Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G188400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QC87
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.002G188400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G003400 - -
2 Sobic.002G304500 mutS family domain IV containing protein, expressed K08740: DNA mismatch repair protein MSH4
3 Sobic.008G007700 expressed protein -
4 Sobic.008G023600 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
5 Sobic.010G036901 - -
6 Sobic.002G066700 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
7 Sobic.004G064800 haemolysin-III, putative, expressed K07297: adiponectin receptor
8 Sobic.004G328100 expressed protein -
9 Sobic.005G201200 - -
10 Sobic.009G056900 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
11 Sobic.008G007800 - -
12 Sobic.001G539400 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
13 Sobic.004G169600 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G218600 MATH domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G504700 BSD domain-containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G064300 - -
17 Sobic.006G038700 - -
18 Sobic.002G377900 mitosis protein dim1, putative, expressed -
19 Sobic.001G025700 protein phosphatase 2C, putative, expressed K01102: pyruvate dehydrogenase phosphatase
20 Sobic.003G214850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G188400 Sobic002G188400 Sobic005G003400 Sobic005G003400 Sobic002G188400--Sobic005G003400 Sobic002G304500 Sobic002G304500 Sobic002G188400--Sobic002G304500 Sobic008G007700 Sobic008G007700 Sobic002G188400--Sobic008G007700 Sobic008G023600 Sobic008G023600 Sobic002G188400--Sobic008G023600 Sobic010G036901 Sobic010G036901 Sobic002G188400--Sobic010G036901 Sobic002G066700 Sobic002G066700 Sobic002G188400--Sobic002G066700 Sobic004G064800 Sobic004G064800 Sobic002G188400--Sobic004G064800 Sobic004G328100 Sobic004G328100 Sobic002G188400--Sobic004G328100 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic002G188400--Sobic005G201200 Sobic005G003400--Sobic002G188400 Sobic005G003600 Sobic005G003600 Sobic005G003400--Sobic005G003600 Sobic008G066300 Sobic008G066300 Sobic005G003400--Sobic008G066300 Sobic004G138450 Sobic004G138450 Sobic005G003400--Sobic004G138450 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic005G003400--Sobic002G239400 Sobic001G539400 Sobic001G539400 Sobic005G003400--Sobic001G539400 Sobic004G213400 Sobic004G213400 Sobic005G003400--Sobic004G213400 Sobic010G153400 Sobic010G153400 Sobic005G003400--Sobic010G153400 Sobic005G003400--Sobic008G023600 Sobic002G304500--Sobic004G064800 Sobic002G304500--Sobic005G201200 Sobic008G007800 Sobic008G007800 Sobic002G304500--Sobic008G007800 Sobic010G255400 Sobic010G255400 Sobic002G304500--Sobic010G255400 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic002G304500--Sobic002G016000 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic002G304500--Sobic006G199500 Sobic002G304500--Sobic004G328100 Sobic002G304500--Sobic008G007700 Sobic004G038400 Sobic004G038400 Sobic002G304500--Sobic004G038400 Sobic008G007700--Sobic008G007800 Sobic008G007700--Sobic004G064800 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic008G007700--Sobic009G048700 Sobic008G007700--Sobic006G199500 Sobic003G218000 Sobic003G218000 Sobic008G007700--Sobic003G218000 Sobic010G198400 Sobic010G198400 Sobic008G007700--Sobic010G198400 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic008G007700--Sobic009G008000 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic008G007700--Sobic010G038000 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic008G007700--Sobic009G145000 Sobic008G023600--Sobic002G188400 Sobic008G023600--Sobic005G003400 Sobic008G023600--Sobic008G066300 Sobic005G162800 Sobic005G162800 Sobic008G023600--Sobic005G162800 Sobic008G023600--Sobic010G036901 Sobic008G064300 Sobic008G064300 Sobic008G023600--Sobic008G064300 Sobic010G009600 Sobic010G009600 Sobic008G023600--Sobic010G009600 Sobic004G313400 Sobic004G313400 Sobic008G023600--Sobic004G313400 Sobic008G023600--Sobic002G239400 Sobic010G036901--Sobic004G064800 Sobic010G036901--Sobic010G255400 Sobic010G036901--Sobic002G304500 Sobic001G053350 Sobic001G053350 Sobic010G036901--Sobic001G053350 Sobic001G485500 Sobic001G485500 Sobic010G036901--Sobic001G485500 Sobic010G036901--Sobic008G007800 Sobic003G293400 Sobic003G293400 Sobic010G036901--Sobic003G293400 Sobic006G189000 Sobic006G189000 Sobic010G036901--Sobic006G189000 Sobic001G131900 Sobic001G131900 Sobic010G036901--Sobic001G131900 Sobic009G056900 Sobic009G056900 Sobic002G066700--Sobic009G056900 Sobic002G147400 Sobic002G147400 Sobic002G066700--Sobic002G147400 Sobic001G392700 Sobic001G392700 Sobic002G066700--Sobic001G392700 Sobic002G066700--Sobic005G201200 Sobic007G086701 Sobic007G086701 Sobic002G066700--Sobic007G086701 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic002G066700--Sobic006G038700 Sobic001G264600 Sobic001G264600 Sobic002G066700--Sobic001G264600 Sobic005G206800 Sobic005G206800 Sobic002G066700--Sobic005G206800 Sobic002G066700--Sobic002G016000 Sobic004G064800--Sobic008G007800 Sobic004G064800--Sobic002G304500 Sobic004G064800--Sobic005G201200 Sobic004G064800--Sobic010G255400 Sobic004G064800--Sobic006G199500 Sobic004G064800--Sobic009G048700 Sobic004G064800--Sobic008G007700 Sobic004G064800--Sobic002G016000 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic004G064800--Sobic009G006700 Sobic004G328100--Sobic002G304500 Sobic002G382100 Sobic002G382100 Sobic004G328100--Sobic002G382100 Sobic004G328100--Sobic008G007800 Sobic002G361500 Sobic002G361500 Sobic004G328100--Sobic002G361500 Sobic004G328100--Sobic005G201200 Sobic002G377900 Sobic002G377900 Sobic004G328100--Sobic002G377900 Sobic004G328100--Sobic002G016000 Sobic001G080800 Sobic001G080800 Sobic004G328100--Sobic001G080800 Sobic004G328100--Sobic010G198400 Sobic005G201200--Sobic002G016000 Sobic005G201200--Sobic008G007800 Sobic005G201200--Sobic006G038700 Sobic005G201200--Sobic004G064800 Sobic005G201200--Sobic009G006700 Sobic005G201200--Sobic010G255400 Sobic005G201200--Sobic002G066700 Sobic005G201200--Sobic002G304500 Sobic005G201200--Sobic002G147400
Octagon: transcription factors


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