Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G252200.2,Sobic.009G252200.1
Synonym SNL3, SIN3, Sb09g030290, ATSIN3
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PAG8 , A0A1B6PAF1
Pfam PF08295
Panther DB PTHR12346 PTHR12346:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology K11644; paired amphipathic helix protein Sin3a
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G24190 : SIN3-like 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g51110.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G107100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@CID11, putative, expressed -
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12 Sobic.002G060101 - -
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17 Sobic.001G223700 - -
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K12158: ubiquitin-like protein Nedd8
K04551: ubiquitin B
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20 Sobic.004G168200 ATPase, AAA family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G252200 Sobic009G252200 Sobic004G107100 Sobic004G107100 Sobic009G252200--Sobic004G107100 Sobic001G384200 Sobic001G384200 Sobic009G252200--Sobic001G384200 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic009G252200--Sobic008G029800 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic009G252200--Sobic002G389600 Sobic002G176000 Sobic002G176000 Sobic009G252200--Sobic002G176000 Sobic008G071800 Sobic008G071800 Sobic009G252200--Sobic008G071800 Sobic009G229400 Sobic009G229400 Sobic009G252200--Sobic009G229400 Sobic001G387300 Sobic001G387300 Sobic009G252200--Sobic001G387300 Sobic008G078200 Sobic008G078200 Sobic009G252200--Sobic008G078200 Sobic010G173300 Sobic010G173300 Sobic004G107100--Sobic010G173300 Sobic004G113600 Sobic004G113600 Sobic004G107100--Sobic004G113600 Sobic003G244400 Sobic003G244400 Sobic004G107100--Sobic003G244400 Sobic004G107100--Sobic001G384200 Sobic006G267100 Sobic006G267100 Sobic004G107100--Sobic006G267100 Sobic001G414650 Sobic001G414650 Sobic004G107100--Sobic001G414650 Sobic001G400000 Sobic001G400000 Sobic004G107100--Sobic001G400000 Sobic001G112600 Sobic001G112600 Sobic004G107100--Sobic001G112600 Sobic004G107100--Sobic001G387300 Sobic003G024100 Sobic003G024100 Sobic001G384200--Sobic003G024100 Sobic001G340800 Sobic001G340800 Sobic001G384200--Sobic001G340800 Sobic008G166100 Sobic008G166100 Sobic001G384200--Sobic008G166100 Sobic009G178400 Sobic009G178400 Sobic001G384200--Sobic009G178400 Sobic001G370400 Sobic001G370400 Sobic001G384200--Sobic001G370400 Sobic001G384200--Sobic003G244400 Sobic001G432200 Sobic001G432200 Sobic001G384200--Sobic001G432200 Sobic003G175350 Sobic003G175350 Sobic001G384200--Sobic003G175350 Sobic007G039200 Sobic007G039200 Sobic001G384200--Sobic007G039200 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic008G029800--Sobic009G060100 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic008G029800--Sobic006G070032 Sobic002G070100 Sobic002G070100 Sobic008G029800--Sobic002G070100 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic008G029800--Sobic006G017900 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic008G029800--Sobic007G082100 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic008G029800--Sobic004G046700 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic008G029800--Sobic001G211700 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic008G029800--Sobic010G123800 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic008G029800--Sobic006G017700 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic002G389600--Sobic008G136601 Sobic008G148600 Sobic008G148600 Sobic002G389600--Sobic008G148600 Sobic006G069766 Sobic006G069766 Sobic002G389600--Sobic006G069766 Sobic009G061500 Sobic009G061500 Sobic002G389600--Sobic009G061500 Sobic002G389600--Sobic001G340800 Sobic003G304600 Sobic003G304600 Sobic002G389600--Sobic003G304600 Sobic006G105100 Sobic006G105100 Sobic002G389600--Sobic006G105100 Sobic004G358000 Sobic004G358000 Sobic002G389600--Sobic004G358000 Sobic002G380300 Sobic002G380300 Sobic002G389600--Sobic002G380300 Sobic006G170500 Sobic006G170500 Sobic002G176000--Sobic006G170500 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic002G176000--Sobic006G224400 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic002G176000--Sobic007G081800 Sobic002G176000--Sobic004G046700 Sobic002G176000--Sobic010G123800 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic002G176000--Sobic005G058300 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic002G176000--Sobic009G182100 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic002G176000--Sobic007G110800 Sobic002G176000--Sobic006G017900 Sobic004G168200 Sobic004G168200 Sobic008G071800--Sobic004G168200 Sobic008G071800--Sobic007G081800 Sobic008G071800--Sobic004G046700 Sobic008G071800--Sobic005G058300 Sobic008G071800--Sobic010G123800 Sobic008G071800--Sobic007G082100 Sobic002G307400 Sobic002G307400 Sobic008G071800--Sobic002G307400 Sobic008G071800--Sobic001G211700 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic008G071800--Sobic002G384900 Sobic009G229400--Sobic008G029800 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic009G229400--Sobic010G266600 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic009G229400--Sobic010G038300 Sobic002G192800 Sobic002G192800 Sobic009G229400--Sobic002G192800 Sobic006G204400 Sobic006G204400 Sobic009G229400--Sobic006G204400 Sobic009G229400--Sobic008G071800 Sobic005G174750 Sobic005G174750 Sobic009G229400--Sobic005G174750 Sobic009G229400--Sobic006G070032 Sobic002G060101 Sobic002G060101 Sobic009G229400--Sobic002G060101 Sobic001G387300--Sobic001G384200 Sobic001G387300--Sobic009G178400 Sobic001G387300--Sobic008G166100 Sobic001G322400 Sobic001G322400 Sobic001G387300--Sobic001G322400 Sobic001G387300--Sobic004G113600 Sobic009G202000 Sobic009G202000 Sobic001G387300--Sobic009G202000 Sobic001G387300--Sobic003G244400 Sobic001G072000 Sobic001G072000 Sobic001G387300--Sobic001G072000 Sobic001G387300--Sobic001G432200 Sobic008G078200--Sobic005G058300 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic008G078200--Sobic007G167950 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic008G078200--Sobic005G087732 Sobic008G078200--Sobic007G081800 Sobic008G078200--Sobic010G123800 Sobic008G078200--Sobic004G046700 Sobic008G078200--Sobic007G110800 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic008G078200--Sobic004G086900 Sobic008G078200--Sobic006G224400
Octagon: transcription factors


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