Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G123300.1
Synonym Sb02g010670
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X534
Pfam -
Panther DB PTHR35278 PTHR35278:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G78922 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g15800.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016924
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G133600 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
2 Sobic.002G080450 - -
3 Sobic.006G064450 - -
4 Sobic.007G094700 - -
5 Sobic.001G417700 polyadenylate-binding protein, putative, expressed K13126: polyadenylate-binding protein
6 Sobic.001G068066 - -
7 Sobic.007G219601 - -
8 Sobic.005G078000 - -
9 Sobic.002G418300 vacuolar-sorting receptor precursor, putative, expressed -
10 Sobic.001G240600 TATA-binding protein, putative, expressed K03120: TBP, transcription initiation factor TFIID TATA-box-binding protein
11 Sobic.008G056600 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G101600 - -
13 Sobic.002G190750 - -
14 Sobic.004G328200 - -
15 Sobic.009G250300 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G029300 anthranilate synthase component I-1, chloroplast precursor, putative, expressed K01657: anthranilate synthase component I
17 Sobic.004G014200 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
18 Sobic.007G128000 cytochrome P450, putative, expressed -
19 Sobic.001G136000 PINHEAD, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
20 Sobic.004G203150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G123300 Sobic002G123300 Sobic003G133600 Sobic003G133600 Sobic002G123300--Sobic003G133600 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic002G123300--Sobic002G080450 Sobic006G064450 Sobic006G064450 Sobic002G123300--Sobic006G064450 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic002G123300--Sobic007G094700 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic002G123300--Sobic001G417700 Sobic001G068066 Sobic001G068066 Sobic002G123300--Sobic001G068066 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic002G123300--Sobic007G219601 Sobic005G078000 Sobic005G078000 Sobic002G123300--Sobic005G078000 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic002G123300--Sobic002G418300 Sobic003G133600--Sobic007G094700 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic003G133600--Sobic004G203150 Sobic003G133600--Sobic007G219601 Sobic003G133600--Sobic001G068066 Sobic004G328200 Sobic004G328200 Sobic003G133600--Sobic004G328200 Sobic003G133600--Sobic002G418300 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic003G133600--Sobic001G029300 Sobic003G133600--Sobic006G064450 Sobic003G133600--Sobic005G078000 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic002G080450--Sobic001G136000 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic002G080450--Sobic009G060100 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic002G080450--Sobic007G128000 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic002G080450--Sobic008G029800 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic002G080450--Sobic007G082100 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic002G080450--Sobic002G099700 Sobic002G080450--Sobic002G123300 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic002G080450--Sobic010G129450 Sobic002G080450--Sobic001G417700 Sobic006G064450--Sobic003G133600 Sobic006G064450--Sobic007G094700 Sobic006G064450--Sobic007G219601 Sobic006G064450--Sobic004G203150 Sobic006G064450--Sobic001G068066 Sobic006G064450--Sobic005G078000 Sobic006G064450--Sobic002G418300 Sobic006G064450--Sobic004G328200 Sobic005G144500 Sobic005G144500 Sobic006G064450--Sobic005G144500 Sobic007G094700--Sobic004G203150 Sobic007G094700--Sobic007G219601 Sobic007G094700--Sobic003G133600 Sobic007G094700--Sobic002G418300 Sobic007G094700--Sobic001G417700 Sobic007G094700--Sobic004G328200 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic007G094700--Sobic008G155700 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic007G094700--Sobic009G008000 Sobic007G094700--Sobic001G029300 Sobic001G417700--Sobic007G128000 Sobic001G417700--Sobic002G418300 Sobic001G417700--Sobic007G094700 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic001G417700--Sobic009G145000 Sobic002G101600 Sobic002G101600 Sobic001G417700--Sobic002G101600 Sobic006G266400 Sobic006G266400 Sobic001G417700--Sobic006G266400 Sobic001G417700--Sobic001G136000 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic001G417700--Sobic002G189500 Sobic001G240600 Sobic001G240600 Sobic001G417700--Sobic001G240600 Sobic001G068066--Sobic005G078000 Sobic009G207700 Sobic009G207700 Sobic001G068066--Sobic009G207700 Sobic006G074150 Sobic006G074150 Sobic001G068066--Sobic006G074150 Sobic002G190750 Sobic002G190750 Sobic001G068066--Sobic002G190750 Sobic003G019450 Sobic003G019450 Sobic001G068066--Sobic003G019450 Sobic001G068066--Sobic003G133600 Sobic001G068066--Sobic001G029300 Sobic001G163666 Sobic001G163666 Sobic001G068066--Sobic001G163666 Sobic009G250300 Sobic009G250300 Sobic001G068066--Sobic009G250300 Sobic007G219601--Sobic007G094700 Sobic007G219601--Sobic004G203150 Sobic007G219601--Sobic003G133600 Sobic007G219601--Sobic002G418300 Sobic007G219601--Sobic006G064450 Sobic007G219601--Sobic008G155700 Sobic007G219601--Sobic009G008000 Sobic007G219601--Sobic001G417700 Sobic007G219601--Sobic004G328200 Sobic005G078000--Sobic001G068066 Sobic005G078000--Sobic009G207700 Sobic005G078000--Sobic006G074150 Sobic005G078000--Sobic003G133600 Sobic005G078000--Sobic002G190750 Sobic005G078000--Sobic003G019450 Sobic005G078000--Sobic001G029300 Sobic005G078000--Sobic001G163666 Sobic010G177200 Sobic010G177200 Sobic005G078000--Sobic010G177200 Sobic002G418300--Sobic001G417700 Sobic002G418300--Sobic007G094700 Sobic002G418300--Sobic003G133600 Sobic002G418300--Sobic004G203150 Sobic002G418300--Sobic001G029300 Sobic002G418300--Sobic002G101600 Sobic002G418300--Sobic004G328200 Sobic002G418300--Sobic002G189500 Sobic002G418300--Sobic008G155700
Octagon: transcription factors


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