Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G504700.2
Synonym
Functional annotation BSD domain-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5SBK6
Pfam -
Panther DB PTHR31923 PTHR31923:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G69030 : BSD domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g49450.1 : BSD domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021885 , Zm00025a032603
Brachypodium KQK01517 , PNT69484
Barley HORVU6Hr1G072230.2 , HORVU6Hr1G072230.3 , HORVU6Hr1G072230.1
Wheat TraesCS6A02G287800 , TraesCS6A02G287800 , TraesCS6B02G317200 , TraesCS6D02G268500 , TraesCS6D02G268500
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G003600 - -
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11 Sobic.001G539400 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
12 Sobic.003G379000 OsMADS2 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
13 Sobic.007G144100 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, putative, expressed K03252: translation initiation factor 3 subunit C
14 Sobic.005G048500 serine esterase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G263400 expressed protein -
16 Sobic.009G142500 OsMADS4 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
17 Sobic.009G206100 expressed protein -
18 Sobic.001G218600 MATH domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G269400 regulator of chromosome condensation, putative, expressed -
20 Sobic.009G229400 60S acidic ribosomal protein P0, putative, expressed K02941: RP-LP0, large subunit ribosomal protein LP0


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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