Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G001901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q0J5
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33086:SF14 PTHR33086
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g13870.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G171700 miro, putative, expressed K07953: GTP-binding protein SAR1
2 Sobic.005G173700 - -
3 Sobic.007G144100 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, putative, expressed K03252: translation initiation factor 3 subunit C
4 Sobic.002G080450 - -
5 Sobic.003G218000 ENT domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G254400 expressed protein -
7 Sobic.002G123300 expressed protein -
8 Sobic.001G034200 60S ribosomal protein L36-2, putative, expressed K02920: RP-L36e, large subunit ribosomal protein L36e
9 Sobic.008G041300 - K14777: DDX47, ATP-dependent RNA helicase DDX47/RRP3
10 Sobic.005G144500 glycosyltransferase, putative, expressed -
11 Sobic.010G049700 expressed protein -
12 Sobic.003G258100 dynamin family protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G038400 fruit bromelain precursor, putative, expressed -
14 Sobic.001G076600 hydrolase, acting on carbon-nitrogen, putative, expressed -
15 Sobic.004G020200 expressed protein -
16 Sobic.010G038000 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G116050 - -
18 Sobic.009G002100 expressed protein -
19 Sobic.002G099700 OsFBX195 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G345500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G001901 Sobic003G001901 Sobic007G171700 Sobic007G171700 Sobic003G001901--Sobic007G171700 Sobic005G173700 Sobic005G173700 Sobic003G001901--Sobic005G173700 Sobic007G144100 Sobic007G144100 Sobic003G001901--Sobic007G144100 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic003G001901--Sobic002G080450 Sobic003G218000 Sobic003G218000 Sobic003G001901--Sobic003G218000 Sobic006G254400 Sobic006G254400 Sobic003G001901--Sobic006G254400 Sobic002G123300 Sobic002G123300 Sobic003G001901--Sobic002G123300 Sobic001G034200 Sobic001G034200 Sobic003G001901--Sobic001G034200 Sobic008G041300 Sobic008G041300 Sobic003G001901--Sobic008G041300 Sobic007G171700--Sobic003G001901 Sobic010G049700 Sobic010G049700 Sobic007G171700--Sobic010G049700 Sobic007G171700--Sobic005G173700 Sobic007G171700--Sobic003G218000 Sobic007G171700--Sobic006G254400 Sobic007G171700--Sobic002G080450 Sobic005G144500 Sobic005G144500 Sobic007G171700--Sobic005G144500 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic007G171700--Sobic002G099700 Sobic010G143633 Sobic010G143633 Sobic007G171700--Sobic010G143633 Sobic004G038400 Sobic004G038400 Sobic005G173700--Sobic004G038400 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic005G173700--Sobic008G155700 Sobic005G173700--Sobic005G144500 Sobic009G002100 Sobic009G002100 Sobic005G173700--Sobic009G002100 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic005G173700--Sobic009G048700 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic005G173700--Sobic010G038000 Sobic001G076600 Sobic001G076600 Sobic005G173700--Sobic001G076600 Sobic005G173700--Sobic006G254400 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic005G173700--Sobic009G006700 Sobic003G258100 Sobic003G258100 Sobic007G144100--Sobic003G258100 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic007G144100--Sobic003G352900 Sobic007G144100--Sobic001G076600 Sobic003G217800 Sobic003G217800 Sobic007G144100--Sobic003G217800 Sobic010G058300 Sobic010G058300 Sobic007G144100--Sobic010G058300 Sobic001G506400 Sobic001G506400 Sobic007G144100--Sobic001G506400 Sobic002G299500 Sobic002G299500 Sobic007G144100--Sobic002G299500 Sobic004G045632 Sobic004G045632 Sobic007G144100--Sobic004G045632 Sobic007G144100--Sobic004G038400 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic002G080450--Sobic001G136000 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic002G080450--Sobic009G060100 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic002G080450--Sobic007G128000 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic002G080450--Sobic008G029800 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic002G080450--Sobic007G082100 Sobic002G080450--Sobic002G099700 Sobic002G080450--Sobic002G123300 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic002G080450--Sobic010G129450 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic002G080450--Sobic001G417700 Sobic003G218000--Sobic001G136000 Sobic003G218000--Sobic007G128000 Sobic003G218000--Sobic001G417700 Sobic003G218000--Sobic002G080450 Sobic003G218000--Sobic002G099700 Sobic003G218000--Sobic009G048700 Sobic008G056600 Sobic008G056600 Sobic003G218000--Sobic008G056600 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic003G218000--Sobic004G020200 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic003G218000--Sobic007G094700 Sobic006G254400--Sobic004G020200 Sobic010G198400 Sobic010G198400 Sobic006G254400--Sobic010G198400 Sobic002G424200 Sobic002G424200 Sobic006G254400--Sobic002G424200 Sobic006G254400--Sobic001G417700 Sobic006G254400--Sobic010G038000 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic006G254400--Sobic002G418300 Sobic006G254400--Sobic009G048700 Sobic006G254400--Sobic005G144500 Sobic003G211800 Sobic003G211800 Sobic006G254400--Sobic003G211800 Sobic003G133600 Sobic003G133600 Sobic002G123300--Sobic003G133600 Sobic002G123300--Sobic002G080450 Sobic006G064450 Sobic006G064450 Sobic002G123300--Sobic006G064450 Sobic002G123300--Sobic007G094700 Sobic002G123300--Sobic001G417700 Sobic001G068066 Sobic001G068066 Sobic002G123300--Sobic001G068066 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic002G123300--Sobic007G219601 Sobic005G078000 Sobic005G078000 Sobic002G123300--Sobic005G078000 Sobic002G123300--Sobic002G418300 Sobic001G034200--Sobic002G080450 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic001G034200--Sobic010G266600 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic001G034200--Sobic010G038300 Sobic004G168900 Sobic004G168900 Sobic001G034200--Sobic004G168900 Sobic001G034200--Sobic002G123300 Sobic001G034200--Sobic010G129450 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic001G034200--Sobic007G063800 Sobic005G202901 Sobic005G202901 Sobic001G034200--Sobic005G202901 Sobic001G034200--Sobic001G136000 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic008G041300--Sobic002G016000 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic008G041300--Sobic005G201200 Sobic010G255400 Sobic010G255400 Sobic008G041300--Sobic010G255400 Sobic008G007800 Sobic008G007800 Sobic008G041300--Sobic008G007800 Sobic008G041300--Sobic006G254400 Sobic001G117701 Sobic001G117701 Sobic008G041300--Sobic001G117701 Sobic001G075201 Sobic001G075201 Sobic008G041300--Sobic001G075201 Sobic008G041300--Sobic010G038000 Sobic008G041300--Sobic009G002100
Octagon: transcription factors


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