Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G049700.2
Synonym Sb10g004305
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VRG4
Pfam PF04601
Panther DB PTHR31205 PTHR31205:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G69900 : Actin cross-linking protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g06580.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041606 , Zm00025a041602 , Zm00025a041601
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.002G361500 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@Indole-acetic acid (IAA)-amido synthetase(PubMedID : 30367619)@OsGH3.8 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family


Gene co-expression network
sample Sobic010G049700 Sobic010G049700 Sobic004G116050 Sobic004G116050 Sobic010G049700--Sobic004G116050 Sobic005G144500 Sobic005G144500 Sobic010G049700--Sobic005G144500 Sobic010G143633 Sobic010G143633 Sobic010G049700--Sobic010G143633 Sobic006G064450 Sobic006G064450 Sobic010G049700--Sobic006G064450 Sobic001G345500 Sobic001G345500 Sobic010G049700--Sobic001G345500 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic010G049700--Sobic009G006700 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic010G049700--Sobic007G219601 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic010G049700--Sobic006G038700 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic010G049700--Sobic007G094700 Sobic004G116050--Sobic010G049700 Sobic004G116050--Sobic010G143633 Sobic004G116050--Sobic005G144500 Sobic001G117701 Sobic001G117701 Sobic004G116050--Sobic001G117701 Sobic004G116050--Sobic006G038700 Sobic004G116050--Sobic001G345500 Sobic004G116050--Sobic006G064450 Sobic004G116050--Sobic009G006700 Sobic008G105600 Sobic008G105600 Sobic004G116050--Sobic008G105600 Sobic005G144500--Sobic006G064450 Sobic005G144500--Sobic007G219601 Sobic005G144500--Sobic007G094700 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic005G144500--Sobic008G155700 Sobic005G144500--Sobic009G006700 Sobic003G133600 Sobic003G133600 Sobic005G144500--Sobic003G133600 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic005G144500--Sobic004G203150 Sobic005G144500--Sobic010G049700 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic005G144500--Sobic010G038000 Sobic010G143633--Sobic008G105600 Sobic005G048950 Sobic005G048950 Sobic010G143633--Sobic005G048950 Sobic010G143633--Sobic010G049700 Sobic010G143633--Sobic004G116050 Sobic010G143633--Sobic006G038700 Sobic010G143633--Sobic001G117701 Sobic010G143633--Sobic005G144500 Sobic007G171700 Sobic007G171700 Sobic010G143633--Sobic007G171700 Sobic010G143633--Sobic009G006700 Sobic006G064450--Sobic003G133600 Sobic006G064450--Sobic007G094700 Sobic006G064450--Sobic007G219601 Sobic006G064450--Sobic004G203150 Sobic001G068066 Sobic001G068066 Sobic006G064450--Sobic001G068066 Sobic005G078000 Sobic005G078000 Sobic006G064450--Sobic005G078000 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic006G064450--Sobic002G418300 Sobic004G328200 Sobic004G328200 Sobic006G064450--Sobic004G328200 Sobic006G064450--Sobic005G144500 Sobic001G345500--Sobic006G064450 Sobic001G345500--Sobic003G133600 Sobic001G345500--Sobic007G219601 Sobic001G345500--Sobic007G094700 Sobic001G345500--Sobic005G144500 Sobic001G345500--Sobic001G068066 Sobic001G345500--Sobic004G203150 Sobic001G345500--Sobic005G078000 Sobic001G345500--Sobic004G328200 Sobic009G006700--Sobic007G219601 Sobic009G006700--Sobic007G094700 Sobic009G006700--Sobic004G203150 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic009G006700--Sobic009G048700 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic009G006700--Sobic009G008000 Sobic009G006700--Sobic005G144500 Sobic009G006700--Sobic008G155700 Sobic009G006700--Sobic006G038700 Sobic009G006700--Sobic010G038000 Sobic007G219601--Sobic007G094700 Sobic007G219601--Sobic004G203150 Sobic007G219601--Sobic003G133600 Sobic007G219601--Sobic002G418300 Sobic007G219601--Sobic006G064450 Sobic007G219601--Sobic008G155700 Sobic007G219601--Sobic009G008000 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic007G219601--Sobic001G417700 Sobic007G219601--Sobic004G328200 Sobic006G038700--Sobic009G006700 Sobic006G038700--Sobic001G117701 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic006G038700--Sobic005G201200 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic006G038700--Sobic002G016000 Sobic006G038700--Sobic008G105600 Sobic006G038700--Sobic010G143633 Sobic002G361500 Sobic002G361500 Sobic006G038700--Sobic002G361500 Sobic006G038700--Sobic005G144500 Sobic010G198400 Sobic010G198400 Sobic006G038700--Sobic010G198400 Sobic007G094700--Sobic004G203150 Sobic007G094700--Sobic007G219601 Sobic007G094700--Sobic003G133600 Sobic007G094700--Sobic002G418300 Sobic007G094700--Sobic001G417700 Sobic007G094700--Sobic004G328200 Sobic007G094700--Sobic008G155700 Sobic007G094700--Sobic009G008000 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic007G094700--Sobic001G029300
Octagon: transcription factors


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