Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G065201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q1U3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G539400 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
2 Sobic.008G050200 - -
3 Sobic.006G204400 maltose excess protein 1-like, chloroplast precursor, putative, expressed -
4 Sobic.009G229400 60S acidic ribosomal protein P0, putative, expressed K02941: RP-LP0, large subunit ribosomal protein LP0
5 Sobic.010G027100 expressed protein -
6 Sobic.008G007700 expressed protein -
7 Sobic.002G074800 - -
8 Sobic.009G252200 expressed protein K11644: paired amphipathic helix protein Sin3a
9 Sobic.002G180800 puromycin-sensitive aminopeptidase, putative, expressed K08776: puromycin-sensitive aminopeptidase
10 Sobic.006G193400 regulatory protein, putative, expressed -
11 Sobic.008G136700 expressed protein -
12 Sobic.009G008000 transcription factor Dp, putative, expressed -
13 Sobic.005G048500 serine esterase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G143900 transporter family protein, putative, expressed K08150: SLC2A13, MFS transporter, SP family, solute carrier family 2 (myo-inositol transporter), member 13
15 Sobic.004G228300 C2 domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G203150 - -
17 Sobic.010G114200 katanin p60 ATPase-containing subunit, putative, expressed -
18 Sobic.007G094700 - -
19 Sobic.007G219601 - -
20 Sobic.001G163666 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G065201 Sobic003G065201 Sobic001G539400 Sobic001G539400 Sobic003G065201--Sobic001G539400 Sobic008G050200 Sobic008G050200 Sobic003G065201--Sobic008G050200 Sobic006G204400 Sobic006G204400 Sobic003G065201--Sobic006G204400 Sobic009G229400 Sobic009G229400 Sobic003G065201--Sobic009G229400 Sobic010G027100 Sobic010G027100 Sobic003G065201--Sobic010G027100 Sobic008G007700 Sobic008G007700 Sobic003G065201--Sobic008G007700 Sobic002G074800 Sobic002G074800 Sobic003G065201--Sobic002G074800 Sobic009G252200 Sobic009G252200 Sobic003G065201--Sobic009G252200 Sobic002G180800 Sobic002G180800 Sobic003G065201--Sobic002G180800 Sobic008G054700 Sobic008G054700 Sobic001G539400--Sobic008G054700 Sobic001G539400--Sobic003G065201 Sobic001G539400--Sobic008G007700 Sobic003G358600 Sobic003G358600 Sobic001G539400--Sobic003G358600 Sobic005G174750 Sobic005G174750 Sobic001G539400--Sobic005G174750 Sobic006G193400 Sobic006G193400 Sobic001G539400--Sobic006G193400 Sobic009G178400 Sobic009G178400 Sobic001G539400--Sobic009G178400 Sobic001G539400--Sobic009G229400 Sobic001G387300 Sobic001G387300 Sobic001G539400--Sobic001G387300 Sobic008G050200--Sobic009G229400 Sobic005G202901 Sobic005G202901 Sobic008G050200--Sobic005G202901 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic008G050200--Sobic010G266600 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic008G050200--Sobic007G063800 Sobic006G143900 Sobic006G143900 Sobic008G050200--Sobic006G143900 Sobic004G014200 Sobic004G014200 Sobic008G050200--Sobic004G014200 Sobic002G192800 Sobic002G192800 Sobic008G050200--Sobic002G192800 Sobic008G050200--Sobic006G204400 Sobic010G114200 Sobic010G114200 Sobic008G050200--Sobic010G114200 Sobic001G106800 Sobic001G106800 Sobic006G204400--Sobic001G106800 Sobic006G001100 Sobic006G001100 Sobic006G204400--Sobic006G001100 Sobic007G176900 Sobic007G176900 Sobic006G204400--Sobic007G176900 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic006G204400--Sobic008G136601 Sobic006G097400 Sobic006G097400 Sobic006G204400--Sobic006G097400 Sobic002G111100 Sobic002G111100 Sobic006G204400--Sobic002G111100 Sobic001G163666 Sobic001G163666 Sobic006G204400--Sobic001G163666 Sobic008G103250 Sobic008G103250 Sobic006G204400--Sobic008G103250 Sobic001G241401 Sobic001G241401 Sobic006G204400--Sobic001G241401 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic009G229400--Sobic008G029800 Sobic009G229400--Sobic010G266600 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic009G229400--Sobic010G038300 Sobic009G229400--Sobic002G192800 Sobic009G229400--Sobic006G204400 Sobic008G071800 Sobic008G071800 Sobic009G229400--Sobic008G071800 Sobic009G229400--Sobic005G174750 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic009G229400--Sobic006G070032 Sobic002G060101 Sobic002G060101 Sobic009G229400--Sobic002G060101 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic010G027100--Sobic002G243400 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic010G027100--Sobic009G145000 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic010G027100--Sobic001G417700 Sobic010G058300 Sobic010G058300 Sobic010G027100--Sobic010G058300 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic010G027100--Sobic002G418300 Sobic009G002100 Sobic009G002100 Sobic010G027100--Sobic009G002100 Sobic010G027100--Sobic009G229400 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic010G027100--Sobic009G048700 Sobic010G027100--Sobic005G174750 Sobic008G007800 Sobic008G007800 Sobic008G007700--Sobic008G007800 Sobic004G064800 Sobic004G064800 Sobic008G007700--Sobic004G064800 Sobic008G007700--Sobic009G048700 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic008G007700--Sobic006G199500 Sobic003G218000 Sobic003G218000 Sobic008G007700--Sobic003G218000 Sobic010G198400 Sobic010G198400 Sobic008G007700--Sobic010G198400 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic008G007700--Sobic009G008000 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic008G007700--Sobic010G038000 Sobic008G007700--Sobic009G145000 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic002G074800--Sobic004G064200 Sobic002G074800--Sobic006G001100 Sobic002G074800--Sobic006G204400 Sobic002G074800--Sobic008G136601 Sobic002G074800--Sobic010G114200 Sobic002G074800--Sobic006G143900 Sobic004G228300 Sobic004G228300 Sobic002G074800--Sobic004G228300 Sobic005G048500 Sobic005G048500 Sobic002G074800--Sobic005G048500 Sobic008G136700 Sobic008G136700 Sobic002G074800--Sobic008G136700 Sobic004G107100 Sobic004G107100 Sobic009G252200--Sobic004G107100 Sobic001G384200 Sobic001G384200 Sobic009G252200--Sobic001G384200 Sobic009G252200--Sobic008G029800 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic009G252200--Sobic002G389600 Sobic002G176000 Sobic002G176000 Sobic009G252200--Sobic002G176000 Sobic009G252200--Sobic008G071800 Sobic009G252200--Sobic009G229400 Sobic009G252200--Sobic001G387300 Sobic008G078200 Sobic008G078200 Sobic009G252200--Sobic008G078200 Sobic002G180800--Sobic004G064200 Sobic006G080700 Sobic006G080700 Sobic002G180800--Sobic006G080700 Sobic002G180800--Sobic010G114200 Sobic008G054200 Sobic008G054200 Sobic002G180800--Sobic008G054200 Sobic002G180800--Sobic002G074800 Sobic009G007300 Sobic009G007300 Sobic002G180800--Sobic009G007300 Sobic003G014200 Sobic003G014200 Sobic002G180800--Sobic003G014200 Sobic002G103800 Sobic002G103800 Sobic002G180800--Sobic002G103800 Sobic003G024400 Sobic003G024400 Sobic002G180800--Sobic003G024400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.