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Transcriptome id Sobic.005G003600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PPF9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G539400 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
2 Sobic.004G046800 expressed protein -
3 Sobic.001G453600 beta-hexosaminidase precursor, putative, expressed K12373: hexosaminidase
4 Sobic.008G124600 expressed protein -
5 Sobic.003G065201 - -
6 Sobic.001G504700 BSD domain-containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G162400 expressed protein -
8 Sobic.009G229400 60S acidic ribosomal protein P0, putative, expressed K02941: RP-LP0, large subunit ribosomal protein LP0
9 Sobic.010G145100 - -
10 Sobic.005G076800 OsFBX412 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.009G044700 DTA2, putative, expressed -
12 Sobic.008G054700 growth regulator related protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G124900 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family, putative, expressed K10251: HSD17B12, KAR, 17beta-estradiol 17-dehydrogenase / very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase
14 Sobic.005G174750 - -
15 Sobic.003G358600 similar to Phosphorylase(PubMedID : 29862293)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@alpha-glucan phosphorylast isozyme, putative, expressed K00688: PYG, glycogen phosphorylase
16 Sobic.001G167600 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G269400 regulator of chromosome condensation, putative, expressed -
18 Sobic.003G008000 cyclin-T1-1, putative, expressed -
19 Sobic.008G050200 - -
20 Sobic.006G204400 maltose excess protein 1-like, chloroplast precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G003600 Sobic005G003600 Sobic001G539400 Sobic001G539400 Sobic005G003600--Sobic001G539400 Sobic004G046800 Sobic004G046800 Sobic005G003600--Sobic004G046800 Sobic001G453600 Sobic001G453600 Sobic005G003600--Sobic001G453600 Sobic008G124600 Sobic008G124600 Sobic005G003600--Sobic008G124600 Sobic003G065201 Sobic003G065201 Sobic005G003600--Sobic003G065201 Sobic001G504700 Sobic001G504700 Sobic005G003600--Sobic001G504700 Sobic006G162400 Sobic006G162400 Sobic005G003600--Sobic006G162400 Sobic009G229400 Sobic009G229400 Sobic005G003600--Sobic009G229400 Sobic010G145100 Sobic010G145100 Sobic005G003600--Sobic010G145100 Sobic008G054700 Sobic008G054700 Sobic001G539400--Sobic008G054700 Sobic001G539400--Sobic003G065201 Sobic008G007700 Sobic008G007700 Sobic001G539400--Sobic008G007700 Sobic003G358600 Sobic003G358600 Sobic001G539400--Sobic003G358600 Sobic005G174750 Sobic005G174750 Sobic001G539400--Sobic005G174750 Sobic006G193400 Sobic006G193400 Sobic001G539400--Sobic006G193400 Sobic009G178400 Sobic009G178400 Sobic001G539400--Sobic009G178400 Sobic001G539400--Sobic009G229400 Sobic001G387300 Sobic001G387300 Sobic001G539400--Sobic001G387300 Sobic008G055200 Sobic008G055200 Sobic004G046800--Sobic008G055200 Sobic001G194800 Sobic001G194800 Sobic004G046800--Sobic001G194800 Sobic001G106800 Sobic001G106800 Sobic004G046800--Sobic001G106800 Sobic002G192800 Sobic002G192800 Sobic004G046800--Sobic002G192800 Sobic008G120920 Sobic008G120920 Sobic004G046800--Sobic008G120920 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic004G046800--Sobic008G029800 Sobic010G124900 Sobic010G124900 Sobic004G046800--Sobic010G124900 Sobic001G117100 Sobic001G117100 Sobic004G046800--Sobic001G117100 Sobic008G030501 Sobic008G030501 Sobic004G046800--Sobic008G030501 Sobic001G453600--Sobic010G145100 Sobic001G453600--Sobic004G046800 Sobic006G093600 Sobic006G093600 Sobic001G453600--Sobic006G093600 Sobic001G453600--Sobic009G229400 Sobic009G202000 Sobic009G202000 Sobic001G453600--Sobic009G202000 Sobic001G453600--Sobic006G162400 Sobic001G453600--Sobic001G387300 Sobic003G024100 Sobic003G024100 Sobic001G453600--Sobic003G024100 Sobic009G061500 Sobic009G061500 Sobic001G453600--Sobic009G061500 Sobic004G256100 Sobic004G256100 Sobic008G124600--Sobic004G256100 Sobic007G193600 Sobic007G193600 Sobic008G124600--Sobic007G193600 Sobic001G474100 Sobic001G474100 Sobic008G124600--Sobic001G474100 Sobic003G018000 Sobic003G018000 Sobic008G124600--Sobic003G018000 Sobic001G103600 Sobic001G103600 Sobic008G124600--Sobic001G103600 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic008G124600--Sobic009G047900 Sobic001G518900 Sobic001G518900 Sobic008G124600--Sobic001G518900 Sobic008G144701 Sobic008G144701 Sobic008G124600--Sobic008G144701 Sobic001G241700 Sobic001G241700 Sobic008G124600--Sobic001G241700 Sobic003G065201--Sobic001G539400 Sobic008G050200 Sobic008G050200 Sobic003G065201--Sobic008G050200 Sobic006G204400 Sobic006G204400 Sobic003G065201--Sobic006G204400 Sobic003G065201--Sobic009G229400 Sobic010G027100 Sobic010G027100 Sobic003G065201--Sobic010G027100 Sobic003G065201--Sobic008G007700 Sobic002G074800 Sobic002G074800 Sobic003G065201--Sobic002G074800 Sobic009G252200 Sobic009G252200 Sobic003G065201--Sobic009G252200 Sobic002G180800 Sobic002G180800 Sobic003G065201--Sobic002G180800 Sobic001G504700--Sobic005G003600 Sobic006G052900 Sobic006G052900 Sobic001G504700--Sobic006G052900 Sobic001G504700--Sobic008G124600 Sobic001G504700--Sobic008G007700 Sobic007G060100 Sobic007G060100 Sobic001G504700--Sobic007G060100 Sobic001G504700--Sobic008G050200 Sobic001G504700--Sobic003G065201 Sobic001G504700--Sobic003G018000 Sobic003G258100 Sobic003G258100 Sobic001G504700--Sobic003G258100 Sobic006G162400--Sobic001G453600 Sobic006G162400--Sobic004G046800 Sobic006G134500 Sobic006G134500 Sobic006G162400--Sobic006G134500 Sobic001G356200 Sobic001G356200 Sobic006G162400--Sobic001G356200 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic006G162400--Sobic009G046900 Sobic010G255900 Sobic010G255900 Sobic006G162400--Sobic010G255900 Sobic004G113600 Sobic004G113600 Sobic006G162400--Sobic004G113600 Sobic006G162400--Sobic001G387300 Sobic010G130601 Sobic010G130601 Sobic006G162400--Sobic010G130601 Sobic009G229400--Sobic008G029800 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic009G229400--Sobic010G266600 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic009G229400--Sobic010G038300 Sobic009G229400--Sobic002G192800 Sobic009G229400--Sobic006G204400 Sobic008G071800 Sobic008G071800 Sobic009G229400--Sobic008G071800 Sobic009G229400--Sobic005G174750 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic009G229400--Sobic006G070032 Sobic002G060101 Sobic002G060101 Sobic009G229400--Sobic002G060101 Sobic001G398200 Sobic001G398200 Sobic010G145100--Sobic001G398200 Sobic010G145100--Sobic010G124900 Sobic010G145100--Sobic009G229400 Sobic010G145100--Sobic001G106800 Sobic010G145100--Sobic004G046800 Sobic010G145100--Sobic006G093600 Sobic002G111100 Sobic002G111100 Sobic010G145100--Sobic002G111100 Sobic003G100600 Sobic003G100600 Sobic010G145100--Sobic003G100600 Sobic010G145100--Sobic006G204400
Octagon: transcription factors


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