Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G067400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RH88
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G168700 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.007G010200 - -
3 Sobic.001G538100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K15691: E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3
4 Sobic.005G127900 - -
5 Sobic.005G115400 - -
6 Sobic.005G166000 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G175400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@desaturase/cytochrome b5 protein, putative, expressed K13076: sphingolipid 8-(E)-desaturase
8 Sobic.002G220200 formate--tetrahydrofolate ligase, putative, expressed K01938: formate--tetrahydrofolate ligase
9 Sobic.009G085300 - -
10 Sobic.007G026900 - -
11 Sobic.008G126500 - -
12 Sobic.004G031100 CPuORF1 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed -
13 Sobic.009G152140 - -
14 Sobic.010G041100 mTERF family protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
15 Sobic.007G153500 metal cation transporter, putative, expressed K14713: SLC39A7, KE4, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 7
16 Sobic.002G188400 - -
17 Sobic.001G380200 nucleotidyltransferase, putative, expressed -
18 Sobic.007G031100 RNA polymerase II complex component SRB7, putative, expressed K15152: MED21, mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21
19 Sobic.005G110547 - -
20 Sobic.002G066901 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G067400 Sobic005G067400 Sobic008G168700 Sobic008G168700 Sobic005G067400--Sobic008G168700 Sobic007G010200 Sobic007G010200 Sobic005G067400--Sobic007G010200 Sobic001G538100 Sobic001G538100 Sobic005G067400--Sobic001G538100 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic005G067400--Sobic005G127900 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic005G067400--Sobic005G115400 Sobic005G166000 Sobic005G166000 Sobic005G067400--Sobic005G166000 Sobic002G175400 Sobic002G175400 Sobic005G067400--Sobic002G175400 Sobic002G220200 Sobic002G220200 Sobic005G067400--Sobic002G220200 Sobic009G085300 Sobic009G085300 Sobic005G067400--Sobic009G085300 Sobic008G168700--Sobic005G067400 Sobic008G168700--Sobic001G538100 Sobic004G031100 Sobic004G031100 Sobic008G168700--Sobic004G031100 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic008G168700--Sobic002G239400 Sobic009G152140 Sobic009G152140 Sobic008G168700--Sobic009G152140 Sobic007G056900 Sobic007G056900 Sobic008G168700--Sobic007G056900 Sobic002G274700 Sobic002G274700 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Octagon: transcription factors


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