Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G104600.2,Sobic.010G104600.1
Synonym Sb10g009140
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
Caleosin-related family protein (PubMedID : 26320239)
Up-reguralion under heat (PubMedID : 24916767)
caleosin related protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0VSE3 , C5Z7Z3
Pfam PF05042
Panther DB PTHR31495 PTHR31495:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology K17991; peroxygenase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G70670 : Caleosin-related family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g14324.1 : caleosin related protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.010G104600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G135100 expressed protein -
2 Sobic.001G240700 - -
3 Sobic.007G112500 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G333001 - -
5 Sobic.002G073600 transporter family protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G001200 - -
7 Sobic.007G176900 beta-galactosidase precursor, putative, expressed -
8 Sobic.006G093600 - -
9 Sobic.005G043300 - -
10 Sobic.002G384500 expressed protein -
11 Sobic.006G282100 DNA binding protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G005300 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
13 Sobic.006G074150 - -
14 Sobic.003G175950 - -
15 Sobic.001G165700 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G130500 - -
17 Sobic.001G171300 UDP-glucose 6-dehydrogenase, putative, expressed K00012: UGDH, UDPglucose 6-dehydrogenase
18 Sobic.009G203900 profilin domain containing protein, expressed K05759: profilin
19 Sobic.002G082400 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G222100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G104600 Sobic010G104600 Sobic005G135100 Sobic005G135100 Sobic010G104600--Sobic005G135100 Sobic001G240700 Sobic001G240700 Sobic010G104600--Sobic001G240700 Sobic007G112500 Sobic007G112500 Sobic010G104600--Sobic007G112500 Sobic002G333001 Sobic002G333001 Sobic010G104600--Sobic002G333001 Sobic002G073600 Sobic002G073600 Sobic010G104600--Sobic002G073600 Sobic002G001200 Sobic002G001200 Sobic010G104600--Sobic002G001200 Sobic007G176900 Sobic007G176900 Sobic010G104600--Sobic007G176900 Sobic006G093600 Sobic006G093600 Sobic010G104600--Sobic006G093600 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic010G104600--Sobic005G043300 Sobic002G106600 Sobic002G106600 Sobic005G135100--Sobic002G106600 Sobic002G257001 Sobic002G257001 Sobic005G135100--Sobic002G257001 Sobic005G135100--Sobic007G176900 Sobic004G042501 Sobic004G042501 Sobic005G135100--Sobic004G042501 Sobic007G070900 Sobic007G070900 Sobic005G135100--Sobic007G070900 Sobic005G135100--Sobic007G112500 Sobic001G333700 Sobic001G333700 Sobic005G135100--Sobic001G333700 Sobic005G003700 Sobic005G003700 Sobic005G135100--Sobic005G003700 Sobic004G308800 Sobic004G308800 Sobic005G135100--Sobic004G308800 Sobic001G167300 Sobic001G167300 Sobic001G240700--Sobic001G167300 Sobic009G234900 Sobic009G234900 Sobic001G240700--Sobic009G234900 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic001G240700--Sobic006G070032 Sobic010G121700 Sobic010G121700 Sobic001G240700--Sobic010G121700 Sobic008G024200 Sobic008G024200 Sobic001G240700--Sobic008G024200 Sobic003G004000 Sobic003G004000 Sobic001G240700--Sobic003G004000 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic001G240700--Sobic005G189100 Sobic001G089300 Sobic001G089300 Sobic001G240700--Sobic001G089300 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic001G240700--Sobic009G047100 Sobic007G112500--Sobic005G043300 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic007G112500--Sobic003G351100 Sobic007G035200 Sobic007G035200 Sobic007G112500--Sobic007G035200 Sobic006G020400 Sobic006G020400 Sobic007G112500--Sobic006G020400 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic007G112500--Sobic005G006400 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic007G112500--Sobic008G125801 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic007G112500--Sobic002G194300 Sobic010G240300 Sobic010G240300 Sobic007G112500--Sobic010G240300 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic007G112500--Sobic003G007650 Sobic001G063300 Sobic001G063300 Sobic002G333001--Sobic001G063300 Sobic002G015900 Sobic002G015900 Sobic002G333001--Sobic002G015900 Sobic002G333001--Sobic007G035200 Sobic002G333001--Sobic003G007650 Sobic002G333001--Sobic005G006400 Sobic007G134501 Sobic007G134501 Sobic002G333001--Sobic007G134501 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic002G333001--Sobic002G194201 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic002G333001--Sobic008G086500 Sobic001G337100 Sobic001G337100 Sobic002G333001--Sobic001G337100 Sobic005G207700 Sobic005G207700 Sobic002G073600--Sobic005G207700 Sobic001G269200 Sobic001G269200 Sobic002G073600--Sobic001G269200 Sobic010G107800 Sobic010G107800 Sobic002G073600--Sobic010G107800 Sobic006G043101 Sobic006G043101 Sobic002G073600--Sobic006G043101 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic002G073600--Sobic002G414000 Sobic005G220500 Sobic005G220500 Sobic002G073600--Sobic005G220500 Sobic009G110800 Sobic009G110800 Sobic002G073600--Sobic009G110800 Sobic007G129800 Sobic007G129800 Sobic002G073600--Sobic007G129800 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic002G073600--Sobic005G214800 Sobic005G093200 Sobic005G093200 Sobic002G001200--Sobic005G093200 Sobic005G172000 Sobic005G172000 Sobic002G001200--Sobic005G172000 Sobic002G104801 Sobic002G104801 Sobic002G001200--Sobic002G104801 Sobic004G228300 Sobic004G228300 Sobic002G001200--Sobic004G228300 Sobic009G089200 Sobic009G089200 Sobic002G001200--Sobic009G089200 Sobic010G166600 Sobic010G166600 Sobic002G001200--Sobic010G166600 Sobic006G143900 Sobic006G143900 Sobic002G001200--Sobic006G143900 Sobic003G335700 Sobic003G335700 Sobic002G001200--Sobic003G335700 Sobic003G145300 Sobic003G145300 Sobic002G001200--Sobic003G145300 Sobic006G205400 Sobic006G205400 Sobic007G176900--Sobic006G205400 Sobic003G333100 Sobic003G333100 Sobic007G176900--Sobic003G333100 Sobic001G212500 Sobic001G212500 Sobic007G176900--Sobic001G212500 Sobic010G144700 Sobic010G144700 Sobic007G176900--Sobic010G144700 Sobic007G176900--Sobic001G333700 Sobic001G093100 Sobic001G093100 Sobic007G176900--Sobic001G093100 Sobic005G040700 Sobic005G040700 Sobic007G176900--Sobic005G040700 Sobic010G051000 Sobic010G051000 Sobic007G176900--Sobic010G051000 Sobic001G288400 Sobic001G288400 Sobic007G176900--Sobic001G288400 Sobic010G242600 Sobic010G242600 Sobic006G093600--Sobic010G242600 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic006G093600--Sobic001G029300 Sobic002G190750 Sobic002G190750 Sobic006G093600--Sobic002G190750 Sobic001G163666 Sobic001G163666 Sobic006G093600--Sobic001G163666 Sobic002G101600 Sobic002G101600 Sobic006G093600--Sobic002G101600 Sobic009G207700 Sobic009G207700 Sobic006G093600--Sobic009G207700 Sobic006G074150 Sobic006G074150 Sobic006G093600--Sobic006G074150 Sobic006G093600--Sobic002G015900 Sobic001G068066 Sobic001G068066 Sobic006G093600--Sobic001G068066 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic005G043300--Sobic007G160501 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic005G043300--Sobic001G246001 Sobic005G043300--Sobic005G214800 Sobic003G445300 Sobic003G445300 Sobic005G043300--Sobic003G445300 Sobic005G043300--Sobic002G414000 Sobic005G043300--Sobic003G351100 Sobic005G043300--Sobic009G110800 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic005G043300--Sobic010G215000 Sobic005G043300--Sobic008G125801
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.