Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G007700.1,Sobic.008G007700.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PAT1 , A0A1Z5R578
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g18070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G007800 - -
2 Sobic.004G064800 haemolysin-III, putative, expressed K07297: adiponectin receptor
3 Sobic.009G048700 expressed protein -
4 Sobic.006G199500 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
5 Sobic.003G218000 ENT domain containing protein, expressed -
6 Sobic.010G198400 expressed protein -
7 Sobic.009G008000 transcription factor Dp, putative, expressed -
8 Sobic.010G038000 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G145000 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
10 Sobic.004G020200 expressed protein -
11 Sobic.001G417700 polyadenylate-binding protein, putative, expressed K13126: polyadenylate-binding protein
12 Sobic.008G155700 ankyrin repeat domain-containing protein 44, putative, expressed -
13 Sobic.002G243400 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
14 Sobic.009G006700 vacuolar ATP synthase, putative, expressed K02155: ATPeV0C, V-type H+-transporting ATPase 16kDa proteolipid subunit
15 Sobic.001G136000 PINHEAD, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
16 Sobic.002G304500 mutS family domain IV containing protein, expressed K08740: DNA mismatch repair protein MSH4
17 Sobic.009G002100 expressed protein -
18 Sobic.005G173700 - -
19 Sobic.008G056600 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.007G128000 cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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