Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G144500.2
Synonym Sb05g020930
Functional annotation glycosyltransferase, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RIK5
Pfam PF05637
Panther DB PTHR31311 PTHR31311:SF10
NCBI CDD KOG4748; Subunit of Golgi mannosyltransferase complex
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016757; transferase activity, transferring glycosyl groups GO:0016021integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G22900 : Galactosyl transferase GMA12/MNN10 family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g34390.1 : glycosyltransferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033549 , Zm00025a002120 , Zm00025a033551 , Zm00025a033550 , Zm00025a053888
Brachypodium KQK22016 , KQK01531 , PNT63497
Barley HORVU7Hr1G102070.1 , HORVU7Hr1G102070.2
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G064450 - -
2 Sobic.007G219601 - -
3 Sobic.007G094700 - -
4 Sobic.008G155700 ankyrin repeat domain-containing protein 44, putative, expressed -
5 Sobic.009G006700 vacuolar ATP synthase, putative, expressed K02155: ATPeV0C, V-type H+-transporting ATPase 16kDa proteolipid subunit
6 Sobic.003G133600 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
7 Sobic.004G203150 - -
8 Sobic.010G049700 expressed protein -
9 Sobic.010G038000 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G418300 vacuolar-sorting receptor precursor, putative, expressed -
11 Sobic.002G424200 SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-1, putative, expressed K07199: 5'-AMP-activated protein kinase, regulatory beta subunit
12 Sobic.009G048700 expressed protein -
13 Sobic.001G417700 polyadenylate-binding protein, putative, expressed K13126: polyadenylate-binding protein
14 Sobic.001G345500 - -
15 Sobic.009G008000 transcription factor Dp, putative, expressed -
16 Sobic.004G020200 expressed protein -
17 Sobic.006G254400 expressed protein -
18 Sobic.002G123300 expressed protein -
19 Sobic.004G116050 - -
20 Sobic.008G056600 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G144500 Sobic005G144500 Sobic006G064450 Sobic006G064450 Sobic005G144500--Sobic006G064450 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic005G144500--Sobic007G219601 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic005G144500--Sobic007G094700 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic005G144500--Sobic008G155700 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic005G144500--Sobic009G006700 Sobic003G133600 Sobic003G133600 Sobic005G144500--Sobic003G133600 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic005G144500--Sobic004G203150 Sobic010G049700 Sobic010G049700 Sobic005G144500--Sobic010G049700 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic005G144500--Sobic010G038000 Sobic006G064450--Sobic003G133600 Sobic006G064450--Sobic007G094700 Sobic006G064450--Sobic007G219601 Sobic006G064450--Sobic004G203150 Sobic001G068066 Sobic001G068066 Sobic006G064450--Sobic001G068066 Sobic005G078000 Sobic005G078000 Sobic006G064450--Sobic005G078000 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic006G064450--Sobic002G418300 Sobic004G328200 Sobic004G328200 Sobic006G064450--Sobic004G328200 Sobic006G064450--Sobic005G144500 Sobic007G219601--Sobic007G094700 Sobic007G219601--Sobic004G203150 Sobic007G219601--Sobic003G133600 Sobic007G219601--Sobic002G418300 Sobic007G219601--Sobic006G064450 Sobic007G219601--Sobic008G155700 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic007G219601--Sobic009G008000 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic007G219601--Sobic001G417700 Sobic007G219601--Sobic004G328200 Sobic007G094700--Sobic004G203150 Sobic007G094700--Sobic007G219601 Sobic007G094700--Sobic003G133600 Sobic007G094700--Sobic002G418300 Sobic007G094700--Sobic001G417700 Sobic007G094700--Sobic004G328200 Sobic007G094700--Sobic008G155700 Sobic007G094700--Sobic009G008000 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic007G094700--Sobic001G029300 Sobic008G155700--Sobic007G094700 Sobic008G155700--Sobic001G417700 Sobic008G155700--Sobic002G418300 Sobic008G155700--Sobic004G203150 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic008G155700--Sobic009G048700 Sobic008G155700--Sobic007G219601 Sobic008G155700--Sobic003G133600 Sobic008G155700--Sobic009G008000 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic008G155700--Sobic009G145000 Sobic009G006700--Sobic007G219601 Sobic009G006700--Sobic007G094700 Sobic009G006700--Sobic004G203150 Sobic009G006700--Sobic009G048700 Sobic009G006700--Sobic009G008000 Sobic009G006700--Sobic005G144500 Sobic009G006700--Sobic008G155700 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic009G006700--Sobic006G038700 Sobic009G006700--Sobic010G038000 Sobic003G133600--Sobic007G094700 Sobic003G133600--Sobic004G203150 Sobic003G133600--Sobic007G219601 Sobic003G133600--Sobic001G068066 Sobic003G133600--Sobic004G328200 Sobic003G133600--Sobic002G418300 Sobic003G133600--Sobic001G029300 Sobic003G133600--Sobic006G064450 Sobic003G133600--Sobic005G078000 Sobic004G203150--Sobic007G094700 Sobic004G203150--Sobic007G219601 Sobic004G203150--Sobic003G133600 Sobic004G203150--Sobic002G418300 Sobic004G203150--Sobic001G029300 Sobic004G203150--Sobic004G328200 Sobic004G203150--Sobic001G417700 Sobic004G203150--Sobic009G008000 Sobic004G203150--Sobic008G155700 Sobic004G116050 Sobic004G116050 Sobic010G049700--Sobic004G116050 Sobic010G049700--Sobic005G144500 Sobic010G143633 Sobic010G143633 Sobic010G049700--Sobic010G143633 Sobic010G049700--Sobic006G064450 Sobic001G345500 Sobic001G345500 Sobic010G049700--Sobic001G345500 Sobic010G049700--Sobic009G006700 Sobic010G049700--Sobic007G219601 Sobic010G049700--Sobic006G038700 Sobic010G049700--Sobic007G094700 Sobic010G038000--Sobic009G006700 Sobic010G038000--Sobic009G048700 Sobic010G038000--Sobic007G219601 Sobic010G198400 Sobic010G198400 Sobic010G038000--Sobic010G198400 Sobic010G038000--Sobic001G417700 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic010G038000--Sobic004G020200 Sobic010G038000--Sobic007G094700 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic010G038000--Sobic002G243400 Sobic010G038000--Sobic008G155700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.