003G058100--Sobic009G186001 Sobic008G176900 Sobic008G176900 Sobic003G058100--Sobic008G176900 Sobic003G058100--Sobic008G126500 Sobic003G058100--Sobic009G070250 Sobic001G510300 Sobic001G510300 Sobic003G058100--Sobic001G510300 Sobic003G058100--Sobic008G120132 Sobic001G273000 Sobic001G273000 Sobic003G058100--Sobic001G273000 Sobic003G047900 Sobic003G047900 Sobic008G030600--Sobic003G047900 Sobic006G086800 Sobic006G086800 Sobic008G030600--Sobic006G086800 Sobic009G218900 Sobic009G218900 Sobic008G030600--Sobic009G218900 Sobic009G070700 Sobic009G070700 Sobic008G030600--Sobic009G070700 Sobic008G030600--Sobic001G440000 Sobic006G145600 Sobic006G145600 Sobic008G030600--Sobic006G145600 Sobic009G009300 Sobic009G009300 Sobic008G030600--Sobic009G009300 Sobic003G326700 Sobic003G326700 Sobic008G030600--Sobic003G326700 Sobic008G162300 Sobic008G162300 Sobic008G030600--Sobic008G162300
Octagon: transcription factors


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