Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G008000.3,Sobic.003G008000.2,Sobic.003G008000.5,Sobic.003G008000.4,Sobic.003G008000.1
Synonym
Functional annotation cyclin-T1-1, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q0P5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g04010.2 : cyclin-T1-1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018879
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G104600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Caleosin-related family protein(PubMedID : 26320239)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@caleosin related protein, putative, expressed K17991: peroxygenase
2 Sobic.004G046800 expressed protein -
3 Sobic.008G029800 expressed protein -
4 Sobic.009G044700 DTA2, putative, expressed -
5 Sobic.004G007400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G030501 - -
7 Sobic.002G070100 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G240700 - -
9 Sobic.001G253750 - -
10 Sobic.007G112500 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G333001 - -
12 Sobic.006G070032 - K01193: INV, beta-fructofuranosidase
13 Sobic.006G017700 expressed protein -
14 Sobic.006G017900 DEFL55 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
15 Sobic.001G211700 MBTB33 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
16 Sobic.001G194800 TATA-binding protein, putative, expressed K03120: TBP, transcription initiation factor TFIID TATA-box-binding protein
17 Sobic.004G046700 OsFBLD3 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G386900 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase
19 Sobic.010G123800 expressed protein -
20 Sobic.005G140900 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G008000 Sobic003G008000 Sobic010G104600 Sobic010G104600 Sobic003G008000--Sobic010G104600 Sobic004G046800 Sobic004G046800 Sobic003G008000--Sobic004G046800 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic003G008000--Sobic008G029800 Sobic009G044700 Sobic009G044700 Sobic003G008000--Sobic009G044700 Sobic004G007400 Sobic004G007400 Sobic003G008000--Sobic004G007400 Sobic008G030501 Sobic008G030501 Sobic003G008000--Sobic008G030501 Sobic002G070100 Sobic002G070100 Sobic003G008000--Sobic002G070100 Sobic001G240700 Sobic001G240700 Sobic003G008000--Sobic001G240700 Sobic001G253750 Sobic001G253750 Sobic003G008000--Sobic001G253750 Sobic005G135100 Sobic005G135100 Sobic010G104600--Sobic005G135100 Sobic010G104600--Sobic001G240700 Sobic007G112500 Sobic007G112500 Sobic010G104600--Sobic007G112500 Sobic002G333001 Sobic002G333001 Sobic010G104600--Sobic002G333001 Sobic002G073600 Sobic002G073600 Sobic010G104600--Sobic002G073600 Sobic002G001200 Sobic002G001200 Sobic010G104600--Sobic002G001200 Sobic007G176900 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Octagon: transcription factors


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