Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G173700.1,Sobic.005G173700.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PT47
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G038400 fruit bromelain precursor, putative, expressed -
2 Sobic.008G155700 ankyrin repeat domain-containing protein 44, putative, expressed -
3 Sobic.005G144500 glycosyltransferase, putative, expressed -
4 Sobic.009G002100 expressed protein -
5 Sobic.009G048700 expressed protein -
6 Sobic.010G038000 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G076600 hydrolase, acting on carbon-nitrogen, putative, expressed -
8 Sobic.006G254400 expressed protein -
9 Sobic.009G006700 vacuolar ATP synthase, putative, expressed K02155: ATPeV0C, V-type H+-transporting ATPase 16kDa proteolipid subunit
10 Sobic.007G171700 miro, putative, expressed K07953: GTP-binding protein SAR1
11 Sobic.001G417700 polyadenylate-binding protein, putative, expressed K13126: polyadenylate-binding protein
12 Sobic.001G117701 - -
13 Sobic.003G001901 - -
14 Sobic.007G094700 - -
15 Sobic.007G219601 - -
16 Sobic.008G056600 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G116050 - -
18 Sobic.003G218000 ENT domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G080450 - -
20 Sobic.002G418300 vacuolar-sorting receptor precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G173700 Sobic005G173700 Sobic004G038400 Sobic004G038400 Sobic005G173700--Sobic004G038400 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic005G173700--Sobic008G155700 Sobic005G144500 Sobic005G144500 Sobic005G173700--Sobic005G144500 Sobic009G002100 Sobic009G002100 Sobic005G173700--Sobic009G002100 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic005G173700--Sobic009G048700 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic005G173700--Sobic010G038000 Sobic001G076600 Sobic001G076600 Sobic005G173700--Sobic001G076600 Sobic006G254400 Sobic006G254400 Sobic005G173700--Sobic006G254400 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic005G173700--Sobic009G006700 Sobic004G038400--Sobic005G173700 Sobic004G038400--Sobic009G048700 Sobic004G038400--Sobic001G076600 Sobic004G168900 Sobic004G168900 Sobic004G038400--Sobic004G168900 Sobic003G005700 Sobic003G005700 Sobic004G038400--Sobic003G005700 Sobic007G144100 Sobic007G144100 Sobic004G038400--Sobic007G144100 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic004G038400--Sobic002G243400 Sobic008G056600 Sobic008G056600 Sobic004G038400--Sobic008G056600 Sobic004G038400--Sobic009G002100 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic008G155700--Sobic007G094700 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic008G155700--Sobic001G417700 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic008G155700--Sobic002G418300 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic008G155700--Sobic004G203150 Sobic008G155700--Sobic009G048700 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic008G155700--Sobic007G219601 Sobic003G133600 Sobic003G133600 Sobic008G155700--Sobic003G133600 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic008G155700--Sobic009G008000 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic008G155700--Sobic009G145000 Sobic006G064450 Sobic006G064450 Sobic005G144500--Sobic006G064450 Sobic005G144500--Sobic007G219601 Sobic005G144500--Sobic007G094700 Sobic005G144500--Sobic008G155700 Sobic005G144500--Sobic009G006700 Sobic005G144500--Sobic003G133600 Sobic005G144500--Sobic004G203150 Sobic010G049700 Sobic010G049700 Sobic005G144500--Sobic010G049700 Sobic005G144500--Sobic010G038000 Sobic009G002100--Sobic009G145000 Sobic009G002100--Sobic002G243400 Sobic009G002100--Sobic001G417700 Sobic009G002100--Sobic002G418300 Sobic001G240600 Sobic001G240600 Sobic009G002100--Sobic001G240600 Sobic009G002100--Sobic008G155700 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic009G002100--Sobic002G189500 Sobic004G080800 Sobic004G080800 Sobic009G002100--Sobic004G080800 Sobic001G220500 Sobic001G220500 Sobic009G002100--Sobic001G220500 Sobic009G048700--Sobic009G008000 Sobic009G048700--Sobic001G417700 Sobic009G048700--Sobic008G155700 Sobic009G048700--Sobic009G145000 Sobic009G048700--Sobic007G094700 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic009G048700--Sobic006G199500 Sobic009G048700--Sobic004G203150 Sobic009G048700--Sobic002G418300 Sobic009G048700--Sobic007G219601 Sobic010G038000--Sobic009G006700 Sobic010G038000--Sobic009G048700 Sobic010G038000--Sobic007G219601 Sobic010G198400 Sobic010G198400 Sobic010G038000--Sobic010G198400 Sobic010G038000--Sobic001G417700 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic010G038000--Sobic004G020200 Sobic010G038000--Sobic007G094700 Sobic010G038000--Sobic002G243400 Sobic010G038000--Sobic008G155700 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic001G076600--Sobic003G352900 Sobic001G076600--Sobic007G144100 Sobic008G166100 Sobic008G166100 Sobic001G076600--Sobic008G166100 Sobic001G076600--Sobic004G038400 Sobic002G299500 Sobic002G299500 Sobic001G076600--Sobic002G299500 Sobic004G045632 Sobic004G045632 Sobic001G076600--Sobic004G045632 Sobic003G258100 Sobic003G258100 Sobic001G076600--Sobic003G258100 Sobic001G076600--Sobic005G173700 Sobic003G376900 Sobic003G376900 Sobic001G076600--Sobic003G376900 Sobic006G254400--Sobic004G020200 Sobic006G254400--Sobic010G198400 Sobic002G424200 Sobic002G424200 Sobic006G254400--Sobic002G424200 Sobic006G254400--Sobic001G417700 Sobic006G254400--Sobic010G038000 Sobic006G254400--Sobic002G418300 Sobic006G254400--Sobic009G048700 Sobic006G254400--Sobic005G144500 Sobic003G211800 Sobic003G211800 Sobic006G254400--Sobic003G211800 Sobic009G006700--Sobic007G219601 Sobic009G006700--Sobic007G094700 Sobic009G006700--Sobic004G203150 Sobic009G006700--Sobic009G048700 Sobic009G006700--Sobic009G008000 Sobic009G006700--Sobic005G144500 Sobic009G006700--Sobic008G155700 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic009G006700--Sobic006G038700 Sobic009G006700--Sobic010G038000
Octagon: transcription factors


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