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Transcriptome id Sobic.005G003400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PPE7
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cDNA sequences
Sobic.005G003400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G188400 - -
2 Sobic.005G003600 - -
3 Sobic.008G066300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
4 Sobic.004G138450 - -
5 Sobic.002G239400 OsFBX338 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G539400 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
7 Sobic.004G213400 ATP8, putative, expressed -
8 Sobic.010G153400 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17506: PPM1L, protein phosphatase 1L
9 Sobic.008G023600 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
10 Sobic.001G440000 ras-related protein, putative, expressed K07933: Rab-like protein 3
11 Sobic.010G036901 - -
12 Sobic.005G110547 - -
13 Sobic.001G504700 BSD domain-containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.008G162300 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G348400 adenylyl-sulfate kinase, putative, expressed K00860: adenylylsulfate kinase
16 Sobic.008G054700 growth regulator related protein, putative, expressed -
17 Sobic.008G007700 expressed protein -
18 Sobic.002G076500 protein Kinase-associated protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
19 Sobic.005G178300 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
20 Sobic.008G143100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G003400 Sobic005G003400 Sobic002G188400 Sobic002G188400 Sobic005G003400--Sobic002G188400 Sobic005G003600 Sobic005G003600 Sobic005G003400--Sobic005G003600 Sobic008G066300 Sobic008G066300 Sobic005G003400--Sobic008G066300 Sobic004G138450 Sobic004G138450 Sobic005G003400--Sobic004G138450 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic005G003400--Sobic002G239400 Sobic001G539400 Sobic001G539400 Sobic005G003400--Sobic001G539400 Sobic004G213400 Sobic004G213400 Sobic005G003400--Sobic004G213400 Sobic010G153400 Sobic010G153400 Sobic005G003400--Sobic010G153400 Sobic008G023600 Sobic008G023600 Sobic005G003400--Sobic008G023600 Sobic002G188400--Sobic005G003400 Sobic002G304500 Sobic002G304500 Sobic002G188400--Sobic002G304500 Sobic008G007700 Sobic008G007700 Sobic002G188400--Sobic008G007700 Sobic002G188400--Sobic008G023600 Sobic010G036901 Sobic010G036901 Sobic002G188400--Sobic010G036901 Sobic002G066700 Sobic002G066700 Sobic002G188400--Sobic002G066700 Sobic004G064800 Sobic004G064800 Sobic002G188400--Sobic004G064800 Sobic004G328100 Sobic004G328100 Sobic002G188400--Sobic004G328100 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic002G188400--Sobic005G201200 Sobic005G003600--Sobic001G539400 Sobic004G046800 Sobic004G046800 Sobic005G003600--Sobic004G046800 Sobic001G453600 Sobic001G453600 Sobic005G003600--Sobic001G453600 Sobic008G124600 Sobic008G124600 Sobic005G003600--Sobic008G124600 Sobic003G065201 Sobic003G065201 Sobic005G003600--Sobic003G065201 Sobic001G504700 Sobic001G504700 Sobic005G003600--Sobic001G504700 Sobic006G162400 Sobic006G162400 Sobic005G003600--Sobic006G162400 Sobic009G229400 Sobic009G229400 Sobic005G003600--Sobic009G229400 Sobic010G145100 Sobic010G145100 Sobic005G003600--Sobic010G145100 Sobic008G066300--Sobic005G003400 Sobic008G066300--Sobic002G188400 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic008G066300--Sobic005G127900 Sobic005G178300 Sobic005G178300 Sobic008G066300--Sobic005G178300 Sobic003G042200 Sobic003G042200 Sobic008G066300--Sobic003G042200 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic008G066300--Sobic005G110547 Sobic005G150600 Sobic005G150600 Sobic008G066300--Sobic005G150600 Sobic001G025700 Sobic001G025700 Sobic008G066300--Sobic001G025700 Sobic008G066300--Sobic008G023600 Sobic001G025500 Sobic001G025500 Sobic004G138450--Sobic001G025500 Sobic005G076800 Sobic005G076800 Sobic004G138450--Sobic005G076800 Sobic004G298200 Sobic004G298200 Sobic004G138450--Sobic004G298200 Sobic001G307500 Sobic001G307500 Sobic004G138450--Sobic001G307500 Sobic004G138450--Sobic001G453600 Sobic004G138450--Sobic004G046800 Sobic004G138450--Sobic003G065201 Sobic008G054700 Sobic008G054700 Sobic004G138450--Sobic008G054700 Sobic004G138450--Sobic006G162400 Sobic002G239400--Sobic004G213400 Sobic002G348400 Sobic002G348400 Sobic002G239400--Sobic002G348400 Sobic001G131900 Sobic001G131900 Sobic002G239400--Sobic001G131900 Sobic001G117900 Sobic001G117900 Sobic002G239400--Sobic001G117900 Sobic002G392400 Sobic002G392400 Sobic002G239400--Sobic002G392400 Sobic003G293400 Sobic003G293400 Sobic002G239400--Sobic003G293400 Sobic007G105700 Sobic007G105700 Sobic002G239400--Sobic007G105700 Sobic009G054400 Sobic009G054400 Sobic002G239400--Sobic009G054400 Sobic005G048600 Sobic005G048600 Sobic002G239400--Sobic005G048600 Sobic001G539400--Sobic008G054700 Sobic001G539400--Sobic003G065201 Sobic001G539400--Sobic008G007700 Sobic003G358600 Sobic003G358600 Sobic001G539400--Sobic003G358600 Sobic005G174750 Sobic005G174750 Sobic001G539400--Sobic005G174750 Sobic006G193400 Sobic006G193400 Sobic001G539400--Sobic006G193400 Sobic009G178400 Sobic009G178400 Sobic001G539400--Sobic009G178400 Sobic001G539400--Sobic009G229400 Sobic001G387300 Sobic001G387300 Sobic001G539400--Sobic001G387300 Sobic004G213400--Sobic002G239400 Sobic004G213400--Sobic005G110547 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic004G213400--Sobic004G298600 Sobic004G213400--Sobic003G293400 Sobic001G248400 Sobic001G248400 Sobic004G213400--Sobic001G248400 Sobic004G213400--Sobic001G131900 Sobic009G220700 Sobic009G220700 Sobic004G213400--Sobic009G220700 Sobic002G308000 Sobic002G308000 Sobic004G213400--Sobic002G308000 Sobic004G213400--Sobic007G105700 Sobic010G153400--Sobic002G348400 Sobic003G004800 Sobic003G004800 Sobic010G153400--Sobic003G004800 Sobic010G153400--Sobic002G392400 Sobic008G022400 Sobic008G022400 Sobic010G153400--Sobic008G022400 Sobic010G153400--Sobic001G131900 Sobic010G153400--Sobic003G293400 Sobic006G265800 Sobic006G265800 Sobic010G153400--Sobic006G265800 Sobic010G153400--Sobic001G117900 Sobic010G153400--Sobic004G328100 Sobic008G023600--Sobic002G188400 Sobic008G023600--Sobic005G003400 Sobic008G023600--Sobic008G066300 Sobic005G162800 Sobic005G162800 Sobic008G023600--Sobic005G162800 Sobic008G023600--Sobic010G036901 Sobic008G064300 Sobic008G064300 Sobic008G023600--Sobic008G064300 Sobic010G009600 Sobic010G009600 Sobic008G023600--Sobic010G009600 Sobic004G313400 Sobic004G313400 Sobic008G023600--Sobic004G313400 Sobic008G023600--Sobic002G239400
Octagon: transcription factors


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