Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G223700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QKC9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.001G223700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G070100 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.010G179600 - -
3 Sobic.005G140900 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.006G017700 expressed protein -
5 Sobic.008G036100 expressed protein -
6 Sobic.001G117100 - -
7 Sobic.002G384900 expressed protein -
8 Sobic.006G017900 DEFL55 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
9 Sobic.002G097300 OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
10 Sobic.001G211700 MBTB33 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
11 Sobic.008G138400 expressed protein -
12 Sobic.002G156400 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA, BR and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@MDR-like ABC transporter, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
13 Sobic.004G050900 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G182701 - -
15 Sobic.005G000900 OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G006200 - -
17 Sobic.005G148000 - -
18 Sobic.001G143700 cupin domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G189100 transcription factor Dp, putative, expressed -
20 Sobic.006G070032 - K01193: INV, beta-fructofuranosidase


Gene co-expression network
sample Sobic001G223700 Sobic001G223700 Sobic002G070100 Sobic002G070100 Sobic001G223700--Sobic002G070100 Sobic010G179600 Sobic010G179600 Sobic001G223700--Sobic010G179600 Sobic005G140900 Sobic005G140900 Sobic001G223700--Sobic005G140900 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic001G223700--Sobic006G017700 Sobic008G036100 Sobic008G036100 Sobic001G223700--Sobic008G036100 Sobic001G117100 Sobic001G117100 Sobic001G223700--Sobic001G117100 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic001G223700--Sobic002G384900 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic001G223700--Sobic006G017900 Sobic002G097300 Sobic002G097300 Sobic001G223700--Sobic002G097300 Sobic002G070100--Sobic006G017700 Sobic002G070100--Sobic002G384900 Sobic002G182701 Sobic002G182701 Sobic002G070100--Sobic002G182701 Sobic002G070100--Sobic006G017900 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic002G070100--Sobic005G000900 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic002G070100--Sobic001G211700 Sobic002G070100--Sobic005G140900 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic002G070100--Sobic002G156400 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic002G070100--Sobic008G138400 Sobic010G179600--Sobic001G117100 Sobic005G040100 Sobic005G040100 Sobic010G179600--Sobic005G040100 Sobic007G134501 Sobic007G134501 Sobic010G179600--Sobic007G134501 Sobic005G148000 Sobic005G148000 Sobic010G179600--Sobic005G148000 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic010G179600--Sobic002G194201 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic010G179600--Sobic003G007650 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic010G179600--Sobic007G122600 Sobic001G143700 Sobic001G143700 Sobic010G179600--Sobic001G143700 Sobic010G179600--Sobic008G036100 Sobic005G140900--Sobic008G138400 Sobic005G140900--Sobic002G156400 Sobic005G140900--Sobic002G097300 Sobic005G140900--Sobic008G036100 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic005G140900--Sobic005G189100 Sobic002G006200 Sobic002G006200 Sobic005G140900--Sobic002G006200 Sobic001G089300 Sobic001G089300 Sobic005G140900--Sobic001G089300 Sobic005G140900--Sobic001G143700 Sobic009G234900 Sobic009G234900 Sobic005G140900--Sobic009G234900 Sobic006G017700--Sobic002G182701 Sobic006G017700--Sobic006G017900 Sobic006G017700--Sobic001G211700 Sobic006G017700--Sobic002G384900 Sobic006G017700--Sobic005G000900 Sobic006G017700--Sobic005G140900 Sobic006G017700--Sobic002G156400 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic006G017700--Sobic009G182100 Sobic006G017700--Sobic008G138400 Sobic008G036100--Sobic005G140900 Sobic008G036100--Sobic008G138400 Sobic008G036100--Sobic002G097300 Sobic008G036100--Sobic002G156400 Sobic008G036100--Sobic002G006200 Sobic008G036100--Sobic001G143700 Sobic008G036100--Sobic005G189100 Sobic008G036100--Sobic005G148000 Sobic008G036100--Sobic001G089300 Sobic001G117100--Sobic002G097300 Sobic001G117100--Sobic008G138400 Sobic001G117100--Sobic005G140900 Sobic001G117100--Sobic002G006200 Sobic001G117100--Sobic001G143700 Sobic001G117100--Sobic005G148000 Sobic001G117100--Sobic005G189100 Sobic001G117100--Sobic002G156400 Sobic001G117100--Sobic001G089300 Sobic002G384900--Sobic006G017900 Sobic002G384900--Sobic006G017700 Sobic002G384900--Sobic002G182701 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic002G384900--Sobic004G100300 Sobic002G384900--Sobic001G211700 Sobic005G221675 Sobic005G221675 Sobic002G384900--Sobic005G221675 Sobic002G384900--Sobic005G000900 Sobic002G384900--Sobic002G156400 Sobic002G384900--Sobic009G182100 Sobic006G017900--Sobic001G211700 Sobic006G017900--Sobic006G017700 Sobic006G017900--Sobic002G182701 Sobic006G017900--Sobic002G384900 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic006G017900--Sobic004G046700 Sobic006G017900--Sobic005G000900 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic006G017900--Sobic010G123800 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic006G017900--Sobic007G082100 Sobic006G017900--Sobic004G100300 Sobic002G097300--Sobic008G138400 Sobic002G097300--Sobic002G006200 Sobic002G097300--Sobic001G143700 Sobic002G097300--Sobic005G140900 Sobic002G097300--Sobic005G189100 Sobic002G097300--Sobic002G156400 Sobic002G097300--Sobic005G148000 Sobic002G097300--Sobic001G089300 Sobic002G097300--Sobic008G036100
Octagon: transcription factors


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